Journal Des Anti-Infectieux最新文献

{"title":"Diversité génétique des papillomavirus humains","authors":"A.-A. Mariaggi,&nbsp;D. Descamps,&nbsp;C. Charpentier","doi":"10.1016/j.antinf.2017.10.002","DOIUrl":"10.1016/j.antinf.2017.10.002","url":null,"abstract":"<div><p>La famille des papillomavirus humains (HPV) regroupe plus de 200 types dont certains sont à haut risque oncogène (HPVhr). Le cycle de réplication virale est conditionné par la différenciation de l’épithélium infecté. Les HPV sont classés en types, sous-types, lignées et sous-lignées selon le degré d’homologie des séquences nucléotidiques. Cette diversité génétique des HPV se reflète dans l’épidémiologie des infections à HPV avec une distribution géographique spécifique des différents variants d’un type d’HPV. La diversité génétique des HPV peut avoir un impact sur la physiopathologie de l’infection à HPV. Tout d’abord, la co-infection par plusieurs types d’HPVhr est un facteur de risque de progression vers le cancer. D’autre part, certains types, sous-types et polymorphismes sont associés à un risque accru d’évolution vers le cancer. Les nouvelles technologies de séquençage haut débit ont permis de mettre en évidence une diversité génétique également au niveau intrapatient. En effet, des travaux ont montré la présence de variants viraux minoritaires et de rares mutations G<figure><img></figure>A induites par la protéine cellulaire APOBEC. Ainsi, la diversité génétique des HPV peut avoir un impact sur la physiopathologie de l’infection. Plus récemment, avec le séquençage haut débit, il a été décrit de la variabilité génétique intrapatient, en faible proportion, dont le rôle dans la physiopathologie de l’infection HPV reste à déterminer.</p></div><div><p>More than 200 types compose the Human papillomavirus (HPV) family, some of them are high-risk oncogenic viruses and others are low-risk oncogenic viruses. The viral replication cycle is coordinated with cell differentiation. HPV are classified in types, sub-types, lineages and sub-lineages based on nucleotidic sequences. HPV epidemiology showed that HPV types, sub-types and lineages had a specific geographic distribution. Importantly, genetic diversity takes part in HPV infection physiopathology. First, co-infection with multiple HPVhr types increased the risk of cancer progression. Furthermore, some types, some lineages and some polymorphisms are associated with an increased risk of developing cancer. Recently, ultradeep sequencing technologies allowed to evidence genetic intrapatient diversity. Indeed, some studies showed the presence of minority viral variants and some rare G<figure><img></figure>A mutations generated by APOBEC cellular proteins. Thus, HPV genetic diversity can have an impact on the pathophysiology of infection. More recently, with ultradeep sequencing technologies, intrapatient genetic variability has been described, in a minority proportion, the role of which in the pathophysiology of HPV infection remains to be assessed.</p></div>","PeriodicalId":49043,"journal":{"name":"Journal Des Anti-Infectieux","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2017-12-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.antinf.2017.10.002","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"45345960","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"Schistosomose : une parasitose qui n’est plus uniquement tropicale","authors":"A. Berry,&nbsp;J. Fillaux,&nbsp;X. Iriart","doi":"10.1016/j.antinf.2017.07.001","DOIUrl":"10.1016/j.antinf.2017.07.001","url":null,"abstract":"<div><p>La schistosomose (bilharziose) est une parasitose d’importation assez fréquente, diagnostiquée le plus souvent chez des voyageurs ou migrants. La contamination se fait classiquement en zones tropicales, après exposition à une forme larvaire, la furcocercaire, présente dans certains cours d’eau ou lacs qui hébergent l’hôte intermédiaire, le bulin. En fonction de l’espèce, cette parasitose peut occasionner des atteintes très variées : uro-génitales, coliques ou hépatiques et être responsable de complications sévères après plusieurs années d’évolution : dysurie, insuffisance rénale, stérilité, cirrhose hépatique et hypertension portale. Son diagnostic n’est pas toujours aisé, car moins de 50 % des patients infectés excrètent des œufs dans les selles ou les urines, mais la mise en évidence de ces éléments par examen microscopique permet un diagnostic de certitude. De par leur meilleure sensibilité, les sérodiagnostics ont contribué à améliorer le diagnostic, même si leur interprétation nécessite une bonne expertise. Sur le plan thérapeutique, le praziquantel, lorsqu’il est prescrit précocement, assure une guérison définitive, sans séquelle. L’identification en Corse, à partir de 2014, d’un foyer de transmission de schistosomose uro-génitale avec plus d’une centaine de cas recensés, ne doit plus nous faire percevoir cette parasitose comme un danger lointain mais comme une menace bien réelle en Europe du Sud.</p></div><div><p>Schistosomiasis (bilharziasis) is a common parasitic disease, most often diagnosed in travelers or migrants. The contamination is usually done in tropical areas, after exposure to the larval stage, the furcocercaria, present in some rivers or lakes, which contains the intermediate host, the bulin. This parasite can cause different types of damage in different organs depending on the species involved: uro-genital, colic or liver. More or less quickly, complications may occur such as dysuria, renal impairment, sterility, liver cirrhosis and portal hypertension. The diagnosis is not always easy as fewer than 50 % of infected patients excrete eggs in the stool or urine, but the evidence of these elements by microscopic examination provides proof of diagnosis. Because of their better sensitivity, immunodiagnosis have contributed to improved diagnosis even if their interpretation requires good expertise. Therapeutically, praziquantel, when prescribed early, ensures a definite cure without sequelae. Identification in Corsica, from 2014, of an outbreak of uro-genital schistosomiasis with more than a hundred cases recorded, should no longer make us perceive this parasitosis as a distant danger but as a real threat in Southern Europe.</p></div>","PeriodicalId":49043,"journal":{"name":"Journal Des Anti-Infectieux","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2017-12-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.antinf.2017.07.001","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"42348640","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"The inputs of metagenomics in the diagnostic of infectious diseases","authors":"G. Durand","doi":"10.1016/j.antinf.2017.10.003","DOIUrl":"10.1016/j.antinf.2017.10.003","url":null,"abstract":"<div><p>Over the past decade, next-generation sequencing (NGS) has made tremendous progress, transforming genomic analysis and opening up for many new opportunities in infectious disease diagnosis. The ability of metagenomics to analyze microbial communities without culturing organisms has even enlarged the application potential in this ever growing field. Whether based on targeted or unbiased (shotgun) sequencing approaches, metagenomics still rely on complex laboratory workflow and computational tools. However, recent advancement in sequencing platforms, turnaround time, nucleic acid extraction, library preparation and bio informatics pipelines are now positioning metagenomics very attractively for routine application in clinical microbiology laboratories. Although the completeness and correctness of the genome reference database along with the ability to rapidly interpret the relevant information remain the key challenges for delivering actionable results. Many examples on how to use metagenomics in clinical laboratories can be found in the medical literature. While a single metagenomics analysis delivers the potential to detect rare and novel pathogens, it is however, still necessary to balance the scientific plausibility against the possibility of identifying a truly novel association pathogen–infection when interpreting results. Additionally, metagenomics has brought a revolution in the field of microbiome analysis by generating new insights into the host-microbe relationship and into the therapeutic potential of microbiota modification. Now, the fast evolution of metagenomics challenges the regulatory framework and mandates cooperation among the medical and research communities, industry and regulatory bodies to foster the development of innovative solutions aimed at integrating metagenomics into the infectious diseases diagnostic arsenal.