Mikrobiyoloji bulteni最新文献

{"title":"[A Case of Presumptive Lophomonas Pneumonia in an Immunocompetent Man Presenting with Hemoptysis].","authors":"Nurbanu Yaşar, Yüksel Balci, Gözde Arslan, Esma Baş, Nuran Delialioğlu, Eylem Sercan Özgür","doi":"10.5578/mb.202503148","DOIUrl":"10.5578/mb.202503148","url":null,"abstract":"<p><p>Lophomonas blattarum, genellikle alt solunum yollarını enfekte eden ve bronkopulmoner enfeksiyonlara neden olan bir protozoondur. Klinik bulguları özgül olmamakla birlikte; öksürük, balgam, ateş, göğüs rahatsızlığı ve solunum sıkıntısı gibi semptomları içerebilir. Lophomonas enfeksiyonunun tanısı, solunum sekresyonlarından elde edilen örneklerin ışık mikroskobuyla incelenerek parazitin morfolojik olarak tespit edilmesine dayanmaktadır. Parazitin silyalı bronşiyal epitel hücrelerinden ayırt edilmesi zordur ve bu ayrım, doğru tanı için kritik öneme sahiptir. Bu olgu raporunda, bağışıklık sistemi sağlam yetişkin bir erkekte L.blattarum saptanan bir vaka sunulmuştur. Kırk altı yaşındaki erkek hasta, hemoptizi, efor dispnesi, halsizlik, gece terlemesi ve balgamlı öksürük şikayetiyle hastaneye başvurmuştur. Toraks bilgisayarlı tomografide sağ üst lobda 2 cm apse/kist, komşuluğunda konsolidasyon/atelektazi ve buzlu cam dansiteleri gözlemlenmiştir. Pnömoni ön tanısıyla ampirik tedavi başlanmıştır. Hemoptizi nedeniyle fiberoptik bronkoskopi yapılmıştır. Hastadan asidorezistan basil incelemesi, kültür ve doğrudan mikroskobik inceleme için balgam ve bronkoalveolar lavaj (BAL) sıvısı örnekleri alınmıştır. BAL örneğinin doğrudan mikroskobik incelemesi ve Giemsa boyasıyla L.blattarum'a morfolojik olarak benzer trofozoitler gözlenmiştir. Tanının doğrulanması amacıyla yapılan polimeraz zincir reaksiyon analizinde hedef parazite özgü güvenilir sonuç elde edilememiştir. Bu nedenle, mikroskobik bulgularla uyumlu olarak olası Lophomonas enfeksiyonu düşünülmüş ve diğer nonspesifik antibiyotik tedavileri kesilerek metronidazol başlanmıştır. Tedavi sonrası, klinik ve radyolojik bulgularında dramatik bir iyileşme gözlenen hasta, sağlığına kavuşarak taburcu edilmiştir. Bu vaka, bağışıklık sistemi sağlam bireylerde de Lophomonas enfeksiyonunun görülebileceğini ve bronkopulmoner enfeksiyonlarla karışabilen bir klinik tabloya yol açabileceğini göstermektedir. Tanıda mikroskobik değerlendirmenin önemini vurgulamakla birlikte, moleküler yöntemlerin standart hale getirilmesinin gerekliliğini de ortaya koymaktadır. Klinik pratikte ampirik antibiyotik tedavisine cevap vermeyen olgularda lophomoniasis olasılığı göz ardı edilmemeli ve her şüpheli vaka dikkatle değerlendirilmelidir.</p>","PeriodicalId":18509,"journal":{"name":"Mikrobiyoloji bulteni","volume":"59 3","pages":"413-423"},"PeriodicalIF":0.7,"publicationDate":"2025-07-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"144775700","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"医学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"[Investigation of ERG11 and MRR1 Resistance Genes in Candida parapsilosis Isolates].","authors":"Özge Kurt, Mert Ahmet Kuşkucu, Zeynep Yazgan, Neşe Arslan, Gökhan Aygün, Ömer Küçükbasmaci","doi":"10.5578/mb.202503136","DOIUrl":"https://doi.org/10.5578/mb.202503136","url":null,"abstract":"<p><p>Candida parapsilosis, özellikle kan kültürlerinden izole edilen önemli fungal patojenlerden biridir. Son yıllarda birçok bölgede merkezler arasında farklılıklar gösterse de kandidemi tedavisinde en sık tercih edilen flukonazole karşı direnç dikkat çekmektedir. Bu artış, enfeksiyon kontrolünü zorlaştırmakta ve tedaviyi olumsuz etkilemektedir. C.parapsilosis'te ERG11'de kodon 132 Y/F değişimi baskın mekanizma olarak kabul görmekte ve MRR1'de bazı amino asit değişimlerinin de dirence katkısı olabileceği bildirilmektedir. Bu çalışmada merkezimizde izole edilen C.parapsilosis sensu stricto'larda ERG11 ve MRR1 azol direnç mekanizmalarının aydınlatılması