Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika最新文献

{"title":"Estimation of the frequency of recombination in the inversion loop in a carrier of polymorphic paracentric inversion 8p23.1","authors":"Юрченко, Д.А., Тарлычева, А.А., Миньженкова, М.Е., Маркова, Ж.Г., Шилова, Н.В.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.12.60-63","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.12.60-63","url":null,"abstract":"Парацентрическая инверсия 8р23.1 является одной из самых протяженных полиморфных инверсий у человека. В результате патологической мейотической сегрегации парацентрической инверсии образуются гаметы и впоследствии зиготы с рекомбинантными хромосомами, а именно с хромосомным/геномным дисбалансом в виде инвертированной дупликации со смежной делецией (inv dup del) или с терминальной делецией (del). В исследовании впервые проведена оценка частоты рекомбинации в инверсионной петле у носителя полиморфной парацентрической инверсии 8р23.1. Установлено, что в мужском гаметогенезе при гетерозиготном носительстве данной инверсии частота мейотической рекомбинации составляет 0,03%.\u0000 The 8p23.1 paracentric inversion is the largest polymorphic inversion in the human genome. As a result of meiotic malsegregation of paracentric inversion, gametes and subsequently zygotes are formed with recombinant chromosomes, namely with a chromosomal genomic imbalance such as an inverted duplication with an adjacent deletion (inv dup del) or with a terminal deletion (del). In this study, for the first time, the frequency of recombination in the inversion loop was estimated in a carrier of polymorphic paracentric inversion 8p23.1. It was shown that the frequency with which meiotic recombination happens in male gametogenesis is 0.03%.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"217 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-12-26","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"123097962","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"Selective inhibition of LRRK2 activity as an approach to the treatment of Parkinson's disease","authors":"Усенко, Т.С., Башарова, К.С., Безрукова, А.И., Николаев, М.А., Милюхина, И.В., Байдакова, Г.В., Захарова, Е.Ю., Пчелина, С.Н.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.12.26-29","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.12.26-29","url":null,"abstract":"На сегодняшний день не существует нейропротекторных препаратов для лечения распространённого нейродегенеративного заболевания болезни Паркинсона (БП). Наиболее перспективной для разработки тагретной терапии считается форма БП, ассоциированная с мутациями в гене GBA (GBA-БП), как самая распространенная форма БП с известной этиологией. Мутации в гене GBA, кодирующем фермент глюкоцереброзидазу (GCase), приводят к снижению активности данного фермента. Ранее было показано, что ингибирование киназной активности LRRK2 ингибитором MLi-2 приводит к увеличению активности GCase. В данном исследовании мы впервые показали влияние ингибитора киназной активности LRRK2 MLi-2 не только на активность GCase, но и на активность других лизосомных ферментов в первичной культуре макрофагов периферической крови пациентов не только с LRRK2-ассоциированной БП (LRRK2-БП), но и с GBA-БП.\u0000 To date, there are no neuroprotective drugs for the common neurodegenerative disease, Parkinson’s disease (PD). PD associated with mutations in the GBA gene (GBA-PD) is the most common form of PD with a known etiology. GBA-PD is considered the most promising for the development of therapy for PD. Mutations in the GBA gene encoding the enzyme glucocerebrosidase (GCase) lead to a decrease in the activity of this enzyme. Previously, it was shown that inhibition of LRRK2 kinase activity by MLi-2 inhibitor leads to an increase in GCase activity. In this study, we showed for the first time the effect of the LRRK2 kinase activity inhibitor MLi-2 not only on the activity of GCase, but also on the activity of other lysosomal enzymes in the primary culture of peripheral blood macrophages of patients with LRRK2-associated PD (LRRK2-PD) and GBA-PD.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"108 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-12-26","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"115814253","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"Сhronic exposure effect on the telomere regions of the chromosomes of the human peripheral blood lymphocytes","authors":"Кривощапова, Я.