</p></div><div><p>Ces dix dernières années, le séquençage nouvelle génération (next-generation sequencing) a réalisé d’énormes progrès, transformant l’analyse génomique et ouvrant de nombreuses opportunités dans le diagnostic des maladies infectieuses. En analysant des communautés microbiennes, sans l’étape de culture, la métagénomique élargit le champ d’applications dans ce domaine en pleine expansion. Utilisant une approche de séquençage ciblée ou totale dite « shotgun », la métagénomique repose sur un flux complexe au laboratoire et des outils bio-informatiques sophistiqués. Toutefois, les progrès concernant les plateformes de séquençage, le temps d’exécution de l’analyse, l’extraction des acides nucléiques, la préparation de la librairie et sur les outils bio-informatiques rendent désormais la métagénomique très attractive pour une utilisation en routine. Cependant, l’exhaustivité et l’exactitude des bases de références ainsi que la capacité de traiter rapidement les informations demeurent de véritables challenges pour fournir des résultats actionnables. La littérature regorge d’exemples sur l’utilisa","PeriodicalId":49043,"journal":{"name":"Journal Des Anti-Infectieux","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2017-12-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.antinf.2017.10.003","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"44589822","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"Les vaccins dans la prévention des infections associées aux soins","authors":"A. Gagneux-Brunon ,&nbsp;F. Lucht ,&nbsp;O. Launay ,&nbsp;P. Berthelot ,&nbsp;E. Botelho-Nevers","doi":"10.1016/j.antinf.2017.05.001","DOIUrl":"10.1016/j.antinf.2017.05.001","url":null,"abstract":"<div><p>Les infections associées aux soins (IAS) constituent un véritable problème de santé publique. <em>Escherichia coli</em>, <em>Staphylococcus aureus</em>, <em>Clostridium difficile</em> sont les plus souvent à l’origine des IAS. L’antibiorésistance fréquente complique encore la prise en charge et des impasses thérapeutiques existent à présent. Les mesures d’hygiène hospitalière bien qu’essentielles sont insuffisantes pour diminuer drastiquement les IAS. Ainsi, des stratégies alternatives à l’antibiothérapie s’avèrent nécessaires pour prévenir et traiter les IAS. Parmi celles-ci, la vaccination et l’immunisation passive sont probablement les plus prometteuses. Nous avons fait une mise au point sur les vaccins disponibles et en développement clinique pour lutter contre les IAS, chez les patients à risque d’IAS et les soignants. L’intérêt de la vaccination grippale et rotavirus chez les patients pour prévenir ces IAS virales a été examiné. Le développement d’un vaccin anti-<em>S.</em> <em>aureus</em>, déjà émaillé de 2 échecs est complexe. Toutefois, ces échecs ont permis d’améliorer les connaissances sur l’immunité anti-<em>S.</em> <em>aureus</em>. La mise à disposition d’un vaccin préventif anti-<em>C.</em> <em>difficile</em> semble plus proche. Pour les autres bactéries gram négatif responsables d’IAS, le développement est moins avancé. La vaccination des patients à risques d’IAS pose également des problèmes de réponse vaccinale qu’il faudra résoudre pour utiliser cette stratégie. Ainsi, la vaccination des soignants, de par l’effet de groupe permet également de prévenir les IAS. Nous faisons ici le point sur l’intérêt de la vaccination des soignants contre la rougeole, la coqueluche, la grippe, la varicelle, l’hépatite B pour réduire les IAS avec des vaccins déjà disponibles.