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Molecular-Assisted Taxonomic Study on the Sargassum C.Agardh (Fucales, Phaeophyceae) in Northwestern Luzon, Philippines 菲律宾吕宋岛西北部马尾藻的分子辅助分类研究
4区 生物学
Cryptogamie Algologie Pub Date : 2023-10-18 DOI: 10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a7
Wilfred John E. Santiañez, John Michael L. Lastimoso, Masakazu Hoshino, Brix Nester Q. Villafuerte, Kazuhiro Kogame, Gavino C. Trono
{"title":"Molecular-Assisted Taxonomic Study on the Sargassum C.Agardh (Fucales, Phaeophyceae) in Northwestern Luzon, Philippines","authors":"Wilfred John E. Santiañez, John Michael L. Lastimoso, Masakazu Hoshino, Brix Nester Q. Villafuerte, Kazuhiro Kogame, Gavino C. Trono","doi":"10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a7","DOIUrl":"https://doi.org/10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a7","url":null,"abstract":"Étude des Sargassum (Fucales, Phaeophyceae) dans le nord-ouest de Luzon, Philippines au moyen des outils de la taxonomie moléculaire. La diversité du genre d'algues brunes Sargassum C.Agardh aux Philippines est la plus élevée de l'océan Pacifique tropical occidental. Cependant, la plupart des études sur les Sargassum des Philippines sont basées sur de la morpho-anatomie, et l'hypothèse selon laquelle le genre est très diversifié dans le pays n'a jamais été vérifiée sur la base d'informations moléculaires. Étant donné que de nombreuses espèces de Sargassum sont hautement polymorphiques et que les études phylogénétiques moléculaires ont récemment permis de faire progresser la systématique, nous pensons que les espèces de Sargassum des Philippines devraient maintenant être réévaluées au moyen d'outils de la taxonomie moléculaire. Nous présentons ici les résultats de nos études taxonomiques moléculaires sur les sargasses du nord des Philippines, en particulier le long des côtes de quatre provinces côtières du nord-ouest de Luzon (Ilocos Norte, Ilocos Sur, La Union et Pangasinan). Nous avons reconnu trois lignées d'espèces distinctes, à savoir Sargassum aquifolium (Turner) C.Agardh, Sargassum ilicifolium (Turner) C.Agardh, et Sargassum polycystum C.Agardh, sur la base d'analyses moléculaires de 74 spécimens provenant de nos zones d'étude. Nos observations morphologiques sur la gamme de caractères de ces espèces suggèrent également que plusieurs taxons communs de Sargassum aux Philippines ont été mal identifiés. En particulier, les spécimens précédemment attribués à S. kushimotense Yendo devraient être appelés S. aquifolium, tandis que S. ilicifolium, largement répandue et très plastique, est souvent confondue et identifiée aux Philippines sous plusieurs noms, dont S. crassifolium J.Agardh, S. cristaefolium C.Agardh et S. turbinarioides Grunow. Nos résultats suggèrent que la biodiversité des sargasses aux Philippines pourrait avoir été gonflée par des erreurs d'identification et que la diversité des espèces est en fait beaucoup plus faible qu'on ne le pensait initialement.","PeriodicalId":51000,"journal":{"name":"Cryptogamie Algologie","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-10-18","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135943291","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Two New Species of Achnanthidium Kützing (Achnanthidiaceae) from the Quaternary Sediments of the Colônia Basin, Southeast Brazil 巴西东南部Colônia盆地第四纪沉积物中蜘蛛属k<e:1> tzing两新种
4区 生物学
Cryptogamie Algologie Pub Date : 2023-09-27 DOI: 10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a6
Marquardt, Gisele C., Bicudo, Denise C., de M. Bicudo, Carlos E., Ledru, Marie-Pierre, Wetzel, Carlos E.
