夏威夷Amansia glomerata C.Agardh (Ceramiales, Rhodomelaceae)的系统地理学:一个高分化的单一物种

IF 16.4 1区 化学 Q1 CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY
James T. Fumo, A. Sherwood
{"title":"夏威夷Amansia glomerata C.Agardh (Ceramiales, Rhodomelaceae)的系统地理学:一个高分化的单一物种","authors":"James T. Fumo, A. Sherwood","doi":"10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a4","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"ABSTRACT Algal biogeography in Hawai‘i has not been studied in detail for many species. The islands are home to swift-current deep-water channels separating suitable habitats. The ability of these channels to act as barriers to dispersal has been studied in several animal lineages and is assessed here using the widespread red alga Amansia glomerata C.Agardh. A variety of analytical techniques based on 129 mitochondrial COI barcoding sequences collected across c. 2500 km were used to assess the genetic diversity of A. glomerata in Hawai‘i. Haplotype network analyses demonstrated that the species is split into four main lineages which overlap in large parts of their range, yet there is insufficient support to recognize the lineages as separate species. Measures of haplotype diversity, nucleotide diversity, and neutrality tests suggest that at least three of these lineages have undergone recent population expansion. Biogeographic barriers were found to largely match those of marine animal groups in the archipelago. No evidence was found for distinct haplotypes or lineages between shallow and mesophotic reefs. A number of potential collection locations are suggested for the 1822 lectotype of the species, which was included in the molecular analyses. Potential scenarios leading to observed diversity patterns in the archipelago are presented. Amansia glomerata exhibits a high degree of haplotypic variation in Hawai‘i, suggesting it may exhibit vast molecular divergences across its broader range, which extends from Hawai‘i to southeastern Africa. RÉSUMÉ Phylogéographie d'Amansia glomerata C.Agardh (Ceramiales, Rhodomelaceae) à Hawai‘i: une seule espèce à forte divergence. La biogéographie des algues à Hawai‘i n'a pas été étudiée en détail pour de nombreuses espèces. Les îles abritent des chenaux rapides d'eau profonde séparant les habitats appropriés. La capacité de ces chenaux à agir comme des barrières à la dispersion a été étudiée dans plusieurs lignées animales et est évaluée ici à l'aide de l’algue très répandue Amansia glomerata C.Agardh. Une variété de techniques analytiques basées sur 129 séquences de code-barres COI mitochondriales collectées sur environ 2500 km ont été utilisées pour évaluer la diversité génétique d'A. glomerata à Hawai‘i. Les analyses du réseau d'haplotypes ont démontré que l'espèce est divisée en quatre lignées principales qui se chevauchent dans de grandes parties de leur aire de répartition, mais il n'y a pas suffisamment de soutien pour reconnaître les lignées comme plusieurs espèces. Les mesures de la diversité des haplotypes, de la diversité des nucléotides et des tests de neutralité suggèrent qu'au moins trois de ces lignées ont subi des expansions démographiques récentes. Les barrières biogéographiques correspondent largement à celles des groupes d'animaux marins de l'archipel. Aucune preuve n'a été trouvée pour des haplotypes ou des lignées distincts entre les récifs peu profonds et mésophotiques. Un certain nombre de lieux de collecte potentiels sont suggérés pour le lectotype de l’espèce de 1822, qui a été inclus dans les analyses moléculaires. Des scénarios potentiels conduisant à des modèles de diversité observés dans l’archipel sont présentés. Amansia glomerata présente un degré élevé de variation haplotypique à Hawai‘i, ce qui suggère qu’il peut présenter de vastes divergences