</p></div><div><p>The burden of healthcare-associated infections (HAIs) is global and major. <em>Escherichia coli</em>, <em>Staphylococcus aureus</em>, <em>Clostridium difficile</em> are the most frequent associated pathogens. Infection control measures are crucial but not sufficient to stem the burden of HAIs. Due to antimicrobial resistance, lack of therapeutic options for treatment of totally-drug resistant organism is also observed. Therefore, alternative strategies to antimicrobial drugs are urgently needed to prevent and treat HAI. Among these strategies, vaccines and passive immunization are probably one of the most attractive. In this review, we will discuss licensed and non-licensed vaccines for HAIs at-risk patients and HCWs to prevent HAI. The benefit of Influenza and rotavirus vaccines in patients to prevent these viral IAS is reviewed. The development of an <em>S.</em> <em>aureus</em> vaccine, previously associated to failures, seem to be complicated. These failures allow however a better knowledge of <em>S.</em> <em>aureus</em> immunity. For <em>C.</em> <em>difficile</em>, the goal of obtaining a preventive vaccine seems to be near. Development of vaccines","PeriodicalId":49043,"journal":{"name":"Journal Des Anti-Infectieux","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2017-12-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.antinf.2017.05.001","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"43708322","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"OA","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"Abcès du foie","authors":"E. Lafont ,&nbsp;G. Rossi ,&nbsp;B. Rossi ,&nbsp;O. Roux ,&nbsp;V. de Lastours ,&nbsp;V. Zarrouk ,&nbsp;S. Dokmak ,&nbsp;M. Ronot ,&nbsp;V. Leflon ,&nbsp;A. Lefort","doi":"10.1016/j.antinf.2017.08.001","DOIUrl":"10.1016/j.antinf.2017.08.001","url":null,"abstract":"<div><p>Le foie est l’organe le plus à même de développer des abcès. L’abcès hépatique (AH) est une maladie rare, touchant principalement les hommes de 60 ans avec plusieurs comorbidités, notamment diabète, transplantation hépatique et néoplasie digestive. Les principales causes de formation des AH sont l’obstacle biliaire (néoplasie, lithiase, cholangite ischémique), ou un foyer infectieux d’origine portale ou systémique. Les AH d’origine biliaire ou portale sont souvent polymicrobiens et les germes retrouvés sont des entérobactéries, des bacilles à Gram négatif anaérobies, <em>Enterococcus</em> sp., <em>Streptococcus</em> sp. Les AH d’origine systémique sont généralement monomicrobiens ; l’AH à <em>Klebsiella pneumoniae</em> hypervirulente, maladie émergente en Asie du Sud Est depuis quelques années, est maintenant rapporté dans le monde entier. Les AH à bacille à Gram négatif non fermentant, et les AH fongiques sont plus rares, et touchent des patients immunodéprimés, dans des contextes d’infections associées aux soins. Le diagnostic d’AH repose sur l’imagerie (échographie ou scanner). Pour rechercher la porte d’entrée de l’AH, il est nécessaire de pratiquer une exploration fine des voies biliaires, et du tube digestif (échographie, scanner<!--> <!-->±<!--> <!-->endoscopie). La documentation microbiologique est essentielle pour optimiser le traitement. Pour ce faire, il faut associer les hémocultures périphériques à la culture du pus de l’AH en respectant les conditions strictes d’anaérobiose. Le traitement repose sur le drainage de l’AH (par ponction simple ou associée à la pose d’un drain), une antibiothérapie prolongée et le traitement de la porte d’entrée. Les AH d’origine biliaire ont des taux de récidive et de mortalité plus élevés que les AH d’origine extrabiliaire.</p></div><div><p>Liver abscess (HA) is a rare disease affecting mainly 60-year-old men with several comorbidities (diabetes mellitus, liver transplantation, neoplasia). Biliary obstruction is the main cause of HA. Biliary HA and portal HA are often polymicrobial (<em>Enterobacteriaceae</em>, Gram-negative anaerobic bacilli, <em>Enterococcus</em> sp., <em>Streptococcus</em> sp.). Non-fermenting Gram-negative bacillus HA, and fungal HA are health care-associated infections affecting immunosuppressed patients. HA diagnosis is based on imaging (ultrasound or scanner). To find HA origin, both biliary tract and gut tract need to be explored (ultrasound, scan<!