XVII Российская конференция “Распределенные информационно-вычислительные ресурсы: Цифровые двойники и большие данные”最新文献_第2页

MATHEMATICAL MODELING OF THE DYNAMICS OF THE DEGENERATIVE DISEASES BIOMARKERS NETWORK 退行性疾病生物标志物网络动力学的数学建模

XVII Российская конференция “Распределенные информационно-вычислительные ресурсы: Цифровые двойники и большие данные” Pub Date : 2019-12-25 DOI: 10.25743/ict.2019.15.81.028

О.Ф. Воропаева, Ксения Сергеевна Гаврилова, Софья Дмитриевна Сенотрусова

{"title":"MATHEMATICAL MODELING OF THE DYNAMICS OF THE DEGENERATIVE DISEASES BIOMARKERS NETWORK","authors":"О.Ф. Воропаева, Ксения Сергеевна Гаврилова, Софья Дмитриевна Сенотрусова","doi":"10.25743/ict.2019.15.81.028","DOIUrl":"https://doi.org/10.25743/ict.2019.15.81.028","url":null,"abstract":"Выполнен сопоставительный анализ ряда известных математических моделей функционирования сигнального пути белка p53, основанных на разных биологических идеализациях процесса. Даны оценки области применимости моделей. Обнаружены бифуркации Андронова-Хопфа и Неймарка-Сакера в диапазонах фазовых состояний p53 и его ингибиторов, соответствующих нормальной реакции сигнального пути p53 на стресс. Исследованы варианты гипотетических терапевтических противораковых стратегий.\u0000 A comparative analysis of a number of known mathematical models of the p53 protein signaling pathway functioning based on different biological idealizations of the process is performed. Estimates of the applicability of the models are given. Andronov-Hopf and NeimarkSaker bifurcations were found in the ranges of p53 phase states and its inhibitors corresponding to the normal response of the p53 signaling pathway to stress. Variants of hypothetical therapeutic anticancer strategies were investigated.","PeriodicalId":438052,"journal":{"name":"XVII Российская конференция “Распределенные информационно-вычислительные ресурсы: Цифровые двойники и большие данные”","volume":"53 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2019-12-25","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"129087847","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

引用次数: 0

PROSPECTS AND ROLE OF DIGITAL TWINS IN THE PROBLEM OF DOCUMENTING AND MONITORING OF THE ROCK ART SITES 数字孪生体在岩石艺术遗址记录和监测问题中的前景和作用

XVII Российская конференция “Распределенные информационно-вычислительные ресурсы: Цифровые двойники и большие данные” Pub Date : 2019-12-25 DOI: 10.25743/ict.2019.81.21.012

В.В. Казаков

{"title":"PROSPECTS AND ROLE OF DIGITAL TWINS IN THE PROBLEM OF DOCUMENTING AND MONITORING OF THE ROCK ART SITES","authors":"В.В. Казаков","doi":"10.25743/ict.2019.81.21.012","DOIUrl":"https://doi.org/10.25743/ict.2019.81.21.012","url":null,"abstract":"Одной из важнейших задач современной археологии является документирование объектов культурно-исторического наследия, в том числе памятников наскального искусства. В статье рассматриваются перспективы и модель использования цифровых двойников для сохранения и представления полной информации о таких объектах. Рассматривается модель представления визуальной формы объектов наскального искусства не только в виде фотографий и зарисовок, но и интерактивных трехмерных моделей. Предложена модель использования цифровых копий для мониторинга состояния памятников.\u0000 One of the most important tasks of modern archaeology is the documentation of objects of cultural and historical heritage, including rock art sites. The article discusses the prospects and model of using digital twins to save and present complete information about such objects. We consider a model for representing the visual form of rock art objects not only in the form of photographs and sketches, but also interactive three-dimensional models. A model of using digital copies to monitor the status of monuments is proposed.","PeriodicalId":438052,"journal":{"name":"XVII Российская конференция “Распределенные информационно-вычислительные ресурсы: Цифровые двойники и большие данные”","volume":"28 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2019-12-25","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"127876189","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

引用次数: 0

DESCRIPTION, CHARACTERISTIC AND ALGORITHM FOR CREATION OF A DICTIONARY OF CELL TYPES AND TISSUES IN THE GTRD DATABASE 在GTRD数据库中创建细胞类型和组织字典的描述、特征和算法

XVII Российская конференция “Распределенные информационно-вычислительные ресурсы: Цифровые двойники и большие данные” Pub Date : 2019-12-25 DOI: 10.25743/ict.2019.74.16.018