В.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.11.40-43","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.11.40-43","url":null,"abstract":"Цель работы состояла в исследовании влияния хронического облучения и нерадиационного фактора (пола) на показатель длины теломерных районов хромосом человека. Объект исследования: Т-клетки периферической крови жителей прибрежных сел реки Теча, подвергшихся хроническому облучению. Была проведена оценка теломерных районов 1, 2, 3, 13, 14, 15, 19, 20, 21 и 22 пар хромосом методом флуоресцентного окрашивания (Q-FISH) теломер в комбинации с контрокрашиванием DAPI. В результате проведенного исследования было отмечено, что длина теломер в одной клетке широко варьируется, а размер теломерного района не зависит от длины хромосомы или хромосомного плеча, на котором он расположен. У мужчин показатель длины теломер имеет достоверно более высокие значения по сравнению с женщинами. В группе сравнения длина теломерных районов во многих хромосомах достоверно превышала таковую в группе облученных.\u0000 The aim of the research was to study the influence of the chronic radiation exposure and non-radiation factors on the length of the telomere regions of the human chromosomes. The object of the study: peripheral blood T-cells of the chronically exposed residents of the Techa riverside settlements. The length of the telomere regions of the 1st, 2nd, 3rd, 13th, 14th, 15th,19th, 20th, 21st and 22nd pair of chromosomes has been estimated using the method of fluorescent staining (Q-FISH) of the telomeres coupled with DAPI counterstaining. The findings of the study demonstrate that the length of the telomeres in one cell varies greatly; the size of the telomere region does not depend on the length of a chromosome or a chromosome arm where it is located. The value of the telomere length in men is statistically significantly high as compared to women. In the comparison group, the length of the telomere regions in many chromosomes statistically significantly exceeds that in the exposed group.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"37 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-11-30","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"123248646","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"Prenatal diagnostics: a 10-year overview","authors":"Гайнер, Т.А., Каримова, О.Г., Таирова, С.А., Хрестина, С.В.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.11.27-31","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.11.27-31","url":null,"abstract":"Введение. Отклонение от нормы количества или структуры хромосом является одной из причин нарушения развития плода. Около 0,5% новорожденных имеют хромосомные болезни, как правило, имеющие тяжелое течение. Ввиду этого огромное значение имеет пренатальная диагностика (ПД) хромосомных аномалий. В статье описаны преимущества разработанного в цитогенетической лаборатории ГК «ЦНМТ» способа культивирования клеток амниотической жидкости (АЖ), а также подводятся итоги работы лаборатории по исследованиям кариотипа плода за 10 лет. Целью исследования стало проведение ПД хромосомной патологии методами классической цитогенетики в максимально краткие сроки с использованием высокого уровня разрешения дифференциального окрашивания хромосом. Методы. Материал - образцы пуповинной крови, ворсин хориона/плаценты либо АЖ. Культивирование, приготовление препаратов метафазных хромосом и дифференциальное окрашивание хромосом проводили по стандартным протоколам. Окрашенные хромосомы анализировали с помощью светового микроскопа, для регистрации изображения использовали видеокамеру и соответствующее программное обеспечение. При описании хромосом использовали ISCN (2009). Результаты. Специалистами лаборатории разработан способ, позволяющий сократить срок культивирования клеток АЖ до 8-13 дней, на него получен патент РФ. За десять лет было выполнено 228 исследований кариотипа плода, патология выявлена в 11,8% случаев. В лаборатории для всех видов ПД результативность составила 100%. Среди выявленной патологии доля структурных аномалий составила 40,7%. Выводы. Оптимизация культивирования клеток АЖ позволяет быстро и в полном объеме провести анализ кариотипа плода. Полученные за десять лет результаты свидетельствуют о высокой эффективности работы лаборатории при проведении ПД.