--> <!-->±<!--> <!-->endoscopy). Peripheral blood cultures and HA pus culture should be associated to optimize microbiological documentation. HA treatment is based on percutaneous drainage, antibiotherapy, and treatment of the primary source.</p></div>","PeriodicalId":49043,"journal":{"name":"Journal Des Anti-Infectieux","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2017-12-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.antinf.2017.08.001","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"43377723","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"Résistance aux azolés chez Aspergillus","authors":"H. Guegan ,&nbsp;J.-P. Gangneux","doi":"10.1016/j.antinf.2017.10.001","DOIUrl":"10.1016/j.antinf.2017.10.001","url":null,"abstract":"<div><p>Au sein du genre <em>Aspergillus</em>, l’espèce <em>Aspergillus fumigatus</em> est responsable d’un large spectre de pathologies pulmonaires, allant de formes chroniques et/ou immuno-allergiques chez le patient immunocompétent, à des tableaux invasifs sévères chez le patient immunodéprimé (aspergillose invasive [AI]). Les antifongiques triazolés sont utilisés à la fois en première ligne de traitement de l’AI (voriconazole), ou en prophylaxie. Cependant, depuis le début des années 2000, l’émergence d’isolats cliniques et environnementaux d’<em>A.</em> <em>fumigatus</em> résistants aux azolés est décrite en Europe, remettant en cause la place centrale des azolés dans la prise en charge thérapeutique des aspergilloses. Le principal mécanisme de résistance implique des mutations dans le gène <em>cyp51A</em>, codant l’enzyme cible des azolés (lanostérol 14α-démétylase). La résistance aux azolés a 2 origines possibles : thérapeutique liée à l’utilisation de triazolés au long cours et environnementale associée à l’usage intensif de fongicides azolés en agriculture. Ce phénomène émergent donne toute son importance à la surveillance et la détection rigoureuses des isolats résistants au laboratoire, afin d’améliorer la prise en charge clinique des patients atteints d’AI à souche résistante, particulièrement exposés au risque d’échec thérapeutique. Les aspects épidémiologiques et mécanistiques de la résistance d’<em>Aspergillus</em> aux azolés ainsi que sa prise en charge en pratique seront successivement abordés au cours de cette synthèse.</p></div><div><p>Among <em>Aspergillus</em> species, <em>Aspergillus fumigatus</em> is responsible for various pulmonary diseases ranging from chronic and/or immuno-allergic forms in immunocompetent host, to severe invasive aspergillosis (IA) in immunocompromised patient. Triazole antifungals are the mainstay of therapy for aspergillosis, as first-line treatment for IA (voriconazole), or for prophylaxis. Over the past decade, the emergence of clinical and environmental azole-resistant <em>A.</em> <em>fumigatus</em> isolates has been reported in Europe, threatening the azole effectiveness for treatment of aspergillosis. The main mechanism of resistance is the occurrence of mutations in <em>cyp51A</em> gene, encoding the azole target enzyme (14 α-demethylase). Two hypothesis for azole resistance emergence are debated: azole resistance following long periods of azole treatment in the clinical setting, and an environmental origin related to the extended use of azole fungicides in agriculture. Thus, a reliable screening of resistant isolates is required in laboratories to improve the clinical management of IA patients with resistant strain, at high risk of treatment failure. Here, we successively review the current epidemiology, molecular mechanisms and clinical implication of <em>Aspergillus</em> azole resistance.