М.А. Куляшов, С.К. Колмыков, И.С. Евшин, Ф.А. Колпаков

{"title":"DESCRIPTION, CHARACTERISTIC AND ALGORITHM FOR CREATION OF A DICTIONARY OF CELL TYPES AND TISSUES IN THE GTRD DATABASE","authors":"М.А. Куляшов, С.К. Колмыков, И.С. Евшин, Ф.А. Колпаков","doi":"10.25743/ict.2019.74.16.018","DOIUrl":"https://doi.org/10.25743/ict.2019.74.16.018","url":null,"abstract":"База данных GTRD (http://gtrd.biouml.org) содержит информацию по сайтам связывания транскрипционных факторов и участкам открытого хроматина. Клеточные типы и ткани, представленные в GTRD, были: 1) упорядочены в единый словарь (3954 записей); 2) разделены на 90 уникальных кластеров; 3) 3225 записей были сопоставлены с основными существующими базами данных клеточных типов; 4) использованы для сопоставления экспериментов с базами данных по регуляции транскрипции: 588 для FANTOM 5, 5962 для ENCODE и 21720 для GTEx.\u0000 The GTRD database (http://gtrd.biouml.org) contains information on transcription factor binding sites and open chromatin. The cell types and tissues presented in the GTRD: 1) were arranged in a single dictionary (3954 entries) 2) were divided into 90 unique clusters 3) 3225 records were compared with main databases of cell types 4) were used to match experiments with the databases of transcription regulation: 588 for FANTOM 5, 5962 for ENCODE and 21720 for GTEx.","PeriodicalId":438052,"journal":{"name":"XVII Российская конференция “Распределенные информационно-вычислительные ресурсы: Цифровые двойники и большие данные”","volume":"46 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2019-12-25","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"121199328","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

引用次数: 0

QUALITY CONTROL FOR CITED SCIENTIFIC PLOTS IN W@DIS INFORMATION SYSTEM COLLECTION w@dis信息系统采集中被引科学情节的质量控制

XVII Российская конференция “Распределенные информационно-вычислительные ресурсы: Цифровые двойники и большие данные” Pub Date : 2019-12-25 DOI: 10.25743/ict.2019.48.68.031

Н.А. Лаврентьев, А.З. Фазлиев

{"title":"QUALITY CONTROL FOR CITED SCIENTIFIC PLOTS IN W@DIS INFORMATION SYSTEM COLLECTION","authors":"Н.А. Лаврентьев, А.З. Фазлиев","doi":"10.25743/ict.2019.48.68.031","DOIUrl":"https://doi.org/10.25743/ict.2019.48.68.031","url":null,"abstract":"В докладе дано краткое описание созданной коллекции графиков, характеризующих спектральные процессы, и представлена оценка качества семантической коллекции графиков, характеризующих процессы поглощения в спектроскопии и результаты исследований потенциальных функций, описывающих слабо связанные комплексы. Ключевой проблемой, рассмотренной в докладе, является оценка качества цитируемых графиков. Выделены сложности, возникающие при оценке, и указаны не решенные задачи при корректной оценке качества научных графиков.\u0000 This work briefly characterizes the spectral processes scientific plots collection and provides the quality assessment of the semantic collection of scientific plots. The collection contains data on spectroscopic absorption processes and the results of weakly bounded complexes potential functions research. The key issue of this report is the quality assessment of cited scientific plots. The difficulties with quality assessment are highlighted and unsolved problems with quality control for scientific plots are denoted.","PeriodicalId":438052,"journal":{"name":"XVII Российская конференция “Распределенные информационно-вычислительные ресурсы: Цифровые двойники и большие данные”","volume":"24 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2019-12-25","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"122461124","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

引用次数: 0

MATHEMATICAL MODELING OF THE PROСESSES OF CELLS DEATH IN DEGENERATIVE DISEASES 退行性疾病中细胞死亡proСesses的数学模型

XVII Российская конференция “Распределенные информационно-вычислительные ресурсы: Цифровые двойники и большие данные” Pub Date : 2019-12-25 DOI: 10.25743/ict.2019.37.25.009

О.Ф. Воропаева, Т.В. Баядилов, Е.С. Воропаева, Н.Д. Иванов, С.В. Леонтьев, Ч.А. Цгоев