amaçlanmıştır. Kandidemi hastalarından elde edilen 2018 ve 2019 yıllarına ait 30 C.parapsilosis sensu stricto'nun sıvı mikrodilüsyon yöntemiyle flukonazole duyarlılıkları test edilmiş ve koloni polimeraz zincir reaksiyonu [polymerase chain reaction (PCR)] yaklaşımıyla amplifiye edilerek seçilen bölgelere DNA dizi analizi yapılmıştır. Analiz sonucunda ERG11'de bir duyarlı izolatta Y132F mutasyonu, dirençli izolatlarda Y132F, G307A, K143R mutasyonları; MRR1'de duyarlı izolatta R405K ve dirençli izolatlarda G927C mutasyonu tespit edilmiştir. ERG11'de saptanan R398I mutasyonu ise doza bağımlı duyarlı ve duyarlı izolatlarda tespit edilmiştir. Y132F mutasyonu primer mekanizma ve en sık bulunan mutasyon olmasına rağmen potansiyel mekanizmalar ihmal edilmemelidir. Çalışmada, dirençli izolatlarda tespit edilen G307A ve G927C mutasyonlarının, bazı örneklerde tek mutasyon olarak bulunduğu gözlemlenmiştir. Duyarlı izolatlarda ise R398I mutasyonu yalnız başına saptanmıştır. Bu mekanizmaların anlaşılmasına yönelik çalışmalar tedavi stratejilerinin doğru geliştirilmesine fayda sağlayacaktır.</p>","PeriodicalId":18509,"journal":{"name":"Mikrobiyoloji bulteni","volume":"59 3","pages":"376-385"},"PeriodicalIF":0.7,"publicationDate":"2025-07-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"144775705","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"医学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"[Investigation of the Presence of Mycobacterium tuberculosis Complex DNA in Stool by PCR Method in Patients with Pulmonary Tuberculosis].","authors":"Feyza Nur Ariman, Deniz Gazel, Füsun Fakili, Tekin Karsligil","doi":"10.5578/mb.202503158","DOIUrl":"https://doi.org/10.5578/mb.202503158","url":null,"abstract":"<p><p>Balgam, akciğer tüberkülozu tanısında en sık kullanılan örnektir. Ancak ileri yaştaki hastalar, insan immün yetmezlik virüsü [human immunodeficiency virus (HIV)] pozitif, immünsupresif veya nörolojik defisiti olan hastalar ve çocuklar balgam üretebilse bile rahatlıkla balgam çıkaramamaktadır. Balgam çıkaramayan hasta gruplarında invaziv yöntemlerle farklı örnekler alınabilse de bu durum hasta için hem travmatik hem de maliyetlidir. Dünya Sağlık Örgütü tarafından 2022 yılından beri çocuk ve adölesanlarda dışkı örneğinin, Xpert MTB/RIF Ultra ile polimeraz zincir reaksiyon [polymerase chain reaction (PCR)] yöntemiyle çalışılarak akciğer tüberkülozunda tanısal bir örnek olarak kullanılması önerilmektedir. Bu çalışmada, erişkin hastalarda dışkı örneğinin akciğer tüberkülozu tanısında kullanım potansiyelinin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Gaziantep Üniversitesi Şahinbey Araştırma ve Uygulama Hastanesi Göğüs Hastalıkları Polikliniğine başvuran tüberküloz ön tanılı 17 hasta ve tüberküloz semptomları bulunmayan kontrol grubu olarak 20 gönüllü çalışmaya dahil edilmiştir. Hasta ve gönüllülerin balgam ve dışkı örnekleri toplanmıştır. Balgam örnekleri aside dirençli basil boyama (ARB) mikroskopi, kültür ve Xpert MTB/ RIF Ultra ile değerlendirilmiş, dışkı örnekleri ise sadece Xpert MTB/RIF Ultra ile değerlendirilmiştir. Kontrol grubunun ARB mikroskopi, balgam kültürü, balgam ve dışkı örneği PCR sonuçlarının tamamı negatif olarak saptanmıştır. Hasta grubunun tamamında balgam PCR sonucu pozitif bulunmuştur. Hastaların %47 (n= 8)'sinin balgam ARB mikroskopi sonucu pozitif, tamamının ise balgam kültür sonucu pozitif olarak değerlendirilmiştir. Hastaların %94 (n= 16)'ünün dışkı örneklerinde PCR sonucu pozitif saptanmıştır. Bir hastanın balgam PCR ve kültür sonuçları pozitif olmasına rağmen dışkı örneklerinde PCR sonucu negatif saptanmıştır. Balgam kültür sonucu referans olarak kabul edildiğinde dışkı örneklerinde PCR testinin duyarlılığı %94.1, özgüllüğü %100, pozitif prediktif değer %100 ve negatif prediktif değer %95.2 olarak saptanmıştır. Çalışmada elde edilen verilere göre dışkı; balgam örneği veremeyen veya yeterli balgam üretimi olmayan ileri yaştaki hastalar, HIV pozitif, immünsupresif veya nörolojik defisiti olan hastalarda, akciğer tüberkülozunun tanısı için alternatif bir örnek olabilir.