{"title":"Two New Species of Achnanthidium Kützing (Achnanthidiaceae) from the Quaternary Sediments of the Colônia Basin, Southeast Brazil","authors":"Marquardt, Gisele C., Bicudo, Denise C., de M. Bicudo, Carlos E., Ledru, Marie-Pierre, Wetzel, Carlos E.","doi":"10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a6","DOIUrl":"https://doi.org/10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a6","url":null,"abstract":"Deux nouvelles espèces d'Achnanthidium Kützing (Achnanthidiaceae) provenant des sédiments quaternaires du bassin de Colônia, sud-est du Brésil. Cette recherche utilise des techniques de microscopie optique et de microscopie électronique à balayage pour observer deux espèces d'Achnanthidium Kützing appartenant au complexe A. minutissimum ‘sensu lato’, prélevées dans des sédiments pléistocènes du bassin de Colônia, dans le sud-est du Brésil. Nous avons comparé Achnanthidium ectorianum Marquardt & C.E.Wetzel, sp. nov. et A. craterianum Marquardt & C.E.Wetzel, sp. nov. avec leurs espèces morphologiquement les plus proches, révélant des contours de valves, des formes d’apex de valves, des zones centrales et des structures de raphé différents. Nos résultats permettent d’élargir les connaissances taxonomiques du genre en Amérique du Sud, ce qui est fondamental pour mieux comprendre les schémas de distribution et de diversité des diatomées dans les régions peu étudiées. Nos recherches améliorent également les connaissances actuelles sur l’évolution du paléolac dans le bassin de Colônia (São Paulo) depuis le début du Pléistocène.","PeriodicalId":51000,"journal":{"name":"Cryptogamie Algologie","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-09-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135586091","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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A Taxonomic Assessment of Pyropia hiemalis (Kylin) Varela-Álvarez, Guiry & Serrão, comb. nov. (Bangiaceae, Bangiophyceae) 这首歌在美国公告牌百强单曲榜上排名第二,在英国单曲榜上排名第三,在英国单曲榜上排名第四。11月(Bangiaceae, Bangiophyceae)
IF 1.3 4区 生物学
Cryptogamie Algologie Pub Date : 2023-08-30 DOI: 10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a5
E. Varela-Álvarez, M. Guiry, Ester A. Serrão
{"title":"A Taxonomic Assessment of Pyropia hiemalis (Kylin) Varela-Álvarez, Guiry & Serrão, comb. nov. (Bangiaceae, Bangiophyceae)","authors":"E. Varela-Álvarez, M. Guiry, Ester A. Serrão","doi":"10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a5","DOIUrl":"https://doi.org/10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a5","url":null,"abstract":"ABSTRACT Until recently, all the bladed members of the Bangiaceae Duby were assigned to the genus Porphyra C.Agardh, nom. cons.; however, in the last twenty years, major molecular taxonomic revisions of this family have resulted in several new and reinstated genera. Porphyra linearis Greville is one of the species retained in Porphyra and its growth and reproduction is confined to the upper intertidal in the colder months of the year. Porphyra hiemalis Kylin was described for specimens collected from the south-west coast of Sweden but was later referred to the synonymy of P. linearis based upon its winter seasonality and linear form. We here compare the morphology and reproduction of isolates of both taxa from various locations in the NE Atlantic, and we sequence the intergenetic RUBISCO spacer and adjacent coding regions in these isolates to verify their phylogenetic relationships with other members of bladed Bangiaceae. Results show that both entities are not only distinct species despite almost identical external morphology, but they belong to different genera. A lectotype and epitype (of sequenced material) is designated for P. hiemalis and a transfer to the reinstated genus Pyropia J.Agardh is proposed as Pyropia hiemalis (Klyin) Varela-Álvarez, Guiry & Serrão, comb. nov. RÉSUMÉ Évaluation taxonomique de Pyropia hiemalis (Kylin) Varela-Álvarez, Guiry & Serrão, comb. nov. (Bangiaceae, Bangiophyceae). Jusqu'à récemment, tous les membres à lames des Bangiaceae Duby étaient assignés au genre Porphyra C.Agardh, nom. cons.; cependant, au cours des vingt dernières années, d'importantes révisions taxonomiques moléculaires de cette famille ont donné lieu à plusieurs genres nouveaux ou rétablis. Porphyra linearis Greville est l'une des espèces retenues dans Porphyra; sa croissance et sa reproduction sont confinées à la zone intertidale supérieure pendant les mois les plus froids de l'année. Porphyra hiemalis Kylin a été décrit selon des spécimens collectés