moléculaires sur son aire de répartition plus large, qui s’étend d’Hawai‘i au sud-est de l’Afrique.","PeriodicalId":1,"journal":{"name":"Accounts of Chemical Research","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":16.4000,"publicationDate":"2023-07-19","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"Phylogeography of Amansia glomerata C.Agardh (Ceramiales, Rhodomelaceae) in Hawai‘i: A Single Species with High Divergence\",\"authors\":\"James T. Fumo, A. Sherwood\",\"doi\":\"10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a4\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"ABSTRACT Algal biogeography in Hawai‘i has not been studied in detail for many species. The islands are home to swift-current deep-water channels separating suitable habitats. The ability of these channels to act as barriers to dispersal has been studied in several animal lineages and is assessed here using the widespread red alga Amansia glomerata C.Agardh. A variety of analytical techniques based on 129 mitochondrial COI barcoding sequences collected across c. 2500 km were used to assess the genetic diversity of A. glomerata in Hawai‘i. Haplotype network analyses demonstrated that the species is split into four main lineages which overlap in large parts of their range, yet there is insufficient support to recognize the lineages as separate species. Measures of haplotype diversity, nucleotide diversity, and neutrality tests suggest that at least three of these lineages have undergone recent population expansion. Biogeographic barriers were found to largely match those of marine animal groups in the archipelago. No evidence was found for distinct haplotypes or lineages between shallow and mesophotic reefs. A number of potential collection locations are suggested for the 1822 lectotype of the species, which was included in the molecular analyses. Potential scenarios leading to observed diversity patterns in the archipelago are presented. Amansia glomerata exhibits a high degree of haplotypic variation in Hawai‘i, suggesting it may exhibit vast molecular divergences across its broader range, which extends from Hawai‘i to southeastern Africa. RÉSUMÉ Phylogéographie d'Amansia glomerata C.Agardh (Ceramiales, Rhodomelaceae) à Hawai‘i: une seule espèce à forte divergence. La biogéographie des algues à Hawai‘i n'a pas été étudiée en détail pour de nombreuses espèces. Les îles abritent des chenaux rapides d'eau profonde séparant les habitats appropriés. La capacité de ces chenaux à agir comme des barrières à la dispersion a été étudiée dans plusieurs lignées animales et est évaluée ici à l'aide de l’algue très répandue Amansia glomerata C.Agardh. Une variété de techniques analytiques basées sur 129 séquences de code-barres COI mitochondriales collectées sur environ 2500 km ont été utilisées pour évaluer la diversité génétique d'A. glomerata à Hawai‘i. Les analyses du réseau d'haplotypes ont démontré que l'espèce est divisée en quatre lignées principales qui se chevauchent dans de grandes parties de leur aire de répartition, mais il n'y a pas suffisamment de soutien pour reconnaître les lignées comme plusieurs espèces. Les mesures de la diversité des haplotypes, de la diversité des nucléotides et des tests de neutralité suggèrent qu'au moins trois de ces lignées ont subi des expansions démographiques récentes. Les barrières biogéographiques correspondent largement à celles des groupes d'animaux marins de l'archipel. Aucune preuve n'a été trouvée pour des haplotypes ou des lignées distincts entre les récifs peu profonds et mésophotiques. Un certain nombre de lieux de collecte potentiels sont suggérés pour le lectotype de l’espèce de 1822, qui a été inclus dans les analyses moléculaires. Des scénarios potentiels conduisant à des modèles de diversité observés dans l’archipel sont présentés. Amansia glomerata présente un degré élevé de variation haplotypique à Hawai‘i, ce qui suggère qu’il peut présenter de vastes divergences moléculaires sur son aire de répartition plus large, qui s’étend d’Hawai‘i au sud-est de l’Afrique.