\u0000 Introduction. Abnormal number or structure of chromosomes is known to be one of the reasons of birth defects. About 0.5% of newborns are known to display chromosomal diseases [1], which are as a rule, have severe manifestation. Clearly then, prenatal diagnostics (PD) of chromosomal anomalies is of vital importance. Here, we describe the advantages of the approach for cultivating the amniotic fluid (AF) cells, which has been developed in the cytogenetics lab of the CNMT, and summarize the results of karyotyping data spanning the period of 10 years. Aim: to perform PD of chromosomal pathologies using the classical cytogenetics methods, and to do so with the shortest turnaround time possible using high-resolution differential chromosome staining technique. Methods. Cord blood samples, chorionic/placental villi or AF. Ex vivo cell culture, metaphase chromosome spreads, differential chromosome staining using standard protocols. The stained chromosomes were analyzed under a light microscope and images were captured using a videocamera and processed with appropriate software. ISCN (2009) was used for chromosome descriptions. Results. Laboratory associates have developed and patented the approach to shorten the ","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"38 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-11-30","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"121909123","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"Epigenomic changes in peripheral blood leukocytes in patients with hypertension and dyscirculatory encephalopathy","authors":"Сучкова, И.О., Дергачева, Н.И., Соколова, В.А., Фирова, Э.М., Мамедова, З.Э., Мещерякова, Н.Г., Агибалова, Л.Т., Шурпа, С.Л., Сасина, Л.К., Баранова, Т.В., Муружева, З.М., Татаринов, А.Е., Паткин, Е.Л.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.11.67-70","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.11.67-70","url":null,"abstract":"В настоящее время эпигеномный ландшафт, лежащий в основе гипертонической болезни и дисциркуляторной энцефалопатии, мало изучен. Идентификация эпигенетического паттерна в комплексе с генетическим паспортом индивида может предоставить дополнительную информацию об этиологии заболеваний и риске развития осложнений, а также о выборе стратегии и тактики лечения. В представленной работе проведена количественная оценка уровня полногеномного метилирования ДНК и степени компактизации хроматина в лейкоцитах периферической крови у пациентов с гипертонической болезнью и дисциркуляторной энцефалопатией и здоровых добровольцев из Санкт-Петербурга. У пациентов с гипертонической болезнью выявлены гендерные различия в риске развития дисциркуляторной энцефалопатии. По сравнению с контролем при гипертонической болезни повышены уровень метилирования ДНК и степень компактизации хроматина. В исследованных группах у мужчин и женщин обнаружена различная эпигеномная реакция лейкоцитов на лекарственную терапию при данных заболеваниях.\u0000 Currently, the epigenomic landscape underlying hypertension and dyscirculatory encephalopathy is poorly understood. Identification of the epigenetic pattern in combination with genetic passport can provide additional information about the etiology of diseases and the risk of complications, as well as the choice of strategy and tactics of treatment. We carried out a quantitative assessment of the level of genome-wide DNA methylation and the degree of chromatin compaction in peripheral blood leukocytes in patients with hypertension and dyscirculatory encephalopathy, and also in healthy volunteers from St. Petersburg. Gender differences in the risk of developing dyscirculatory encephalopathy were revealed in patients with hypertension. It was found that the level of DNA methylation and the degree of chromatin compaction are increased in hypertension (compared to control). In the studied groups, men and women showed different epigenomic reactions of leukocytes to drug therapy in these pathologies.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"11 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-11-30","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"115393783","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"The cytogenetic diagnostics of chronic lymphoproliferative diseases using locus-specific fluorescent probes","authors":"Возилова, А.В., Бойко, Д.В.