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Evaluation of Nature Inspired Metaheuristics for Search and Reconnaissance Operations by Rotary-wing Aircrafts 旋翼飞机搜索侦察任务的自然启发元启发式评价
Anais do Brazilian e-Science Workshop (BreSci) Pub Date : 2020-02-18 DOI: 10.34117/bjdv5n8-044
André M. Yokoyama, A. Mury, B. Schulze, Mariza Ferro
{"title":"Evaluation of Nature Inspired Metaheuristics for Search and Reconnaissance Operations by Rotary-wing Aircrafts","authors":"André M. Yokoyama, A. Mury, B. Schulze, Mariza Ferro","doi":"10.34117/bjdv5n8-044","DOIUrl":"https://doi.org/10.34117/bjdv5n8-044","url":null,"abstract":"The main objective of this work is the evaluation of two nature inspired meta-heuristics, Genetic Algorithms and Ant Colony, for the development of an application that can generate optimized routes for aircraft, attending the requirements of the Brazilian Navy. This work presents the methods developed, complying with two main constraints: checkpoints mobility and limited aircraft autonomy. It also presents the results of tests performed with the methods developed and an evaluation of their performances.","PeriodicalId":306675,"journal":{"name":"Anais do Brazilian e-Science Workshop (BreSci)","volume":"29 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2020-02-18","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"131990897","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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CrossFlow: Interpolando Dados Pluviométricos com Apoio de Validação Cruzada em Workflows Científicos 交叉流:插值降雨数据，支持科学工作流程中的交叉验证
Anais do Brazilian e-Science Workshop (BreSci) Pub Date : 2020-02-18 DOI: 10.5753/bresci.2017.9917
Ulisses Tomaz, E. Santos, G. B. Lyra, Sérgio Manuel Serra da Cruz
{"title":"CrossFlow: Interpolando Dados Pluviométricos com Apoio de Validação Cruzada em Workflows Científicos","authors":"Ulisses Tomaz, E. Santos, G. B. Lyra, Sérgio Manuel Serra da Cruz","doi":"10.5753/bresci.2017.9917","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/bresci.2017.9917","url":null,"abstract":"Os estudos de eventos atmosféricos extremos são importantes para a sociedade em geral. A chuva, tendo a altura pluviométrica como principal variável, insere-se neste contexto. Os dados pluviométricos brutos muitas vezes apresentam-se como longas séries que contém erros e falhas. Essas condições representam um desafio para a análise de padrões e predição de eventos. Esse trabalho apresenta uma abordagem inédita baseada em workflows científicos que conjugam quatro métodos de interpolação e de cruzamento de dados para o preenchimento de falhas nas séries históricas. Nossos experimentos utilizaram dezenas de estações no estado do Rio de Janeiro em um período de 75 anos e produziram análises e dados curados de alta qualidade e livres de falhas.","PeriodicalId":306675,"journal":{"name":"Anais do Brazilian e-Science Workshop (BreSci)","volume":"357 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2020-02-18","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"133350207","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Análise Exploratória da Malária na Amazônia Brasileira por Meio da Plataforma de Ciência de Dados aplicada à Saúde 通过应用于健康的数据科学平台对巴西亚马逊地区的疟疾进行探索性分析
Anais do Brazilian e-Science Workshop (BreSci) Pub Date : 2019-06-24 DOI: 10.5753/bresci.2019.10025
Lais Baroni, Balthazar Paixão, Álvaro Chrispino, G. Guedes, Christovam Barcellos, M. Pedroso, Eduardo S. Ogasawara