</p></div>","PeriodicalId":49043,"journal":{"name":"Journal Des Anti-Infectieux","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2017-12-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.antinf.2017.10.001","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"44842345","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"Est-il justifié de traiter par antibiotiques les infections pulmonaires à mycobactéries non tuberculeuses ?","authors":"C. Andrejak,&nbsp;D. Basille,&nbsp;V. Jounieaux","doi":"10.1016/j.antinf.2017.04.002","DOIUrl":"10.1016/j.antinf.2017.04.002","url":null,"abstract":"<div><p>Les infections à mycobactéries non tuberculeuses (MNT) sont en incidence croissante. Ce sont des pathogènes opportunistes et c’est pourquoi l’isolement d’une MNT n’est pas synonyme d’infection. De ce fait, différentes sociétés savantes ont tenté de déterminer des critères d’infection. Les derniers datent de 2007. Ils associent des critères radio-cliniques, peu spécifiques et des critères microbiologiques. L’un des points importants est l’élimination des diagnostics plus probables que l’infection à MNT. Une fois le diagnostic posé, le traitement n’est pas systématique. Il est important de faire la balance entre les bénéfices du traitement (amélioration des symptômes) et les risques. Sur-traiter expose à la toxicité des antibiotiques. En effet, le traitement est long, au moins 12 mois après négativation des cultures, et lourd, associant au moins 3 antibiotiques. De plus, le traitement optimal de ce type d’infection n’est pas connu. Ainsi, seuls les patients les plus symptomatiques tirent un réel bénéfice du traitement. De plus, les patients, ayant déjà fait une infection à MNT restent à risque d’une nouvelle infection. Enfin, il ne faut pas oublier que l’infection à MNT reste un diagnostic d’élimination. Néanmoins, s’il est choisi de ne pas traiter, il reste important de poursuivre la surveillance de ces patients, puisqu’ils peuvent secondairement nécessiter un traitement. Tous ces éléments doivent donc bien faire réfléchir tout clinicien prenant en charge un patient ayant une infection à MNT. Ainsi, initier un traitement n’est pas anodin pour un patient, ne pas traiter non plus.</p></div><div><p>Nontuberculous mycobacteria (NTM) infections have an increasing incidence. These NTM are opportunist pathogens. That is why NTM isolation is not a synonym to infection. Scientific societies have tried to determinate some criteria for infection. The current infection criteria have been published in 2007. They are association of radio-clinical criteria and microbiological criteria. The most important criteria are that NTM infection should be an exclusion diagnosis. When diagnosis is established, treatment is not systematic. It is important to do the balance between benefit (symptoms improvement) and risks. Indeed, over treatment exposes to drugs toxicity. Treatment is long (12 months after culture conversion) and difficult (at least 3 antibiotics). Moreover, the optimal treatment is unknown. That is why only very symptomatic patients have a real benefit of treatment. Finally, NTM infection is only an exclusion diagnosis. But, if clinician decides not to treat, he has to follow patient as this patient could secondly need a treatment. All these data should be considered by any clinician who cares for a patient with an NTM infection. Thus, initialing a treatment is not trivial, not to treat either.</p></div>","PeriodicalId":49043,"journal":{"name":"Journal Des Anti-Infectieux","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2017-06-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.antinf.2017.04.002","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"43802976","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"Mise au point sur l’antibiothérapie des infections bactériennes de la peau et des tissus mous en France","authors":"B. Rossi","doi":"10.1016/j.antinf.2017.01.006","DOIUrl":"10.1016/j.antinf.2017.01.006","url":null,"abstract":"<div><p>Les infections bactériennes de la peau et des tissus mous (IBPTM) sont des infections fréquentes de présentation et sévérité variables. Dans cette mise au point, nous nous intéressons plus particulièrement aux infections profondes de la peau que nous avons séparées en infections purulentes et non purulentes comme dans les recommandations de l’IDSA de 2014. L’épidémiologique des bactéries incriminées est détaillée pour la France et rapportée au contexte d’antibiorésistance mondiale. À partir de l’épidémiologie bactérienne actuelle en France et des recommandations de l’IDSA, cette mise au point tend à faire une synthèse des stratégies antibiotiques possibles dans les IBPTM en France en 2017.