</p>","PeriodicalId":18509,"journal":{"name":"Mikrobiyoloji bulteni","volume":"59 3","pages":"257-268"},"PeriodicalIF":0.7,"publicationDate":"2025-07-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"144775795","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"医学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"[An Innovative Combination in the Combat Against Trypanosoma cruzi: The Synergistic Effect of Benznidazole and Essential Oil Components].","authors":"Yener Özel, İbrahim Çavuş, Umut Yilmaz, Mehmet Ünlü","doi":"10.5578/mb.20250312","DOIUrl":"https://doi.org/10.5578/mb.20250312","url":null,"abstract":"&lt;p&gt;&lt;p&gt;Chagas hastalığı, protozoan bir parazit olan Trypanosoma cruzi'nin neden olduğu bulaşıcı bir hastalık olup ihmal edilen tropikal hastalıkların başında gelmektedir. Dünya çapında yaklaşık 6-7 milyon insanın T.cruzi ile enfekte olduğu ve her yıl yaklaşık 12000 kişinin bu hastalık nedeniyle öldüğü tahmin edilmektedir. Chagas hastalığı, ülkemizde hastalığı taşıyan vektörlerin bulunmaması nedeniyle doğal yolla bulaşmamaktadır. Ancak endemik bölgelere yapılan turistik veya ticari seyahatlerle bu bölgelerden ülkemize gerçekleşen göç hareketleri, hastalığın ülkemizde görülme olasılığını artırmaktadır. T.cruzi'nin neden olduğu Chagas hastalığının tedavisinde benznidazol (BENZ) ve nifurtimoks olmak üzere sadece iki ilaç kullanılmaktadır. Bu ilaçların, sadece akut veya erken enfeksiyon evrelerinde etkili olmaları, kullanımları sırasında yan etkilerinin olması ve parazitin bu ilaçların etkinliğine karşı direnç geliştirmesi gibi bazı dezavantajları bulunmaktadır. Bu nedenle, Chagas hastalığını tedavi etmek için yeni, güvenli ve etkili tedavi alternatiflerinin belirlenmesi gerekmektedir. Bu çalışmada, alfa-pinen, isoborneol, karvakrol, kumarin ve öjenol gibi uçucu yağ bileşenleri (UYB)'nin T.cruzi'ye karşı etkinliği, sitotoksisitesi ve BENZ ile kombinasyonunun araştırılması amaçlanmıştır. Bu çalışmada, T.cruzi ATCC 50825 referans suşu kullanılmıştır. Referans ilaç olarak BENZ; UYB olarak ise alfa-pinen, isoborneol, karvakrol, kumarin ve öjenol seçilmiştir. Sitotoksik aktivite çalışmalarında L929 fare fibroblast hücre hattı kullanılmıştır. Antitripanozomal ve sitotoksik aktivite çalışmaları sıvı mikrodilüsyon yöntemiyle, benznidazol ve UYB'ler arasındaki etkileşimler ise dama tahtası (checkerboard) yöntemiyle belirlenmiştir. UYB'lerin ve BENZ'in fibroblast hücrelerine karşı sitotoksik etkinliklerini ifade eden IC50 değerleri 24, 48 ve 72. saatlerde, sırasıyla, alfa-pinen için 26.68- 20.79 µg/mL, isoborneol için 128.7-73.63 µg/mL, karvakrol için 4.56-2.49 µg/mL, kumarin için 169.3- 108.6 µg/mL, öjenol için 6.04-1.65 µg/mL ve BENZ için ise 1011-806.9 µg/mL aralığında saptanmıştır. UYB'lerin ve BENZ'in antitripanozomal aktivitelerini ifade eden IC50 değerleri 48. saatte aynı sırayla, 11.8 µg/mL, 114.6 µg/mL, 3.9 µg/mL, 268.6 µg/mL, 19.5 µg/mL ve 11.7 µg/mL olarak tespit edilmiştir. En etkili UYB'nin karvakrol, alfa-pinen ve öjenol olduğu ve özellikle karvakrol ve alfa-pinenin referans ilaç BENZ ile kıyaslanabilir olduğu saptanmıştır. Selektif indeks (SI) değerleri hesaplandığında BENZ ve alfapinenin seçici etkinliğinin yüksek (SI &gt; 1), diğer UYB'lerin ise seçici etkinliğinin düşük olduğu gözlenmiştir (SI&lt; 1). Buna karşılık UYB'ler ile BENZ kombinasyonlarının tamamında sinerjik etkileşimler tespit edilmiştir. T.cruzi'de görülen ilaç direncinin mekanizması henüz anlaşılmış değildir. Çoklu biyolojik etkilere sahip doğal bileşikler, yeni ilaç formülasyonları ve yeni kombinasyonlar, ilaç direncinin üstesinden gelme çabalarına destek olabilir. Bu stratejiler içind","PeriodicalId":18509,"journal":{"name":"Mikrobiyoloji