sur la côte sud-ouest de la Suède, mais il a ensuite été mis en synonymie de P. linearis sur la base de sa saisonnalité hivernale et de sa forme linéaire. Nous comparons ici la morphologie et la reproduction d'isolats des deux taxons provenant de divers endroits de l'Atlantique Nord-Est, et nous séquençons l'espaceur intergénétique RUBISCO et les régions codantes adjacentes dans ces isolats afin de vérifier leurs relations phylogénétiques avec d'autres membres des Bangiaceae à feuilles. Les résultats montrent que les deux entités ne sont pas seulement des espèces distinctes malgré une morphologie externe presque identique, mais qu'elles appartiennent à des genres différents. Un lectotype et un épitype (du matériel séquencé) sont désignés pour P. hiemalis et un transfert au genre rétabli Pyropia J.Agardh est proposé sous le nom de Pyropia hiemalis (Klyin) Varela-Álvarez, Guiry & Serrão, comb. nov.","PeriodicalId":51000,"journal":{"name":"Cryptogamie Algologie","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":1.3,"publicationDate":"2023-08-30","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"88943456","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Phylogeography of Amansia glomerata C.Agardh (Ceramiales, Rhodomelaceae) in Hawai‘i: A Single Species with High Divergence 夏威夷Amansia glomerata C.Agardh (Ceramiales, Rhodomelaceae)的系统地理学:一个高分化的单一物种
IF 1.3 4区 生物学
Cryptogamie Algologie Pub Date : 2023-07-19 DOI: 10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a4
James T. Fumo, A. Sherwood
{"title":"Phylogeography of Amansia glomerata C.Agardh (Ceramiales, Rhodomelaceae) in Hawai‘i: A Single Species with High Divergence","authors":"James T. Fumo, A. Sherwood","doi":"10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a4","DOIUrl":"https://doi.org/10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a4","url":null,"abstract":"ABSTRACT Algal biogeography in Hawai‘i has not been studied in detail for many species. The islands are home to swift-current deep-water channels separating suitable habitats. The ability of these channels to act as barriers to dispersal has been studied in several animal lineages and is assessed here using the widespread red alga Amansia glomerata C.Agardh. A variety of analytical techniques based on 129 mitochondrial COI barcoding sequences collected across c. 2500 km were used to assess the genetic diversity of A. glomerata in Hawai‘i. Haplotype network analyses demonstrated that the species is split into four main lineages which overlap in large parts of their range, yet there is insufficient support to recognize the lineages as separate species. Measures of haplotype diversity, nucleotide diversity, and neutrality tests suggest that at least three of these lineages have undergone recent population expansion. Biogeographic barriers were found to largely match those of marine animal groups in the archipelago. No evidence was found for distinct haplotypes or lineages between shallow and mesophotic reefs. A number of potential collection locations are suggested for the 1822 lectotype of the species, which was included in the molecular analyses. Potential scenarios leading to observed diversity patterns in the archipelago are presented. Amansia glomerata exhibits a high degree of haplotypic variation in Hawai‘i, suggesting it may exhibit vast molecular divergences across its broader range, which extends from Hawai‘i to southeastern Africa. RÉSUMÉ Phylogéographie d'Amansia glomerata C.Agardh (Ceramiales, Rhodomelaceae) à Hawai‘i: une seule espèce à forte divergence. La biogéographie des algues à Hawai‘i n'a pas été étudiée en détail pour de nombreuses espèces. Les îles abritent des chenaux rapides d'eau profonde séparant les habitats appropriés. La capacité de ces chenaux à agir comme des barrières à la dispersion a été étudiée dans plusieurs lignées animales et est évaluée ici à l'aide de l’algue très répandue Amansia glomerata C.Agardh. Une variété de techniques analytiques basées sur 129 séquences de code-barres COI mitochondriales collectées sur environ 2500 km ont été utilisées pour évaluer la diversité génétique d'A. glomerata à Hawai‘i. Les analyses du réseau d'haplotypes ont démontré que l'espèce est divisée en quatre lignées principales qui se chevauchent dans de grandes parties de leur aire de répartition, mais il n'y a pas suffisamment de soutien pour reconnaître les lignées comme plusieurs espèces. Les mesures de la diversité des haplotypes, de la diversité des nucléotides et des tests de neutralité suggèrent qu'au moins trois de ces