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.11.23-26","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.11.23-26","url":null,"abstract":"Цитогенетическое исследование клеток костного мозга или периферической крови у лиц с лимфопролиферативными заболеваниями является обязательным и необходимым. Результаты помогают врачу с ранней диагностикой заболевания и выбором тактики лечения. Современные молекулярно-цитогенетические подходы, основанные на применении локусспецифичных флуоресцентных зондов (метод FISH), дают возможность быстро получить точную информацию о наличии или отсутствии наиболее распространенных мутаций при определенных нозологиях. Целью настоящей работы является анализ собственных данных цитогенетического обследования c применением «коктейля» из 5 локусспецифичных флуоресцентных зондов лиц с лимфопролиферативными заболеваниями, большая часть которых имела диагноз хронический лимфолейкоз. Цитогенетическое исследование было проведено 16 пациентам в период с 2014 г. по 2022 г. в лаборатории радиационной генетики ФГБУН УНПЦ РМ. Использовали коктейль локусспецифичных зондов: ATM (11q22)/TP53 (17p13), DLEU (13q14)/LAMP (13q34) и cen 12 (12p11.1;12q11.1). 75% обследованных лиц были носителями мутаций. Наиболее часто встречались мутации del17p13 (50%), del13q14 (50%). Считаем, что при наличии у пациента мутации в 13q14 необходимо провести дополнительно исследование на del 13q14.2 (RB1).\u0000 The cytogenetic assay of bone marrow or peripheral blood cells in persons with lymphoproliferative diseases is mandatory and necessary. The results help a doctor with the diagnosis of the disease and the choice of treatment tactics as early as possible after the patient’s visit to the hematologist. Modern molecular cytogenetic approaches based on the use of locus-specific fluorescent probes (FISH method) make it possible to quickly and accurately obtain information about the presence or absence of the most common mutations. The aim of this work is to analyze our cytogenetic data given with a “cocktail” of 5 locus-specific fluorescent probes in individuals with lymphoproliferative diseases, most of whom were diagnosed with CLL. A cytogenetic study was conducted in 16 patients in the period 2014 - 2022 in the Laboratory of Radiation Genetics of the URCRM. A cocktail of locus-specific probes was used: ATM (11q22)/TP53 (17p13) and DLEU (13q14)/LAMP (13q34) and cen 12 (12p11.1;12q11.1). Seventy five percent of the examined individuals were carriers of mutations. The most common mutations were del17p13 (50%), del13q14 (50%). We believe that if a patient has a mutation in 13q14, it is necessary to conduct an additional study on del13q14.2 (RB1).","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"11 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-11-30","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"126199434","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"Study of the bacterial microbiome of sputum of patients with lung cancer and its association with chromosome damage in peripheral blood lymphocytes","authors":"Баранова, Е.Д., Дружинин, В.Г.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.11.16-18","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.11.16-18","url":null,"abstract":"Микробиом респираторного тракта может оказывать значимое влияние на развитие ряда заболеваний дыхательной системы человека. Помимо дисбиотических изменений в составе микробиома пациентов отмечено, что многие бактерии обладают генотоксическим потенциалом и способны прямо или опосредованно повреждать геном в клетках организма хозяина. Цель исследования - изучить связь между составом микробиома мокроты и уровнем повреждений хромосом в лейкоцитах крови больных раком легкого (РЛ). Изучены таксономический состав бактериального микробиома мокроты, а также базовые частоты хромосомных аберраций (ХА) и микроядер (МЯ) в лимфоцитах крови 66 мужчин с диагнозом РЛ и у 62 здоровых доноров. Результаты секвенирования показали, что микробиом больных РЛ имеет признаки дисбиоза с достоверным увеличением содержания бактерий родов Streptococcus, Bacillus, Gemella и Haemophilus. У пациентов с РЛ выявлена прямая связь между частотой аберрантных метафаз в лимфоцитах и процентным содержанием в мокроте представителей рода Bacteroides.