</p></div><div><p>Acute bacterial skin infections are very common, with various clinical presentations and severity. This review focuses on deep skin infections, separated into purulent and non-purulent infection as in IDSA recommendation in 2014. Bacterial epidemiology of each infection is detailed for France and included in the context of global antimicrobial resistance. Based on the current bacterial epidemiology in France and IDSA recommendations, this review tends to synthesize the antibiotic strategy in the IBPTM in France in 2017.</p></div>","PeriodicalId":49043,"journal":{"name":"Journal Des Anti-Infectieux","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2017-06-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.antinf.2017.01.006","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"45400558","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"Staphylococcus aureus méticillino-résistants : concentrations critiques et pharmacodynamie de la vancomycine et des nouvelles céphalosporines","authors":"F. Jehl,&nbsp;F. Schramm,&nbsp;E. Talagrand-Reboul,&nbsp;A. Grillon","doi":"10.1016/j.antinf.2017.05.002","DOIUrl":"10.1016/j.antinf.2017.05.002","url":null,"abstract":"<div><p>Les données récentes de pharmacocinétique/pharmacodynamie (PK/PD) des antibiotiques ont considérablement influencé la révision des concentrations critiques cliniques des anciennes molécules et l’établissement de celles des molécules nouvellement disponibles. L’exemple de la vancomycine, dont le paramètre clef de l’efficacité bactérioclinique est le rapport aire sous la courbe (24<!--> <!-->h)/concentration minimale inhibitrice (ASC/CMI), est éloquent. La valeur cible de ce paramètre est 400 (prédictive de l’efficacité) et 600 (préventive du passage de staphylocoques hVISA à VISA). Or les concentrations sériques résiduelles, ou le plateau lors de perfusions continues, nécessaires à l’obtention d’une ASC suffisante lorsque les CMI sont supérieures ou égales 1<!--> <!-->mg/L sont souvent rapportées comme synonymes de néphrotoxicité avérée ou potentielle. Le problème de l’abaissement de la concentration critique clinique de la vancomycine est donc posé. Les céphalosporines dites de « 5^e génération », ceftaroline et ceftobiprole, très souvent actives sur les <em>Staphylococus aureus</em> résistants à la méticilline (SARM), représentent une alternative potentiellement intéressante, pour peu que les posologies soient en adéquation avec les prérequis PK/PD, les probabilités d’atteindre ces prérequis (probabilité d’atteindre la cible) en fonction des CMI et plus particulièrement du <em>break-point</em> clinique. C’est clairement le cas du ceftobiprole, ce devrait l’être avec la ceftaroline à la faveur d’une augmentation prochaine des posologies de 600<!--> <!-->mg<!--> <!-->×<!--> <!-->2 en perfusion d’1 heure à 600<!--> <!-->mg<!--> <!-->×<!--> <!-->3 en perfusion de 2<!--> <!-->heures.</p></div><div><p>The design or revisions of the break-points for the newly marketed or the older antibiotics have been considerably influenced by the recent development of antibiotics pharmacokinetics/pharmacodynamics (PK/PD). The example of vancomycin, the clinico-bacterial efficacy of which is best described by the area under the serum concentrations curve on minimal inhibitory concentration ratio (AUC/MIC) is demonstrative. It is now well established that a value of 400 (efficacy) or 600 (prevention of emergence of VISA from hVISA) are the targets. Unfortunately, the trough serum concentrations or continuous infusion steady-state concentrations required to reach an AUC consistent with these targets when bacterial MICs are<!--> <!-->≥<!--> <!-->1<!--> <!-->mg/L are synonymous of confirmed or potential renal toxicity. The question of lowering or not vancomycin clinical break-points is asked. The so-called 5th generation cephalosporins, ceftaroline and ceftobiprole, that are most often active against MRSA, may be considered as an interesting alternative given that their respective dosage regimens are in adequation with the PK/PD pre-requisite and their probabilities of target attainment, as a function of the targeted MICs, particularly the clinical brea","PeriodicalId":49043,"journal":{"name":"Journal Des Anti-Infectieux","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2017-06-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.antinf.2017.05.002","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"42235384","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