lignées ont subi des expansions démographiques récentes. Les barrières biogéographiques correspondent largement à celles des groupes d'animaux marins de l'archipel. Aucune preuve n'a été trouvée pour des haplotypes ou des lignées distincts entre les récifs peu profonds et mésophotiques. Un certain nombre d","PeriodicalId":51000,"journal":{"name":"Cryptogamie Algologie","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":1.3,"publicationDate":"2023-07-19","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"88059448","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Structural and Functional Genes, and Highly Repetitive Sequences Commonly Used in the Phylogeny and Species Concept of the Phylum Cyanobacteria 蓝藻门系统发育和物种概念中常用的结构和功能基因以及高度重复序列
IF 1.3 4区 生物学
Cryptogamie Algologie Pub Date : 2023-06-28 DOI: 10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a3
B. Nowruzi, Lenka Hutárová
{"title":"Structural and Functional Genes, and Highly Repetitive Sequences Commonly Used in the Phylogeny and Species Concept of the Phylum Cyanobacteria","authors":"B. Nowruzi, Lenka Hutárová","doi":"10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a3","DOIUrl":"https://doi.org/10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a3","url":null,"abstract":"ABSTRACT Cyanobacteria are a lineage of Eubacteria that have long captured the attention of scientists. Approximately 5310 species of cyanobacteria have been hitherto described and new species are continually being found, named and described according to established rules. The correct determination of cyanobacteria strains concerns new biotechnological applications as well as ecological studies. There are many situations where it is crucial to recognise distinct algae species, however methods for doing so vary greatly. The aim of this review is to summarize the state of the art of the main and most recent molecular studies focusing on the phylum Cyanobacteria, with particular attention to the most frequently used gene markers. For a long time, the classification method used for cyanobacteria as well as traditionally described species was mainly based on morphology. Over time, integrative taxonomy, which involves the inclusion of many characters and comprehensive taxa sampling, has become the rule as it provides a better resolution of species relationships. For a better resolution of the phylogenies of the phylum Cyanobacteria, it is usually necessary to focus on different genetic markers: from the most common, like the 16S and 23S rRNA, ITS, rbcLXS and rpoC genes, to genes not so widely used, such as hetR, psbA, tufA, gyp and cpcBA. Also, the highly repetitive sequences often used for the symbiotic cyanobacteria represent an important factor in the inference of the phylogenetic relationships. RÉSUMÉ Gènes structurels, fonctionnels, et séquences hautement répétitives couramment utilisés pour la phylogénie et concept d'espèces dans le phylum des cyanobactéries. Les cyanobactéries sont une lignée d'eubactéries qui attirent depuis longtemps l'attention des scientifiques. Environ 5 310 espèces de cyanobactéries ont été décrites jusqu'à présent et de nouvelles espèces sont continuellement découvertes, généralement nommées et décrites d'après des règles précises. La détermination correcte des souches de cyanobactéries a des répercussions sur de nouvelles applications biotechnologiques ainsi que sur des études écologiques. Dans de nombreuses situations, il est crucial de reconnaître des espèces d'algues distinctes, mais les méthodes pour y parvenir varient considérablement. L'objectif de cette revue est de faire le point sur les principales et les plus récentes études moléculaires portant sur le phylum des cyanobactéries, en accordant une attention particulière aux marqueurs génétiques les plus fréquemment utilisés. Pendant longtemps, la méthode de classification utilisée pour les cyanobactéries et les espèces traditionnellement décrites était principalement basée sur la morphologie. Au fil du temps, la taxonomie intégrative, qui implique l'inclusion de nombreux caractères et un échantillonnage complet des taxons, est devenue la règle car elle permet une meilleure résolution des relations entre espèces. Pour une meilleure résolution des phylogénies du ph","PeriodicalId":51000,"journal":{"name":"Cryptogamie Algologie","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":1.3,"publicationDate":"2023-06-28","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"75059202","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Phylogenetic Analysis of the Red Algal Tribe Ceramieae Reveals Multiple Morphological Homoplasies but Defines New Genera 红藻族Ceramieae的系统发育分析揭示了多种形态同源性,但定义了新属