\u0000 The microbiome of the respiratory tract can have a significant impact on the development of a number of diseases of the human respiratory system. In addition to dysbiotic changes in the composition of the microbiome of patients, it was noted that many bacteria have a genotoxic potential and are able to directly or indirectly damage the genome in the cells of the host organism. The aim of the study was to study the relationship between the composition of the sputum microbiome and the level of chromosome damage in the blood leukocytes of patients with lung cancer (LC). The taxonomic composition of the sputum bacterial microbiome, as well as the basic frequencies of chromosomal aberrations (CA) and micronuclei (MN) in blood lymphocytes of 66 men diagnosed with LC and 62 healthy donors were studied. The results of sequencing showed that the microbiome of LC patients has signs of dysbiosis with a significant increase in the content of bacteria of the genera Streptococcus, Bacillus, Gemella and Haemophilus. In patients with LC, a direct relationship was found between the frequency of aberrant metaphases in lymphocytes and the percentage of representatives of the genus Bacteroides in sputum.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"18 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-11-30","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"133378923","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"Dynamic Tissue-Specific Mosaicism of a ring chromosome","authors":"Шилова, Н.В., Миньженкова, М.Е., Маркова, Ж.Г., Тарлычева, А.А., Юрченко, Д.А., Табаков, В.Ю., Боровиков, А.О.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.11.56-58","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.11.56-58","url":null,"abstract":"Кольцевая хромосома 13 является редкой структурной хромосомной аномалией. Изменение структуры хромосомы из линейной в кольцевую вызывает ее митотическую нестабильность, приводящую к соматическому динамическому мозаицизму вследствие которого формируются клоны клеток с различным вторичными числовыми и структурными хромосомными перестройками. Цитогеномный анализ культивированных лимфоцитов и фибробластов кожи в представленном случае кольцевой хромосомы 13 в кариотипе пациента с задержкой физического развития, микроцефалией и аномалиями развития выявил различную структуру вторичного геномного дисбаланса, вариабельный уровень динамического мозаицизма и избирательную эволюцию кариотипа.\u0000 Ring chromosome 13 is a rare type of chromosome structural abnormalities. A change in the linear structure of the chromosome into a circular one causes its mitotic instability, leading to somatic dynamic mosaicism, which results in the formation of cell clones with various secondary numerical and structural chromosomal rearrangements. We report here a study on ring chromosome 13 instability in lymphocyte and fibroblast cultures established from a child with developmental delay, microcephaly and congenital abnormalities. The cytogenomic analysis revealed a different structure of secondary genomic imbalance, variable levels of dynamic mosaicism and selective karyotype evolution.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"50 222","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-11-30","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"113961160","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"Complex analysis of p53-responsive microRNA genes methylation and TР53 gene mutations in Diffuse Large B-cell Lymphoma","authors":"Воропаева, Е.Н., Поспелова, Т.И., Чуркина, М.И., Гуражева, А.А., Воевода, М.И., Максимов, В.Н.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.11.62-66","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.11.62-66","url":null,"abstract":"Актуальность. Сравнение экспрессии микроРНК в опухолевой ткани лимфом и нормальной лимфоидной ткани выявило снижение уровня экспрессии ряда р53-индуцируемых онкосупрессорных молекул, таких как микроРНК-34a, микроРНК-34b/c, микроРНК-129 и микроРНК-203, которое помимо мутаций в гене ТР53 может быть вызвано аберрациями в участках генома, кодирующих сами микроРНК. Цель. Провести комплексный анализ метилирования генов р53-респонзивных микроРНК MIR-34А, MIR-34В/С, MIR-203 и MIR-129-2 и мутаций гена ТР53 при диффузной В-клеточной крупноклеточной лимфоме (ДВККЛ). Методы. Проанализировано 73 образца ДНК, выделенной из опухолевой ткани пациентов с ДВККЛ. Методом капиллярного прямого секвенирования по Сэнгеру определена нуклеотидная