{"title":"MATHEMATICAL MODELING OF THE PROСESSES OF CELLS DEATH IN DEGENERATIVE DISEASES","authors":"О.Ф. Воропаева, Т.В. Баядилов, Е.С. Воропаева, Н.Д. Иванов, С.В. Леонтьев, Ч.А. Цгоев","doi":"10.25743/ict.2019.37.25.009","DOIUrl":"https://doi.org/10.25743/ict.2019.37.25.009","url":null,"abstract":"Работа посвящена математическому моделированию некроза и апоптоза клеток при ишемическом инсульте, инфаркте миокарда и болезни Альцгеймера. Разработана вычислительная технология и новые математические модели. Построена модель асептического воспаления при заживлении раны. Рассмотрены некоторые общие вопросы моделирования пространственного распространения локальных повреждений и разных сценариев таргетной терапии. Выполнено сопоставление с экспериментальными данными.\u0000 The work is devoted to the mathematical modeling of cell necrosis and apoptosis in ischemic stroke, myocardial infarction and Alzheimers disease. Computing technology and new mathemati-cal models have been developed. A model of aseptic inflammation during wound healing has been constructed. Some general issues of modeling the spatial distribution of local injuries and various targeted therapy scenarios are considered. Comparison with experimental data was carried out.","PeriodicalId":438052,"journal":{"name":"XVII Российская конференция “Распределенные информационно-вычислительные ресурсы: Цифровые двойники и большие данные”","volume":"15 3","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2019-12-25","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"114120232","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

引用次数: 0

THЕ DEVELOPMENT OF THE STRUCTURE OF THE SOFTWARE SYSTEM FOR PROCESSING OF POETIC TEXTS CORPUS ThЕ诗歌文本语料库处理软件系统结构的开发

XVII Российская конференция “Распределенные информационно-вычислительные ресурсы: Цифровые двойники и большие данные” Pub Date : 2019-12-25 DOI: 10.25743/ict.2019.56.22.015

Владимир Борисович Барахнин, О. Ю. Кожемякина, Ю. С. Борзилова

{"title":"THЕ DEVELOPMENT OF THE STRUCTURE OF THE SOFTWARE SYSTEM FOR PROCESSING OF POETIC TEXTS CORPUS","authors":"Владимир Борисович Барахнин, О. Ю. Кожемякина, Ю. С. Борзилова","doi":"10.25743/ict.2019.56.22.015","DOIUrl":"https://doi.org/10.25743/ict.2019.56.22.015","url":null,"abstract":"В данной работе описан процесс проектирования и разработка структуры программной системы обработки корпусов поэтических текстов, реализуемой в рамках проекта комплексного анализа поэтических текстов, создаваемого на базе ИВТ СО РАН. При проектировании учитывались требования, предъявляемые к широкомасштабным системам: модульность, возможность масштабирования компонентов, условная независимость компонентов.\u0000 This paper describes the development of the structure of the software system for processing of poetic texts corpus, implemented in the framework of the project of complex analysis of poetic texts, created on the basis of the IСT SB RAS. This process took into account the requirements for large-scale systems: the modularity, the ability to scale the components, conditional independence of the components.","PeriodicalId":438052,"journal":{"name":"XVII Российская конференция “Распределенные информационно-вычислительные ресурсы: Цифровые двойники и большие данные”","volume":"117 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2019-12-25","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"124960399","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

引用次数: 0

INTEGRATED MODULAR MODEL LINKING METABOLISM, SIGNALING TRANSDUCTION AND GENE EXPRESSION REGULATION INHUMAN SKELETAL MUSCLE 连接非人骨骼肌代谢、信号转导和基因表达调控的集成模块化模型

XVII Российская конференция “Распределенные информационно-вычислительные ресурсы: Цифровые двойники и большие данные” Pub Date : 2019-12-25 DOI: 10.25743/ict.2019.61.15.003

И.Р. Акбердин, И.Н. Киселев, С.С. Пинтус, А. Вертышев, П.А. Махновский, Д.В. Попов, Ф.А. Колпаков

引用次数: 0

INFORMATION SYSTEM FOR DATA ANALYSIS POLLUTION OF WATER DRAINS OF NOVOSIBIRSK AND THE REGION 新西伯利亚及该地区排水污染数据分析信息系统

XVII Российская конференция “Распределенные информационно-вычислительные ресурсы: Цифровые двойники и большие данные” Pub Date : 2019-12-25 DOI: 10.25743/ict.2019.13.91.019