bulteni","volume":"59 3","pages":"386-403"},"PeriodicalIF":0.7,"publicationDate":"2025-07-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"144775701","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"医学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"[Evaluation of Anti-Endomysial Antibodies Using Monkey Esophagus and Liver Specimens in Celiac Disease Patients: Diagnostic Performance of IgA Detection Tests].","authors":"Mehmet Soylu, Seyfi Durmaz, Melike Yaşar Duman, Murat Sezak, Miray Karakoyun, Merter Yiğit, Nalan Gülşen Ünal","doi":"10.5578/mb.202503154","DOIUrl":"https://doi.org/10.5578/mb.202503154","url":null,"abstract":"<p><p>Bu çalışmada, çölyak hastalığı (ÇH)'nın tanısında kullanılan anti-endomisyum (EMA) IgA antikorlarının saptanmasında maymun özofagus (MÖ) ve maymun karaciğer (MK) preparatlarının tanısal performanslarının karşılaştırılması ve anti-doku transglutaminaz (anti-TTG) IgA ile anti-deamin gliyadin peptit (GAF3X) IgA düzeyleriyle ilişkisinin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Metodolojik ve kesitsel tasarımlı bu çalışmaya, selektif IgA eksikliği olmayan, ÇH ön tanılı 123 hasta dahil edilmiştir. EMA IgA testleri, MÖ ve MK preparatları kullanılarak indirekt immün floresan mikroskopisi (IIF) yöntemiyle değerlendirilmiştir. Serolojik testler (anti-TTG IgA ve GAF3X IgA) ELISA yöntemiyle analiz edilmiş, bağırsak biyopsisi sonuçları Marsh sınıflamasına göre kategorize edilmiştir. Testlerin tanısal performansı; duyarlılık, özgüllük, pozitif ve negatif prediktif değerler kullanılarak değerlendirilmiştir. Gruplar arasındaki farklar istatistiksel analizlerle incelenmiştir. Anti-TTG IgA pozitifliği saptanan 90 vakanın %96.67'si MK, %88.89'u ise MÖ testlerinde pozitif olarak değerlendirilmiştir. MÖ ve MK testleri arasında yüksek düzeyde bir uyum bulunmuş (Kappa= 0.692, p< 0.001), her iki preparatın da EMA IgA pozitifliğini saptamada benzer etkinliğe sahip olduğu gösterilmiştir. Ayrıca, Marsh skoru pozitifliği ile serolojik test sonuçları arasında güçlü bir ilişki saptanmıştır. MK testinin duyarlılığı %100, özgüllüğü %50, pozitif prediktif değeri %86 ve negatif prediktif değeri %100 olarak hesaplanmıştır. MÖ testi için ise duyarlılık %97.7, özgüllük %64.3, pozitif prediktif değeri %89.4 ve negatif prediktif değeri %90 bulunmuştur. Çocuk ve yetişkin grupları arasında kantitatif test sonuçlarında anlamlı farklılıklar gözlenmiştir (MK: p= 0.006; MÖ: p= 0.048). Ancak Marsh skoru pozitifliği üzerinde yaşın (p= 0.268) ve cinsiyetin (p= 0.775) etkisi istatistiksel olarak anlamlı bulunmamıştır. \"Correspondence\" analizi, MÖ ve MK kategorileri arasında istatistiksel olarak anlamlı bir ilişki göstermiştir (p< 0.001) ve pozitif kategorilerde yüksek düzeyde bir korelasyon tespit edilmiştir. Anti-TTG IgA testi için yapılan alıcı işletim karakteristiği analizi sonucunda eğri altındaki alan değeri 0.822 olarak hesaplanmış, bu değer testin Marsh skoru pozitifliği ile negatifliğini ayırt etme kapasitesinin oldukça iyi olduğunu ortaya koymuştur. Optimal kesme noktası olarak belirlenen 223.84 RU/mL'de testin duyarlılığı %60.5, özgüllüğü ise %100 olarak bulunmuş, bu değer yüksek özgüllük ve biyopsi gerekliliğini azaltma potansiyeli açısından önem arz etmiştir. Sonuçlar, EMA IgA ve diğer serolojik testlerin ÇH tanısında yüksek tanısal değer sunduğunu desteklemiştir. EMA IgA testlerinin MÖ ve MK preparatları ile kullanımı, ÇH tanısında etkili bir serolojik yöntem olarak değerlendirilmiştir. MK preparatları, MÖ preparatlarına kıyasla daha yüksek duyarlılık sergilemiş ancak özgüllük açısından sınırlı bulunmuştur. Anti-TTG IgA testinin Marsh skoru pozitifliği ile ilişkisinde belirlenen opti","PeriodicalId":18509,"journal":{"name":"Mikrobiyoloji bulteni","volume":"59 3","pages":"338-351"},"PeriodicalIF":0.7,"publicationDate":"2025-07-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"144775703","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"医学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"[Successful