{"title":"Prevalence of blaNDM−1-producing Klebsiella pneumoniae in Asia: A systematic review and meta-analysis","authors":"M. Dadashi ,&nbsp;F. Fallah ,&nbsp;A. Hashemi ,&nbsp;B. Hajikhani ,&nbsp;P. Owlia ,&nbsp;N. Bostanghadiri ,&nbsp;N. Farahani ,&nbsp;M. Mirpour","doi":"10.1016/j.antinf.2017.05.003","DOIUrl":"10.1016/j.antinf.2017.05.003","url":null,"abstract":"<div><h3>Background and aim</h3><p>NDM-1 gene (<em>bla</em>_NDM−1)-producing <em>Klebsiella pneumoniae</em> is allegedly perceived as one of the most dangerous multidrug-resistant bacteria causing infections in hospitals and clinic domains. In numerous Asian countries, sporadic studies have been conducted to investigate the prevalence of <em>bla</em>_NDM−1-producing <em>K. pneumoniae.</em> In the present study, we determine the precise prevalence of <em>bla</em>_NDM−1-producing <em>K. pneumoniae</em> in different parts of Asia indeed.</p></div><div><h3>Methods</h3><p>Several international databases including Medline, Embase, and Web of sciences were searched from March 2005 to Jan 2016 to discern studies addressed the prevalence of <em>bla</em>_NDM−1-producing <em>K. pneumoniae</em> in Asia. Comprehensive meta-analysis (V2.2, Biostat) software was used to interpret the data.</p></div><div><h3>Results</h3><p>Of the 595 records identified from the databases, 19 studies fulfilled the eligibility criteria ostensibly. The analyses manifested that the prevalence of <em>bla</em>_NDM−-producing <em>K. pneumoniae</em> was 32.5% [95% confidence interval (95% CI) 22.6–44.3] in the analyzed Asian countries. Hence, the further stratified analyses indicated that the prevalence of <em>bla</em>_NDM−1-producing <em>K. pneumoniae</em> was higher in the probes, particularly after 2010.</p></div><div><h3>Conclusions</h3><p>The relatively high prevalence of <em>bla</em>_{<em>NDM−1</em>}-producing <em>K. pneumoniae</em> merits our analysis. Moreover, regular surveillance for hospital-associated infection, monitoring antibiotic sensitivity pattern, and formulation of definite antibiotic policies advocates viable roles for prevention and control of <em>bla</em>_{<em>NDM−1</em>}-producing <em>K. pneumoniae</em>.</p></div><div><h3>Contexte</h3><p>Les souches de <em>K. pneumoniae</em> produisant le gène <em>bla</em>_NDM−1 sont parmi les bactéries multirésistantes pouvant entraîner des infections cliniques, y compris nosocomiales. Des études sporadiques ont étudiées la prévalence de ces souches en Asie.</p></div><div><h3>Méthode</h3><p>Plusieurs bases de données internationales incluant Medline, Embase, et Rebove Science ont été analysées de mars 2005 à janvier 2016 pour définir la prévalence des souches de <em>K. pneumoniae</em> produisant le gène <em>bla</em>_NDM−1en Asie. Une méta-analyse (V2.2, Biostat) a été utilisée pour interpréter les données.</p></div><div><h3>Résultats</h3><p>À partir de 595 études, 19 remplissaient les caractères d’éligibilités prédéfinies. Les études ont retrouvé une prévalence de <em>K. pneumoniae</em> produisant le gène <em>bla</em>_NDM−1 de 32,5 % (intervalle de confiance à 95 % 22,6 à 44,3) dans les pays d’Asie.</p></div><div><h3>Conclusion</h3><p>La prévalence relativement élevée de souche de <em>K. pneumoniae</em> produisant le gène <e","PeriodicalId":49043,"journal":{"name":"Journal Des Anti-Infectieux","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2017-06-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.antinf.2017.05.003","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"42208895","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}