\",\"PeriodicalId\":1,\"journal\":{\"name\":\"Accounts of Chemical Research\",\"volume\":null,\"pages\":null},\"PeriodicalIF\":16.4000,\"publicationDate\":\"2023-07-19\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"0\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"Accounts of Chemical Research\",\"FirstCategoryId\":\"99\",\"ListUrlMain\":\"https://doi.org/10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a4\",\"RegionNum\":1,\"RegionCategory\":\"化学\",\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"Q1\",\"JCRName\":\"CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Accounts of Chemical Research","FirstCategoryId":"99","ListUrlMain":"https://doi.org/10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a4","RegionNum":1,"RegionCategory":"化学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"Q1","JCRName":"CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0

摘要

夏威夷许多种类的藻类生物地理尚未得到详细研究。这些岛屿上有水流湍急的深水通道,分隔着适宜的栖息地。这些通道作为扩散障碍的能力已经在几个动物谱系中进行了研究,并在这里使用广泛分布的红藻Amansia glomerata C.Agardh进行评估。利用收集的129条线粒体COI条形码序列,利用多种分析技术对夏威夷A. glomerata的遗传多样性进行了评估。单倍型网络分析表明,该物种分为四个主要谱系,这些谱系在其活动范围的大部分重叠,但没有足够的证据支持将这些谱系视为单独的物种。单倍型多样性、核苷酸多样性和中性测试的测量表明,这些谱系中至少有三个经历了最近的种群扩张。研究发现,生物地理屏障与群岛上的海洋动物群体基本吻合。没有证据表明浅层和中孔珊瑚礁之间存在明显的单倍型或谱系。在分子分析中,提出了该物种1822选型的一些潜在收集点。提出了导致观察到的群岛多样性模式的潜在情景。在夏威夷,amarsia glomerata表现出高度的单倍型变异,这表明它可能在从夏威夷延伸到非洲东南部的更广泛的范围内表现出巨大的分子差异。RÉSUMÉ phyloggraphie d'Amansia glomerata C.Agardh (Ceramiales, Rhodomelaceae) 夏威夷:一个seule espce forte divergence。La biogsamographie des algues Hawai 'a pas samoest . samoest . samoest . en . samoest . de nombreuses esp。Les abrient des chenaux rapides d'eau proprode samsament Les。我的职业生涯有三个方面:1 .我的职业生涯有三个方面:1 .我的职业生涯有几个方面:1 .我的职业生涯有几个方面:1 .我的职业生涯有几个方面:1 .我的职业生涯有几个方面:1 .我的职业生涯有几个方面:1 .我的职业生涯有几个方面:1 .我的职业生涯有几个方面。Une variacest de techniques analytiques, basemes sur 129, basemques de code-barres COI线粒体,收集了2500 km范围内的basemes sur environment;glomerata,夏威夷。所有的分析都是基于单体型的,所有的数据都是基于单体型的,所有的数据都是基于单体型的,所有的数据都是基于单体型的,所有的数据都是基于单体型的,所有的数据都基于单体型的,所有的数据都是基于单体型的。单倍型多样性测量法、核型多样性测量法和中性型测试法都表明,单倍型的多样性测量法、核型的多样性测量法和中性型的测试法都表明,单倍型的多样性测量法和扩展型的扩展测量法都表明,单倍型的多样性测量法和中性型的测试法都表明,单倍型的多样性测量法和中性型的测试法都表明。《生物障碍学》对应于《海洋动物类群》的大型细胞。三种不同的单倍型,三种不同的单倍型,三种不同的单倍型,三种不同的单倍型,三种不同的单倍型,三种不同的单倍型。在某些情况下,收集潜力的人认为,在1822年的一项调查中,有一些人认为, - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -根据不同的模数,观察到不同的模数和不同的模数,所有的模数都是相同的。Amansia glomerata pracente undegre度的变异单倍型的夏威夷,ce qui建议,qui ' il pet pracente de vases的差异,moacimculaires sur sonaire de的变异,加上大的,qui ' s的samtend d '夏威夷和西南非洲。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
Phylogeography of Amansia glomerata C.Agardh (Ceramiales, Rhodomelaceae) in Hawai‘i: A Single Species with High Divergence
ABSTRACT Algal biogeography in Hawai‘i has not been studied in detail for many species. The islands are home to swift-current deep-water channels separating suitable habitats. The ability of these channels to act as barriers to dispersal has been studied in several animal lineages and is assessed here using the widespread red alga Amansia glomerata C.Agardh. A variety of analytical techniques based on 129 mitochondrial COI barcoding sequences collected across c. 2500 km were used to assess the genetic diversity of A. glomerata in Hawai‘i. Haplotype network analyses demonstrated that the species is split into four main lineages which overlap in large parts of their range, yet there is insufficient support to recognize the lineages as separate species. Measures of haplotype diversity, nucleotide diversity, and neutrality tests