Treatment of Two Cases of Plasmodium falciparum Malaria that Developed Recrudescence after Artemether-Lumefantrine Therapy].","authors":"Mustafa Arslan, Umut Berberoğlu","doi":"10.5578/mb.2025037","DOIUrl":"10.5578/mb.2025037","url":null,"abstract":"<p><p>Endemik bölgelerden dönen sıtma hastalarında artemisinin bazlı kombinasyon tedavisi (AKT)'nin başarısızlığını bildiren raporlar giderek artmaktadır. AKT, dünya çapında Plasmodium falciparum sıtmasına karşı birinci basamak tedavi olarak kullanılmaktadır. Ancak P.falciparum'un artemisinine dirençli suşlarının ortaya çıkması ve Güneydoğu Asya'ya yayılmasıyla birlikte, bu dirençli suşların Afrika'daki ve diğer yerlerdeki yüksek sıtma insidansının olduğu bölgelere ulaşma riski vardır. Bu olgu raporunda, ilk tedavileri altı doz artemeter-lumefantrin (AL) kullanılarak yapılan, Afrika'dan importe iki sıtma olgusu sunulmuştur. Gabon ve Uganda'dan dönen iki orta yaşlı erkekte, Türkiye'de sıtma semptomları gelişmiş ve hastanede yatarak P.falciparum sıtması teşhisi konmuştur. Her iki hasta da AL ile tedavi edilmiştir. Belirgin iyileşme göstererek hastaneden taburcu edildikten sonra, bu kişiler yüksek ateş ve titreme şikayetleriyle tekrar hastaneye başvurmuştur ve geç klinik başarısızlık belirtileri göstermişlerdir. Hastalardan biri tekrar altı doz AL tedavisi ile, diğeri ise AKT dışı anti-malaryal (kinin ve doksisiklin) tedaviden sonra parazitlerden tamamen temizlenmiş ve rekrüdesens gelişmemiştir. Artemisinin bazlı kombinasyonlardan olan AL Türkiye'de de görülen sıtma olgularının tedavisi için sık tercih edilen bir preparattır. Üç günlük uygun AL tedavisinden sonra periferik kan yaymasında paraziteminin temizlendiği tespit edilmiş olsa bile, hastalarda tedavi başarısızlığı görülebileceği ve bu tedavi başarısızlığının Afrika kaynaklı P.falciparum sıtması olgularını da kapsayabileceği akılda tutulmalıdır.</p>","PeriodicalId":18509,"journal":{"name":"Mikrobiyoloji bulteni","volume":"59 3","pages":"404-412"},"PeriodicalIF":0.7,"publicationDate":"2025-07-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"144775798","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"医学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"[The Relationship Between HIF-1α, MMP-9, and IL-8 Levels and the Development of Diabetic Foot Ulcers].","authors":"Nurdan Pür, Fatma Kesmez Can, Nurinnisa Öztürk, Kamber Kaşali, Basri Pür","doi":"10.5578/mb.20250315","DOIUrl":"https://doi.org/10.5578/mb.20250315","url":null,"abstract":"<p><p>Diyabetik ayak ülseri (DAÜ), diyabet hastalarında yüksek morbidite ve mortalite oranlarına yol açan ciddi bir komplikasyondur. DAÜ'nün erken teşhisi, hastaların yaşam kalitesini artırmak ve sağlık sistemine olan yükü azaltmak için kritik öneme sahiptir. Bu çalışmanın amacı, DAÜ gelişimini erken evrede öngörebilecek biyobelirteçleri belirlemek ve bu belirteçlerin klinik uygulamalardaki potansiyelini değerlendirmektir. Çalışmaya üç grup dahil edilmiştir: DAÜ tanısı olan diyabetik hastalar, DAÜ bulunmayan diyabet hastaları ve sağlıklı bireyler. Her bir gruba 30 hasta dahil edilmiştir ve toplamda 90 hasta üzerinden değerlendirme yapılmıştır. Katılımcılardan alınan kan örneklerinde serum hipoksiyle indüklenebilir faktör 1 alfa (HIF-1α), matriks metalloproteinaz-9 (MMP-9) ve IL-8 seviyeleri ölçülmüş ve C-reaktif protein, eritrosit sedimantasyon hızı (ESH) ve prokalsitonin gibi akut faz reaktanları ile karşılaştırılmıştır. Biyobelirteçlerin tanısal değerlerini saptamak için alıcı işletim karakteristiği [receiver operating characteristic (ROC)] analizi yapılmıştır. HIF-1α seviyelerinin DAÜ hastalarında anlamlı şekilde yüksek olduğu tespit edilmiştir ve ROC analizi sonuçları, bu biyobelirtecin tanısal hassasiyet ve özgüllük açısından en başarılı belirteç olduğunu