{"title":"Análise Exploratória da Malária na Amazônia Brasileira por Meio da Plataforma de Ciência de Dados aplicada à Saúde","authors":"Lais Baroni, Balthazar Paixão, Álvaro Chrispino, G. Guedes, Christovam Barcellos, M. Pedroso, Eduardo S. Ogasawara","doi":"10.5753/bresci.2019.10025","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/bresci.2019.10025","url":null,"abstract":"A malária é uma doença infecciosa que atinge principalmente a Amazônia Legal. O Departamento de Informática do Sistema Único de Saúde (DATASUS) hospeda e disponibiliza o Sistema de Informações de Vigilância Epidemiológica da Malária. Acompanhá-lo e integrar seus dados com fontes adicionais, bem como realizar a preparação dos dados é de vital importância para se compreender os fenômenos por trás das ocorrências e dos atendimentos médicos por meio das notificações realizadas no sistema. Para tanto, neste trabalho fazemos uso da Plataforma de Ciência de Dados aplicada à Saúde (PCDaS) como ferramenta para viabilizar a análise da evolução da malária na Amazônia Legal. A partir do seu uso, levantamos perguntas de pesquisas que podem ajudar na compreensão e no combate da malária no Brasil. \u0000 ","PeriodicalId":306675,"journal":{"name":"Anais do Brazilian e-Science Workshop (BreSci)","volume":"1 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2019-06-24","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"129368885","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Análise comparativa de ferramentas de Montagem e Binning de metagenomas utilizando dados simulados microbianos 利用模拟微生物数据对宏基因组组装和绑定工具进行比较分析
Anais do Brazilian e-Science Workshop (BreSci) Pub Date : 2019-06-24 DOI: 10.5753/BRESCI.2019.10034
Rodrigo B. P. R. Pará, P. H. Rocha, D. Couto, R. Oliveira, Regiane Kawasaki
{"title":"Análise comparativa de ferramentas de Montagem e Binning de metagenomas utilizando dados simulados microbianos","authors":"Rodrigo B. P. R. Pará, P. H. Rocha, D. Couto, R. Oliveira, Regiane Kawasaki","doi":"10.5753/BRESCI.2019.10034","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/BRESCI.2019.10034","url":null,"abstract":"Binning consiste em agrupar sequências de DNA de acordo com unidades taxonômicas, muito usado na Metagenômica, campo que estuda o genoma de comunidades de microrganismos. Novas ferramentas são desenvolvidas para pipelines metagenômicos, necessitando que se estabeleçam paradigmas neste tipo de análise através da verificação do desempenho de ferramentas de montagem e binning. Para os testes comparativos deste trabalho foram utilizados conjuntos de dados de 10 e 100 espécies de bactérias, além de 3 softwares montadores: IDBA_UD, Megahit e MetasSPAdes, e 2 softwares de binning: MetaBAT-2.12.1 e MaxBin-2.2.4. Verificou-se que o MetaBAT superou o MaxBin na qualidade dos bins gerados.","PeriodicalId":306675,"journal":{"name":"Anais do Brazilian e-Science Workshop (BreSci)","volume":"46 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2019-06-24","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"127469589","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Dealing with categorical missing data using CleanerR 使用CleanerR处理分类缺失数据
Anais do Brazilian e-Science Workshop (BreSci) Pub Date : 2019-06-24 DOI: 10.5753/bresci.2019.6310
R. S. Pereira, F. Porto
{"title":"Dealing with categorical missing data using CleanerR","authors":"R. S. Pereira, F. Porto","doi":"10.5753/bresci.2019.6310","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/bresci.2019.6310","url":null,"abstract":"Missing data is a common problem in the world of data analysis. They appear in datasets due to a multitude of reasons, from data integration to poor data input. When faced with the problem, the analyst must decide what to do with the missing data since its not always advisable to discard these values from your analysis. On this paper we shall discuss a method that takes into account information theory and functional dependencies to best imput missing values.","PeriodicalId":306675,"journal":{"name":"Anais do Brazilian e-Science Workshop (BreSci)","volume":"45 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2019-06-24","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"129115470","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Aplicação de Mineração de Dados para Predição de Mortalidade em UTI: balanceamento, dados ausentes e classificadores 数据挖掘在icu死亡率预测中的应用:平衡、缺失数据和分类器