IF 1.3 4区 生物学
Cryptogamie Algologie Pub Date : 2023-05-04 DOI: 10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a2
M. B. Barros‐Barreto, Maria Alejandra Jaramillo, M. Hommersand, Paulo Cavalcante Gomes Ferreira, C. Maggs
{"title":"Phylogenetic Analysis of the Red Algal Tribe Ceramieae Reveals Multiple Morphological Homoplasies but Defines New Genera","authors":"M. B. Barros‐Barreto, Maria Alejandra Jaramillo, M. Hommersand, Paulo Cavalcante Gomes Ferreira, C. Maggs","doi":"10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a2","DOIUrl":"https://doi.org/10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a2","url":null,"abstract":"ABSTRACT Despite the importance of morphological characters for classification, molecular data are now more widely used than morphology in phylogenetic reconstructions, particularly in studies of algae. The tribe Ceramieae C.Agardh ex Greville (Ceramiaceae) is a widespread, speciose, and morphologically diverse group of valuable red algae with many identified bioactives. We aimed to elucidate phylogenetic relationships in the tribe to delimit genera and provide a new classification. Generic delimitation is currently based on morphological characters, and there has been no overall reassessment of generic circumscriptions and evolutionary relationships using molecular data. We used three molecular markers (mitochondrial COI-5P, plastid rbcL and nuclear LSU). Within the Ceramieae, several clades are recovered, although the relationships among major clades are not supported. These clades are here recognized as genera, with new circumscriptions for Ceramium Roth, Carpoblepharis Kützing, Herpochondria F.Schmitz & Falkenberg, Campylaephora J.Agardh and Celeceras Kützing, and the proposal of Pseudoceramium Barros-Barreto & Maggs, gen. nov., Yoneshiguea Barros-Barreto, Maggs & M.A.Jaramillo, gen. nov. and Stirkia Barros-Barreto & Maggs, gen. nov. The Ceramieae show a high degree of morphological homoplasy among species as well as extreme phenotypic plasticity within species. Genera lack unique synapomorphies and multiple morphological characters are required to define most of them. Molecular data are critical for understanding systematics in this group. RÉSUMÉ L'analyse phylogénétique de la tribu des algues rouges Ceramieae révèle de multiples homoplasies morphologiques mais définit de nouveaux genres. Malgré l'importance des caractères morphologiques dans la classification, les données moléculaires sont désormais plus largement utilisées que la morphologie dans les reconstructions phylogénétiques, en particulier dans les études sur les algues. La tribu Ceramieae C.Agardh ex Greville (Ceramiaceae) est un groupe répandu, spécifique et morphologiquement diversifié d'algues rouges d'intérêt avec de nombreux bioactifs identifiés. Nous avons cherché à élucider les relations phylogénétiques dans la tribu pour délimiter les genres et fournir une nouvelle classification. La délimitation générique est actuellement basée sur des caractères morphologiques, et il n'y a pas eu de réévaluation globale des circonscriptions génériques et des relations évolutives à l'aide de données moléculaires. Nous avons utilisé trois marqueurs moléculaires (COI-5P mitochondrial, rbcL chloroplastique et LSU nucléaire). Au sein des Ceramieae, plusieurs clades sont reconnus, bien que les relations entre les principaux clades ne soient pas résolues. Ces clades sont ici reconnus comme des genres, avec de nouvelles circonscriptions pour Ceramium Roth, Carpoblepharis Kützing, Herpochondria F.Schmitz & Falkenberg, Campylaephora J.Agardh et Celeceras Kützing, et la proposition de Pseudoceramiu","PeriodicalId":51000,"journal":{"name":"Cryptogamie Algologie","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":1.3,"publicationDate":"2023-05-04","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"86083850","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Molecular Characterization and Morpho-Taxonomy of Gambierdiscus caribaeus Vandersea, Litaker, M.A.Faust, Kibler, W.C.Holland & P.A.Tester (Dinophyceae) from Mauritius Island, South-West Indian Ocean 西南印度洋毛里求斯岛Gambierdiscus caribaeus Vandersea, Litaker, M.A.Faust, Kibler, W.C.Holland和p.a.t est(恐龙科)的分子特征和形态分类
IF 1.3 4区 生物学
Cryptogamie Algologie Pub Date : 2023-01-30 DOI: 10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a1
P. Mussai, J. Larsen, R. Jeewon