göstermiştir {Eğri altı alan [area under the curve (AUC)]= 0.99, p= 0.001}. HIF-1α seviyelerindeki artış, hipoksik yanıtın erken evrelerinde aktif olduğunu ancak ileri evrelerde düştüğünü göstermektedir. MMP-9 seviyelerinin Wagner evreleri ile orantılı olarak artış gösterdiği ve ESH ile pozitif korelasyon içinde olduğu gözlenmiştir. Bu sonuçlar MMP-9'un, kronik enflamasyon ve doku hasarındaki rolünü desteklemektedir. IL-8 seviyeleri DAÜ hastalarında anlamlı şekilde yüksek bulunmuş ancak diğer enflamatuvar belirteçlerle ilişkisiz olması, daha spesifik bir rol oynayabileceğini düşündürmüştür. HIF-1α, hipoksiye bağlı doku onarımı ve anjiyogenez süreçlerinde merkezi bir role sahip olması nedeniyle DAÜ'nün erken teşhisinde etkili bir biyobelirteç olarak öne çıkmaktadır. Özellikle yüksek özgüllük ve hassasiyeti (AUC= 0.99) sayesinde, rutin klinik takibe uygun bir belirteç olarak değerlendirilmelidir. MMP-9'un kronik enflamasyon ve doku yıkımındaki rolü, bu biyobelirtecin doku hasarını önlemeye yönelik tedavilere katkı sağlayabileceğini göstermektedir. Benzer şekilde, IL-8'in spesifik enflamatuvar süreçlerdeki rolü, nötrofil modülasyonunu hedefleyen yeni terapötik yaklaşımlara yol açabilir. HIF-1α, MMP-9 ve IL-8'in düzenli takibi, DAÜ'nün erken teşhisi ve önlenmesine olanak sağlayabilir. Ayrıca, bu biyobelirteçlerin tedavi planlamasında kullanılabilirliği hem hasta yaşam kalitesini artıracak hem de sağlık sistemi üzerindeki ekonomik yükü azaltacaktır. Gelecekte yapılacak prospektif çalışmaların, bu biyobelirteçlerin klinik uygulamalarda yaygın olarak kullanılmasını destekleyecek daha somut kanıtlar sağlaması mümkündür.</p>","PeriodicalId":18509,"journal":{"name":"Mikrobiyoloji bulteni","volume":"59 3","pages":"352-366"},"PeriodicalIF":0.7,"publicationDate":"2025-07-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"144775799","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"医学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"[Are Ureaplasma Species Being Disregarded in Urinary Tract Infections?]","authors":"Rukiye Berkem, Tuğçe Özyol Atkaya","doi":"10.5578/mb.20250326","DOIUrl":"https://doi.org/10.5578/mb.20250326","url":null,"abstract":"<p><p>Ureaplasma parvum ve Ureaplasma urealyticum, üriner ve genital sistemde kolonize olabilmekte ve çeşitli enfeksiyonlara neden olmaktadır. Bu etkenler, zor üreme özellikleri nedeniyle rutin laboratuvar tanı yöntemleriyle tanımlanamamaktadır. Bu nedenle toplumdaki insidansı, direnç özellikleri ve klinikte neden oldukları enfeksiyonlarla ilgili daha ayrıntılı çalışmalara ihtiyaç duyulmaktadır. Bu çalışmada üriner sistem enfeksiyonu şüphesi olan hastalarda üreaplazmaların varlığının gösterilmesi amaçlanmıştır. Hedefleri arasında U.urealyticum ve U.parvum olan ticari gerçek zamanlı kantitatif polimeraz zincir reaksiyon [real-time quantitative polymerase chain reaction (Rt-qPCR)] panel kiti kullanılmış ve PCR sonuçlarının doğruluğu sekans analiziyle gösterilmiştir. Üriner sistem enfeksiyonu şüphesiyle laboratuvara gönderilen 603 orta akım idrar örneği, idrar yolu enfeksiyonları qPCR panel kiti (Bioeksen, Türkiye) ile çalışılmıştır. U.urealyticum ve/veya U.parvum pozitif bulunan 195 örneğin, örnek miktarı yeterli olan 130 adedine, -20 °C'de saklanmalarının ardından MinION™ (Oxford Nanopore Technologies®, Birleşik Krallık) sisteminde rapid barcoding kit (SQK-RBK110.96) (Oxford Nanopore Technologies®, Birleşik Krallık) ile üretici firma önerilerine uygun olarak yeni nesil dizileme [next generation sequencing (NGS)] analizi yapılmıştır. qPCR ile pozitif bulunan 195 (%32.33) örneğin; 138 (%70.76)'inde U.parvum, 46 (%23.58)'sında U.urealyticum, 11 (%5.64)'inde U.urealyticum ve U.parvum birlikte bulunmuştur. qPCR pozitifliği bulunan 195 örneğin; örnek miktarı yeterli olan 130'una NGS ile sekans analizi çalışılmıştır. Bu 130 örneğin 17'sinde elektroforezde pozitif bant (amplifikasyon ürünü) ve