Anais do Brazilian e-Science Workshop (BreSci) Pub Date : 2019-06-24 DOI: 10.5753/bresci.2019.6305
J. M. Barreto, Angelo C. Loula
{"title":"Aplicação de Mineração de Dados para Predição de Mortalidade em UTI: balanceamento, dados ausentes e classificadores","authors":"J. M. Barreto, Angelo C. Loula","doi":"10.5753/bresci.2019.6305","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/bresci.2019.6305","url":null,"abstract":"Escores de severidade fornecem um índice consolidado do estado de saúde do paciente na UTI. Estes escores são baseados em modelos lineares e em análises das variáveis isoladamente. Trabalhos prévios aplicaram mineração de dados para indução de modelos mais complexos de predição, mas não se aprofundaram na análise do desbalanceamento de classes e tratamento dos dados ausentes. Este trabalho analisou técnicas de balanceamento e imputação de valores, em conjunto com modelos de classificação de Random Forest (RF), Redes Neurais Artificiais (RNA) e Regressão Logística (RL). Como resultado a RF obteve o melhor desempenho, com a AUC média de 0.7840.006, sensibilidade de 0.7380.002 e especificidade de 0.7000.003 com valores ausentes substituídos por valores padrões e treinada com a base com sub-amostragem NCL. \u0000 ","PeriodicalId":306675,"journal":{"name":"Anais do Brazilian e-Science Workshop (BreSci)","volume":"301 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2019-06-24","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"121695447","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Aplicação de Ontologias de Proveniência em Workflows Cientı́ficos: um Mapeamento Sistemático 应用本体的起源在科学工作流ı́地区:一个系统的映射
Anais do Brazilian e-Science Workshop (BreSci) Pub Date : 2019-06-24 DOI: 10.5753/bresci.2019.6309
Luiz Gustavo Dias, B. Lopes, Daniel de Oliveira
{"title":"Aplicação de Ontologias de Proveniência em Workflows Cientı́ficos: um Mapeamento Sistemático","authors":"Luiz Gustavo Dias, B. Lopes, Daniel de Oliveira","doi":"10.5753/bresci.2019.6309","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/bresci.2019.6309","url":null,"abstract":"Experimentos cientı́ficos modelados como workflows são executados por complexos mecanismos chamados de Sistemas de Gerência de Workflows (SGWf). Existem diversos SGWfs com seus prós e contras, porém todos compartilham diversas caracterı́sticas como por exemplo, a necessidade de fornecer apoio para os cientis- tas analisarem seus dados. Os dados de proveniência tem um papel importante no fornecimento das informações necessárias em diferentes etapas experimentais. Desta forma, o presente trabalho tem como objetivo mapear e caracterizar abordagens que utilizam uma das quatro ontologias de proveniência selecionadas, analisando fatores como adequabilidade, requisitos de execução e arquitetura. Após o estudo, percebeu- se que as ontologias de proveniência podem ser aplicadas em diferentes etapas do ciclo de vida do workflow cientı́fico, mas principalmente na fase de análise.","PeriodicalId":306675,"journal":{"name":"Anais do Brazilian e-Science Workshop (BreSci)","volume":"36 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2019-06-24","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"133595971","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Recognizing pharmacovigilance named entities in Brazilian Portuguese with CoreNLP 用CoreNLP识别巴西葡萄牙语命名的药物警戒实体
Anais do Brazilian e-Science Workshop (BreSci) Pub Date : 2019-06-24 DOI: 10.5753/bresci.2019.6314
A. M. R. Cunha, Kele T. Belloze, G. Guedes