{"title":"Molecular Characterization and Morpho-Taxonomy of Gambierdiscus caribaeus Vandersea, Litaker, M.A.Faust, Kibler, W.C.Holland & P.A.Tester (Dinophyceae) from Mauritius Island, South-West Indian Ocean","authors":"P. Mussai, J. Larsen, R. Jeewon","doi":"10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a1","DOIUrl":"https://doi.org/10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a1","url":null,"abstract":"ABSTRACT Species of the marine benthic dinoflagellate genus Gambierdiscus Adachi & Fukuyo are morphologically similar, and DNA based sequence analyses are necessary to complement morphological species determination. Gambierdiscus species may produce ciguatoxins, the causative agents of human illness ciguatera poisoning (CP). In this study, morphological descriptions, based on laboratory cultures, using light and scanning electron microscopy and DNA based characterisation of one strain (ISOG4) isolated from Petite Rivière Noire, Mauritius are provided. Our morphological observations coupled with DNA based sequence analyses indicate that the Mauritian strain is Gambierdiscus caribaeus Vandersea, Litaker, M.A.Faust, Kibler, W.C.Holland & P.A.Tester. Our strain bears close similarity (LSU 99% identity) to Gambierdiscus caribaeus (GenBank[KY448444]) isolated from Canary Islands, Spain, and phylogenetic results depict it as sister to G. jejuensis S.H.Jang & H.J.Jeong. Gambierdiscus caribaeus (ISOG4) is herein a first report from Mauritius Island and the Mascarene region. RÉSUMÉ Caractérisation moléculaire et morpho-taxonomie de Gambierdiscus caribaeus Vandersea, Litaker, M.A.Faust, Kibler, W.C.Holland & P.A.Tester (Dinophyceae) de l'île Maurice, sud-ouest de l'océan Indien. Les espèces du genre de dinoflagellés benthiques marins Gambierdiscus Adachi & Fukuyo sont morphologiquement similaires, et des analyses de séquences basées sur l'ADN sont nécessaires pour compléter la détermination morphologique des espèces. Les espèces de Gambierdiscus peuvent produire des ciguatoxines, agents responsables de la maladie humaine qu'est la ciguatera (CP). Dans cette étude, des descriptions morphologiques, basées sur des cultures en laboratoire, réalisées par microscopie optique et électronique à balayage, et une caractérisation basée sur l'ADN d'une souche (ISOG4) isolée de Petite Rivière Noire, Maurice sont fournies. Nos observations morphologiques couplées aux analyses de séquences basées sur l'ADN indiquent que la souche mauricienne est Gambierdiscus caribaeus Vandersea, Litaker, M.A.Faust, Kibler, W.C.Holland & P.A.Tester. Notre souche est très similaire (LSU 99 %) à Gambierdiscus caribaeus (GenBank[KY448444]) isolé des îles Canaries, Espagne, et les résultats phylogénétiques la décrivent comme sœur de G. jejuensis S.H.Jang & H.J.Jeong. Gambierdiscus caribaeus (ISOG4) est ici signalé pour la première fois à l'île Maurice et dans la région des Mascareignes.","PeriodicalId":51000,"journal":{"name":"Cryptogamie Algologie","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":1.3,"publicationDate":"2023-01-30","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"81657648","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Ulva L. biodiversity in the central Mediterranean Sea: cryptic species and new records 地中海中部Ulva .生物多样性:隐种和新记录
IF 1.3 4区 生物学
Cryptogamie Algologie Pub Date : 2022-12-14 DOI: 10.5252/cryptogamie-algologie2022v43a14
Angela G. Bartolo, G. Zammit, F. Küpper
{"title":"Ulva L. biodiversity in the central Mediterranean Sea: cryptic species and new records","authors":"Angela G. Bartolo, G. Zammit, F. Küpper","doi":"10.5252/cryptogamie-algologie2022v43a14","DOIUrl":"https://doi.org/10.5252/cryptogamie-algologie2022v43a14","url":null,"abstract":"ABSTRACT Ulva L. species are problematic to identify since they have cryptic morphologies with few distinctive features, as well as significant intraspecific variation. In this study, we report two new records for the Maltese islands: the heterokont benthic multicellular algae Ulva torta (Mertens) Trevisan and Ulva californica Wille, which were isolated and grown in culture from incubated natural substrata. This study includes an integrative systematics approach using both morphology and barcode sequencing of the nuclear internal transcribed spacer (ITS) region (ITS1-5.8S-ITS2), the chloroplast RUBISCO LSU (rbcL) gene and the elongation factor Tu (tufA). Subsequent phylogenetic analyses, supported the separation of these two species from other closely-related congeners that have previously been reported from the Maltese islands. RÉSUMÉ Biodiversité des Ulva L. en Méditerranée centrale: espèces cryptiques et signalements nouveaux. Certaines espèces d'Ulva L. sont difficiles à identifier car elles sont cryptiques, soit par manque de caractères distinctifs, soit en raison de variation phénotypique intraspécifique. Cette étude documente deux nouvelles espèces pour les îles maltaises: les algues multicellulaires benthiques hétérokontes Ulva torta (Mertens) Trevisan et Ulva californica Wille, qui ont été isolées et cultivées en culture à partir de substrats naturels incubés. Cette étude comprend une approche intégrative utilisant la morphologie aussi bien que le séquençage d'ADN de la région de l'espaceur transcrit interne nucléaire (ITS) (ITS1-5.8S-ITS2), du gène chloroplastique RUBISCO LSU (rbcL) et du facteur d'élongation Tu (tufA). Ces deux espèces ont été séparées de leurs proches congénères des îles maltaises grâce aux analyses phylogénétiques.","PeriodicalId":51000,"journal":{"name":"Cryptogamie Algologie","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":1.3,"publicationDate":"2022-12-14","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"91131415","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Nitella sonderi A.Braun (Charales, Charophyceae) – a New Record for South America, and First Record from Outside Australia 南美新纪录及澳洲以外首个纪录
IF 1.3 4区 生物学
Cryptogamie Algologie Pub Date : 2022-11-28 DOI: 10.5252/cryptogamie-algologie2022v43a13
R. Romanov, R. Vidal-Russell, V. Nikulin, A. Gontcharov, M. P. Quiroga
{"title":"Nitella sonderi A.Braun (Charales, Charophyceae) – a New Record for South America, and First Record from Outside Australia","authors":"R. Romanov, R. Vidal-Russell, V. Nikulin, A. Gontcharov, M. P. Quiroga","doi":"10.5252/cryptogamie-algologie2022v43a13","DOIUrl":"https://doi.org/10.5252/cryptogamie-algologie2022v43a13","url":null,"abstract":"ABSTRACT Nitella sonderi A.Braun is newly reported from the Patagonian Plateau, Argentina. This species was only reliably known from Australia until now. The morphological and genetic studies carried out here found no difference between Argentinian and Australian specimens. The species is dioecious, mucous-bearing on fertile whorls, with two to three-forked homeoclemous, macrodactylous branchlets with a long primary ray, an evident central secondary ray, bicellulate dactyls with a shortly narrowing tip of the penultimate cell, which is confluent with a small discoloured conical cell and large antheridia. Although only male plants were found in Patagonia, this combination of traits allowed its differentiation from other species of Nitella C.Agardh known from South America, but pointed towards the similarity with N. papillata F.S.Han & W.Q.Chen found only in South-East China. Nitella sonderi is the first dioecious species from the section Gioallenia R.D.Wood found in South America. Additions to the description of N. sonderi were suggested here based on specimens from Argentina and Australia. Doubt concerning a species record of N. morongii Allen for Australia published elsewhere was outlined. The new species record for South America highlights an unexpected biogeographical pattern, rare for dioecious species, or may suggest a case of invasion. Future taxonomic research is desirable to clarify the affinity of N. sonderi and N. papillata. RÉSUMÉ Nitella sonderi A.Braun (Charales, Charophyceae) – un nouvel enregistrement pour l'Amérique du Sud, et un premier signalement en dehors de l'Australie. Nitella sonderi A.Braun est nouvellement signalée sur le plateau patagonien, en Argentine. Cette espèce n'était connue de manière fiable que d'Australie. Les études morphologiques et génétiques menées ici n'ont révélé aucune différence entre les spécimens argentins et australiens. L'espèce est dioïque, avec des mucosités sur les verticilles fertiles, des rameaux macrodactyles homéoclémeux à deux ou trois fourches avec un long rayon primaire, un rayon secondaire central évident, des dactyles constitués de deux cellules avec une pointe peu rétrécie de l'avant-dernière cellule, qui est confluente avec une petite cellule conique et hyaline et de grandes anthéridies. Bien que seules des plantes mâles aient été trouvées en Patagonie, cette combinaison de traits a permis sa différenciation des autres espèces de Nitella C.Agardh connues d'Amérique du Sud, mais a pointé des similitudes avec N. papillata F.S.Han & W.Q.Chen trouvée uniquement dans le sud-est de la Chine. Nitella sonderi est la première espèce dioïque de la section Gioallenia R.D.Wood trouvée en Amérique du Sud. Des ajouts à la description de N. sonderi ont été suggérés ici sur la base de spécimens étudiés d'Argentine et d'Australie. Des doutes concernant le premier enregistrement de l'espèce de N. morongii Allen en Australie, publié ailleurs, sont émis. Le nouvel enregistrement de l'espèce pour l'Amériqu","PeriodicalId":51000,"journal":{"name":"Cryptogamie Algologie","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":1.3,"publicationDate":"2022-11-28","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"76345556","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Oospore Features among Morphologically Similar and Closely Related Charophyte Species: Consistency and Variability 形态相似和亲缘关系密切的绿叶植物物种的卵孢子特征:一致性和变异性