beş örnekte yeterli sekans (< 10 coverage) verisi elde edilememiştir. Dolayısıyla 22 örnekte sekans analiz sonucu elde edilememiş, 108 örnekte ise elde edilmiştir. Yüz sekiz örneğin; 102 (%94.44)'sinde qPCR ve NGS sonuçları uyumlu, altısında (%5.56) ise uyumsuz bulunmuştur. Uyumsuz altı örneğin biri qPCR ile U.urealyticum olarak tanımlanırken, sekans analizinde U.parvum olarak tanımlanmış, diğer beş örnekte qPCR'de birlikte bulunan U.urealyticum ve U.parvum'dan sadece biri NGS ile gösterilebilmiş diğeri gösterilememiştir; beş örneğin üçünde sekans analiziyle sadece U.parvum, ikisinde ise sadece U.urealyticum gösterilebilmiştir. Çalışmada orta akım idrar örneklerinde %32.33 oranında U.parvum ve/veya U.urealyticum pozitifliği bulunmuştur. Bu çalışmada, yüksek pozitiflik oranları nedeniyle bu mikroorganizmaların olası bir üriner sistem enfeksiyonu etkeni olabileceğine ve göz ardı edilmemeleri gerektiğine dikkat çekilmek istenmiştir.</p>","PeriodicalId":18509,"journal":{"name":"Mikrobiyoloji bulteni","volume":"59 3","pages":"292-306"},"PeriodicalIF":0.7,"publicationDate":"2025-07-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"144775702","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"医学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"[Investigation of Cryptococcus neoformans Mating Capability in Peloidotherapy Muds].","authors":"Mustafa Şengül, Aylin Döğen, Sedef Zeliha Öner, Gülin Fındıkoğlu Ergin, Çağrı Ergin, Macit İlkit","doi":"10.5578/mb.202503156","DOIUrl":"https://doi.org/10.5578/mb.202503156","url":null,"abstract":"<p><p>İnsan patojeni Cryptococcus neoformans; kuş dışkısı, toprak, ağaçlar ve çürümüş odun gibi çeşitli çevresel kaynaklardan izole edilmiştir. Mayanın kendi biyolojik özelliklerine ek olarak, kolonize olabileceği çevresel yapı ve özellikler, kolonizasyon sürecinde önemli rol oynar. Peloidoterapi, Ege Bölgesi'nde (Denizli, Türkiye yakınları) çok sayıda hastalığın ve kas-iskelet sistemi rahatsızlığının yönetiminde tedavi veya destekleyici yöntem olarak eski zamanlardan beri kullanılmaktadır. Peloidoterapi, hastanın havuzlara girmesi veya kurutulmuş çamurun yeniden sulandırılması ve ardından doğrudan vücuda uygulanmasıyla gerçekleştirilir. Organik içerik belirgin şekilde düşüktür. Ayrıca, ticari olarak paketlenmiş peloidoterapi çamurları, işlemden önce yüksek sıcaklıklarla işlenir ve bu da fizikokimyasal bileşimde değişikliklere neden olur. Çevresel kriptokokal kolonizasyonda organik içerik zayıf olsa bile eşeyli üreme meydana gelebilir ancak peloidler üzerinde oluşabileceğine dair henüz yeterli veri yoktur. Çalışmada, ülkemizde peloidoterapi uygulamasında kullanılan ve organik içerik bakımından zayıf çamurlarda C.neoformans'ın eşeyli üremesinin araştırılması amaçlanmıştır. Bu çalışmada, Denizli Havzası'nda bulunan üç aktif kaynaktan (Sarayköy, Gölemezli, Karahayıt) alınan ticari olarak paketlenmiş peloid örnekleri (1 g/L distile suda filtrelenmiş) ve farklı pH değerlerinde, sadece 3 g/L CaCO3 ve 1 g/L agar ilave edilerek besiyeri hazırlanmasında kullanılmıştır. Bu ortamlarda eşeyli üreme yeteneklerini doğrulamak için C.neoformans KN99 Aa ve C.neoformans KN99 Aα referans suşları test edilmiştir. Bir ay boyunca besiyerleri; filamentler, hifler, menteşe bağlantıları, bazidia ve bazidiyosporların varlığı açısından periyodik olarak incelenmiştir. Sonuç olarak, üç örnekten ikisinde eşeyli yapıların varlığı gösterilmiştir. Bu bulgular, düşük organik içeriklerine rağmen yeniden kullanılabilir ve ticari olarak temin edilebilen peloidlerin, özellikle immünsupresyon varlığında, C.neoformans için uygun olduğunu göstermektedir. Ayrıca, peloidlerin düşük organik içeriği ve bölgeler arasında yapılarında farklı minerallerin bulunması, C.neoformans gibi önemli insan patojenlerinin doğal döngüsünü etkileyen faktörleri araştırmak için uygun bir ortam sağlamaktadır.