suggest that at least three of these lineages have undergone recent population expansion. Biogeographic barriers were found to largely match those of marine animal groups in the archipelago. No evidence was found for distinct haplotypes or lineages between shallow and mesophotic reefs. A number of potential collection locations are suggested for the 1822 lectotype of the species, which was included in the molecular analyses. Potential scenarios leading to observed diversity patterns in the archipelago are presented. Amansia glomerata exhibits a high degree of haplotypic variation in Hawai‘i, suggesting it may exhibit vast molecular divergences across its broader range, which extends from Hawai‘i to southeastern Africa. RÉSUMÉ Phylogéographie d'Amansia glomerata C.Agardh (Ceramiales, Rhodomelaceae) à Hawai‘i: une seule espèce à forte divergence. La biogéographie des algues à Hawai‘i n'a pas été étudiée en détail pour de nombreuses espèces. Les îles abritent des chenaux rapides d'eau profonde séparant les habitats appropriés. La capacité de ces chenaux à agir comme des barrières à la dispersion a été étudiée dans plusieurs lignées animales et est évaluée ici à l'aide de l’algue très répandue Amansia glomerata C.Agardh. Une variété de techniques analytiques basées sur 129 séquences de code-barres COI mitochondriales collectées sur environ 2500 km ont été utilisées pour évaluer la diversité génétique d'A. glomerata à Hawai‘i. Les analyses du réseau d'haplotypes ont démontré que l'espèce est divisée en quatre lignées principales qui se chevauchent dans de grandes parties de leur aire de répartition, mais il n'y a pas suffisamment de soutien pour reconnaître les lignées comme plusieurs espèces. Les mesures de la diversité des haplotypes, de la diversité des nucléotides et des tests de neutralité suggèrent qu'au moins trois de ces lignées ont subi des expansions démographiques récentes. Les barrières biogéographiques correspondent largement à celles des groupes d'animaux marins de l'archipel. Aucune preuve n'a été trouvée pour des haplotypes ou des lignées distincts entre les récifs peu profonds et mésophotiques. Un certain nombre de lieux de collecte potentiels sont suggérés pour le lectotype de l’espèce de 1822, qui a été inclus dans les analyses moléculaires. Des scénarios potentiels conduisant à des modèles de diversité observés dans l’archipel sont présentés. Amansia glomerata présente un degré élevé de variation haplotypique à Hawai‘i, ce qui suggère qu’il peut présenter de vastes divergences moléculaires sur son aire de répartition plus large, qui s’étend d’Hawai‘i au sud-est de l’Afrique.
求助全文
通过发布文献求助,成功后即可免费获取论文全文。 去求助
来源期刊
Accounts of Chemical Research
Accounts of Chemical Research 化学-化学综合
CiteScore
31.40
自引率
1.10%
发文量
312
审稿时长
2 months
期刊介绍: Accounts of Chemical Research presents short, concise and critical articles offering easy-to-read overviews of basic research and applications in all areas of chemistry and biochemistry. These short reviews focus on research from the author’s own laboratory and are designed to teach the reader about a research project. In addition, Accounts of Chemical Research publishes commentaries that give an informed opinion on a current research problem. Special Issues online are devoted to a single topic of unusual activity and significance. Accounts of Chemical Research replaces the traditional article abstract with an article "Conspectus." These entries synopsize the research affording the reader a closer look at the content and significance of an article. Through this provision of a more detailed description of the article contents, the Conspectus enhances the article's discoverability by search engines and the exposure for the research.
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术官方微信