IF 1.3 4区 生物学
Cryptogamie Algologie Pub Date : 2022-11-16 DOI: 10.5252/cryptogamie-algologie2022v43a12
Vanja Milovanović, S. Popović, D. Predojević, G. Šimić, Ana Ržaničanin, J. Sekulić, Ivana Trbojević
{"title":"Oospore Features among Morphologically Similar and Closely Related Charophyte Species: Consistency and Variability","authors":"Vanja Milovanović, S. Popović, D. Predojević, G. Šimić, Ana Ržaničanin, J. Sekulić, Ivana Trbojević","doi":"10.5252/cryptogamie-algologie2022v43a12","DOIUrl":"https://doi.org/10.5252/cryptogamie-algologie2022v43a12","url":null,"abstract":"ABSTRACT The precise determination of charophytes to the species level is important for many reasons, but the common morphological taxonomic characteristics, particularly between morphologically similar taxa can be insufficient or misleading. The aim of our study was to create a comparative analysis of the oospore's morphometric parameters in morphologically similar taxa such as Chara globularis Thuil., C. “connivens” P.Salzmann ex A.Braun, C. braunii C.C.Gmel. and C. baueri A.Braun (from Serbia). The potential for applying oospore features in species delineation was assessed, along with the interpopulation variability of oospore parameters in geographically remote populations of C. globularis and C. braunii. Common oospore parameters (height, width, number of ridges, width of fossa, and distance between the apical pole of the oospore and its widest part) were measured and the isopolarity index and anisopolarity index indices were calculated. Both interpopulation variability and interspecific differences were confirmed using oospore morphology for the selected charophyte species. Although interpopulation variability does in fact exist, oospore parameters clearly differ between morphologically similar taxa. These results are important from a taxonomic perspective, but also from the aspect of diaspore bank characterization and its potential application in restoration projects. The results also justify the need for the development of oospore identification keys at the local and regional level, particularly in the regions where they are completely lacking (e.g. Balkans). Collecting more data on oospore morphometry is necessary for our results to be widely used. RÉSUMÉ Caractéristiques des oospores parmi des espèces de charophytes morphologiquement similaires et étroitement apparentées: cohérence et variabilité. La détermination précise des charophytes au niveau de l'espèce est importante sous de nombreux aspects, mais les caractéristiques taxonomiques morphologiques communes dans certains cas, en particulier entre des taxons morphologiquement similaires, peuvent être insuffisantes ou trompeuses. L'objectif de notre étude était de créer une analyse comparative des paramètres morphométriques des oospores de taxons morphologiquement similaires comme Chara globularis Thuil. et C. “connivens” P.Salzmann ex A.Braun, ou C. braunii C.C.Gmel. et C. baueri A.Braun (Serbie). Le potentiel d'application des caractéristiques des oospores dans la délimitation des espèces a été évalué, ainsi que la variabilité interpopulations des paramètres des oospores dans les populations géographiquement éloignées de C. globularis et C. braunii. Les paramètres courants des oospores (hauteur des oospores, largeur des oospores, nombre de crêtes, largeur du sillon et distance entre le pôle apical de l'oospore et de sa partie la plus large) ont été mesurés et les indices ISI et ANI ont été calculés. La variabilité interpopulations et les différences interspécifiques ont été confirmé","PeriodicalId":51000,"journal":{"name":"Cryptogamie Algologie","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":1.3,"publicationDate":"2022-11-16","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"89756508","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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