</p>","PeriodicalId":18509,"journal":{"name":"Mikrobiyoloji bulteni","volume":"59 3","pages":"367-375"},"PeriodicalIF":0.7,"publicationDate":"2025-07-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"144775704","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"医学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"[Investigation of the Antimicrobial Effects of Long-Term Used Drugs and In Vitro Interaction with Antimicrobial Agents].","authors":"Alparslan Semih Salan, Suzan Ökten","doi":"10.5578/mb.202503165","DOIUrl":"https://doi.org/10.5578/mb.202503165","url":null,"abstract":"&lt;p&gt;&lt;p&gt;Kronik hastalığı olan kişilerin, düzenli ve uzun süreli ilaç kullanması gereklidir. Bu ilaçlarla birlikte zaman zaman antimikrobiyal ajanlar da kullanılmaktadır. Bu çalışmada, kronik hastalıklarda uzun süreli ve sıklıkla kullanılan bazı ilaçların antimikrobiyal etkilerinin ve diğer antimikrobiyal ajanlarla etkileşimlerinin araştırılması amaçlanmıştır. Bu ilaçlar statin grubu ilaçlardan atorvastatin ve rosuvastatin; beta bloker ilaç grubundan metoprolol ve propranolol; proton pompası inhibitörü ilaç grubundan lansoprazol ve esomeprazol olarak belirlenmiştir. Bu çalışmada, ana bilim dalından temin edilen standart mikroorganizmalar ve ana bilim dalı kültür koleksiyonunda yer alan dirençli izolatlar kullanılmıştır. İlaçların antimikrobiyal etkisi mikrodilüsyon yöntemiyle saptanmıştır. İlaçların antibiyotiklerle ve birbirleriyle kombine kullanımıyla oluşan antimikrobiyal etki ise dama tahtası yöntemiyle belirlenmiştir. Bu çalışmada, ilaçların antibiyotiklerle birlikte kullanıldığında, bu antibiyotiklerin izolatlara (Staphylococcus aureus/ampisilin, Enterococcus faecalis/vankomisin, Escherichia coli/siprofloksasin, Klebsiella pneumoniae/imipenem, Acinetobacter baumannii/meropenem, Pseudomonas aeruginosa/gentamisin) etki eden minimum inhibitör konsantrasyon (MİK) değerlerini düşürdüğü tespit edilmiştir. Atorvastatin ve rosuvastatin varlığında dirençli S.aureus, E.faecalis, A.baumannii ve K.pneumoniae izolatlarına karşı antibiyotiklerin MİK değerlerinde dört kat ve daha fazla; dirençli P.aeruginosa izolatlarına karşı gentamisinin MİK değerinde 2-64 kat, siprofloksasine dirençli E.coli izolatlarında da siprofloksasinin MİK değerlerinde sırasıyla sekiz ve iki kat azalma tespit edilmiştir. Propranolol varlığında ise dirençli E.faecalis ve K.pneumoniae izolatlarında MİK değerlerinde 64 kat, dirençli S.aureus izolatları üzerine ampisilinin MİK değerlerinde 2-64 kat, dirençli P.aeruginosa ve A.baumannii izolatları üzerine antibiyotiklerin MİK değerlerinde sırasıyla 4-64 ve 2-64 kat, dirençli E.coli izolatları üzerine siprofloksasinin MİK değerlerinde ise 2-4 kat azalma tespit edilmiştir. Gentamisinin, meropenemin ve imipenemin, metoprolol ile birlikte kullanımı sonucu dirençli P.aeruginosa, A.baumannii ve E.faecalis izolatları üzerine antibiyotiklerin MİK değerlerinde 64 kat; dirençli S.aureus, K.pneumoniae izolatları üzerine ampisilin, imipenem MİK değerlerinde sırasıyla 2-64 ve 32-64 kat azalma tespit edilmesine rağmen dirençli E.coli izolatları üzerine siprofloksasinin metoprololle kombine kullanımı sonucu MİK değerinde iki kat azalma tespit edilmiştir. Antibiyotiklerin lansoprazol ve esomeprazol ile birlikte kullanımı sonucu dirençli A.baumannii izolatları üzerine meropenemin MİK değerinde sırasıyla 32-64 ve 2-64 kat, dirençli S.aureus izolatları üzerine ampisilinin MİK değerinde sırasıyla 2-64 ve 32-64 kat, dirençli K.pneumoniae izolatları üzerine imipenemin MİK değerinde 2-64 kat, dirençli E.coli izolatları üzerine siprofloksasinin MİK değerinde sı","PeriodicalId":18509,"journal":{"name":"Mikrobiyoloji bulteni","volume":"59 3","pages":"269-291"},"PeriodicalIF":0.7,"publicationDate":"2025-07-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"144775794","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"医学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}