последовательность ДНК-связывающего домена гена ТР53. Определение статуса метилирования осуществляли методами метил-специфичной ПЦР (для MIR-203 и MIR-129-2) и метил-чувствительного анализа кривых плавления высокого разрешения (для MIR-34А и MIR-34В/С) с применением ДНК, подвергшейся обработке бисульфитом натрия. Результаты. Частота метилирования генов MIR-34А, MIR-34В/С, MIR-203 и MIR-129-2 и мутации в гене ТР53 составила 27%, 62%, 66%, 67% и 25%, соответственно. Метилирование анализируемых генов р53-респонзивных микроРНК и мутации в гене ТР53 в опухолевой ткани ДВККЛ у большей части пациентов имели тенденцию к взаимному исключению. Показана значимая ассоциация (р<0,05) между метилированием генов MIR-203, MIR-129-2 и MIR-34B/C, а также парой MIR-34B/C и MIR-34A. В 14% случаев имело место метилирование всех 4, а в 47% - 3 проанализированных генов. Выводы. Наряду с мутациями в гене ТР53, аберрантное метилирование может являться самостоятельной причиной снижения экспрессии микроРНК-34a, микроРНК-34b/c, микроРНК-129 и микроРНК-203. Метилирование генов MIR-34А, MIR-34В/С, MIR-203 и MIR-129-2 в опухолевой ткани ДВККЛ в большинстве случаев носит сочетанный характер.\u0000 Relevance. Comparison of microRNA expression in lymphoma and normal lymphoid tissue revealed a decrease in the expression level of a number of p53-induced oncosuppressive molecules, such as miR-34a, miR-34b/c, miR-129 and miR-203, which, in addition to mutations in the TP53 gene, can be caused by aberrations in the genome regions encoding the microRNAs themselves. Purpose. To carry out a comprehensive analysis of the p53-responsive microRNAs genes MIR-34A, MIR-34B/C, MIR-203 and MIR-129-2 methylation and mutations of the TP53 gene in diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL). Methods. 73 samples of DNA isolated from tumor tissue of patients with DLBCL were analyzed. The nucleotide sequence of the TP53 gene DNA-binding domain was determined by capillary direct Sanger sequencing. The methylation status was determined by methyl-specific PCR (for MIR-203 and MIR-129-2) and methyl-sensitive analysis of high-resolution melting curves (for MIR-34A and MIR-34B/C) using DNA treated with sodium bisulfite. Results. The frequency of MIR-34A, MIR-34B/C, MIR-203 and MIR-129-2 genes methyla","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"48 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-11-30","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"130396592","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"Diagnosis of X-linked CNV in families with intellectual disorders","authors":"Толмачева, Е.Н., Кашеварова, А.А., Беляева, Е.О., Салюкова, О.А., Фонова, Е.А., Лопаткина, М.Е., Федотов, Д.А., Лебедев, И.Н.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.11.48-51","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.11.48-51","url":null,"abstract":"Проведено молекулярное кариотипирование 1176 больных с задержкой нервно-психического развития и выявлено 53 пациента с Х-сцепленными CNV. На основе результатов исследования разработан и апробирован алгоритм диагностики для пациентов, несущих Х-сцепленные CNV, который предполагает анализ патогенетической значимости CNV с использованием баз данных (DGV, OMIM и DECIPHER) и исследование статуса инактивации Х-хромосомы у носительниц CNV. Предложенный комплексный подход позволяет выявлять патогенетически значимые микроперестройки на хромосоме Х в семьях и проводить для этих семей персонализированное медико-генетическое консультирование.\u0000 Molecular karyotyping of 1176 patients with neuropsychiatric development delay was performed and 53 patients with X-linked CNVs were identified. Based on the results, a diagnostic algorithm was developed and tested for patients carrying X-linked CNV. The algorithm involves the analysis of pathogenic significance of CNV using databases (DGV, OMIM and DECIPHER) and investigating the X-chromosome inactivation in CNV carriers. An integrated approach makes it possible to identify pathogenetically significant rearrangements on the X-chromosome in families and perform personalized genetic counseling for these families.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"234 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-11-30","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"122621393","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}