{"title":"Recognizing pharmacovigilance named entities in Brazilian Portuguese with CoreNLP","authors":"A. M. R. Cunha, Kele T. Belloze, G. Guedes","doi":"10.5753/bresci.2019.6314","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/bresci.2019.6314","url":null,"abstract":"Textual data sources may assist in the detection of adverse events not predicted for a particular drug. However, given the amount of information available in several sources, it is reasonable to adopt a computational approach to analyze these sources to search for adverse events. In this scenario, we created an extension of CoreNLP to process Brazilian Portuguese texts from pharma- covigilance area. We trained three natural language models: a Part-of-speech tagger, a parser and a Named Entity Recognizer. Preliminary results indicate success in generating a dependency tree for phrases in the pharmacovigilance area and in identifying pharmacovigilance named entities.","PeriodicalId":306675,"journal":{"name":"Anais do Brazilian e-Science Workshop (BreSci)","volume":"30 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2019-06-24","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"126809611","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Predição de Falhas em Workflows Cientı́ficos com o uso de Redes de Petri Estocásticas e Lógica DS 3 科学预测的缺陷在工作流ı́地区使用的随机Petri网和逻辑的三
Anais do Brazilian e-Science Workshop (BreSci) Pub Date : 2019-06-24 DOI: 10.5753/bresci.2019.6308
B. Lopes, Daniel de Oliveira
{"title":"Predição de Falhas em Workflows Cientı́ficos com o uso de Redes de Petri Estocásticas e Lógica DS 3","authors":"B. Lopes, Daniel de Oliveira","doi":"10.5753/bresci.2019.6308","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/bresci.2019.6308","url":null,"abstract":"Vários workflows existentes exigem muitos recursos computacionais, pois processam um grande volume de dados. Dessa forma, os ambientes de Processamento de Alto Desempenho (PAD) devem ser aplicados em conjunto com técnicas de paralelização para apoiar a sua execução. Embora os ambientes de PAD ofereçam diversas vantagens, as falhas são uma realidade, e não uma possibilidade, devido ao grande número de nós de computação envolvidos na execução do workflow. Verificar falhas no workflow é uma tarefa desafiadora que ainda requer esforço. Neste artigo, propomos o uso da DS 3 , uma lógica dinâmica adaptada sobre as redes de Petri estocásticas, para verificar e prever falhas em workflows.","PeriodicalId":306675,"journal":{"name":"Anais do Brazilian e-Science Workshop (BreSci)","volume":"32 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2019-06-24","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"132099508","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Modelagem de Redes Regulatórias para a Descoberta de Novos Biomarcadores de Doenças Complexas 为发现复杂疾病的新生物标志物建立监管网络建模
Anais do Brazilian e-Science Workshop (BreSci) Pub Date : 2019-06-24 DOI: 10.5753/bresci.2019.6307
Rafael Pompeu, L. Magalhães, André M. Ribeiro-dos-Santos, Amanda Vidal, G. S. Araújo
{"title":"Modelagem de Redes Regulatórias para a Descoberta de Novos Biomarcadores de Doenças Complexas","authors":"Rafael Pompeu, L. Magalhães, André M. Ribeiro-dos-Santos, Amanda Vidal, G. S. Araújo","doi":"10.5753/bresci.2019.6307","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/bresci.2019.6307","url":null,"abstract":"Este estudo apresenta uma proposta de modelagem de redes regulatórias extraindo dados biológicos públicos de três classes de elementos regulatórios (ncRNAs), tais como os miRNAs, circRNAs e piRNAs e suas relações (regulação e origem) com genes. A integração das redes de ncRNAs e sua associação com dados biológicos de importância clı́nica permitiu a identificação de genes candidatos que potencialmente atuam no desenvolvimento de doenças complexas. A partir das caracterı́sticas de centralidade e sobreposição de ligações desta rede, identificamos novos genes e ncRNAs po- tenciais biomarcadores de doenças complexas consideradas graves problemas de saúde pública.","PeriodicalId":306675,"journal":{"name":"Anais do Brazilian e-Science Workshop (BreSci)","volume":"1 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2019-06-24","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"125940515","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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