Юрий Иванович Молородов, В.В. Барциц

{"title":"INFORMATION SYSTEM FOR DATA ANALYSIS POLLUTION OF WATER DRAINS OF NOVOSIBIRSK AND THE REGION","authors":"Юрий Иванович Молородов, В.В. Барциц","doi":"10.25743/ict.2019.13.91.019","DOIUrl":"https://doi.org/10.25743/ict.2019.13.91.019","url":null,"abstract":"В работе показано влияние факторов, процессов и последствий загрязнения компонентов городских экосистем на загрязнение вод и гидрохимический состав воды малых рек и бассейна реки Обь. Описана структура прототипа интерактивной информационной системы (ИАС), в которой предусмотрена возможность получения прогноза на ближайшее пять лет.\u0000 The paper shows the influence of factors, processes and consequences of pollution of components of urban ecosystems on water pollution and hydrochemical composition of water of small rivers and the Ob river basin. The structure of the prototype of the interactive information system (IAS), which provides for the possibility of obtaining a forecast for the next five years, is described.","PeriodicalId":438052,"journal":{"name":"XVII Российская конференция “Распределенные информационно-вычислительные ресурсы: Цифровые двойники и большие данные”","volume":"11 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2019-12-25","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"126995409","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

引用次数: 0

DATA QUALITY ASSESSMENTS IN LARGE SPECTRAL DATA COLLECTIONS 大型光谱数据收集中的数据质量评估

XVII Российская конференция “Распределенные информационно-вычислительные ресурсы: Цифровые двойники и большие данные” Pub Date : 2019-12-25 DOI: 10.25743/ict.2019.25.66.032

А.Ю. Ахлестин, Н.А. Лаврентьев, Алексей Викторович Козодоев, А.З. Фазлиев, А.И. Привезенцев, Елена Михайловна Козодоева

{"title":"DATA QUALITY ASSESSMENTS IN LARGE SPECTRAL DATA COLLECTIONS","authors":"А.Ю. Ахлестин, Н.А. Лаврентьев, Алексей Викторович Козодоев, А.З. Фазлиев, А.И. Привезенцев, Елена Михайловна Козодоева","doi":"10.25743/ict.2019.25.66.032","DOIUrl":"https://doi.org/10.25743/ict.2019.25.66.032","url":null,"abstract":"В докладе обсуждаются методы анализа качества спектральных данных и оценка доверия экспертным данным и результаты их применения в ИС WDIS. Наряду с традиционными методами, используемыми при анализе качества первичных источников данных, обсуждается также метод декомпозиции экспертных источников данных, метод попарного сравнения упорядоченных массивов данных и использование эмпирических данных для фильтрации больших коллекций данных по величине допустимой разницы между уровнями энергии первичных источников данных и эмпирического источника. В докладе рассмотрены два типа интерфейсов для просмотра результатов анализа спектральных данных и оценки доверия экспертным данным.\u0000 The report discusses methods for analyzing the quality of spectral data, trust assessment of expert data sources and the results of their application in the WDIS information system. Along with the traditional methods used in analyzing the quality of primary data sources, the method of decomposing expert data sources, the method of pairwise comparison of ordered data arrays, and the use of empirical data to filter large collections of data by the magnitude of the acceptable difference between the energy levels of primary data sources and an empirical source are also discussed. The report examines two types of interfaces for viewing the results of spectral data analysis and assessing trust in expert data.","PeriodicalId":438052,"journal":{"name":"XVII Российская конференция “Распределенные информационно-вычислительные ресурсы: Цифровые двойники и большие данные”","volume":"5 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2019-12-25","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"132016717","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

引用次数: 0

THE STUDY OF THE APPLICABILITY OF MACHINE LEARNING METHODS BASED ON DECISION TREES FOR THE ANALYSIS OF ELECTROCARDIOGRAMS 基于决策树的机器学习方法在心电图分析中的适用性研究

XVII Российская конференция “Распределенные информационно-вычислительные ресурсы: Цифровые двойники и большие данные” Pub Date : 2019-12-25 DOI: 10.25743/ict.2019.31.99.006

Б.В. Бочкарев, Антон Андреевич Ракитский

{"title":"THE STUDY OF THE APPLICABILITY OF MACHINE LEARNING METHODS BASED ON DECISION TREES FOR THE ANALYSIS OF ELECTROCARDIOGRAMS","authors":"Б.В. Бочкарев, Антон Андреевич Ракитский","doi":"10.25743/ict.2019.31.99.006","DOIUrl":"https://doi.org/10.25743/ict.2019.31.99.006","url":null,"abstract":"В данной статье рассматривается возможность применения методов машинного обучения на основе решающих деревьев для анализа электрокардиосигналов. Были отобраны наиболее перспективные методы, такие, как метод градиентного бустинга, лес случайных деревьев и рандомизированные деревья, которые являются сегодня наиболее и качественными в задачах классификации. На основе проведенного исследования происходит демонстрация применимости выбранных методов для автоматизированного анализа электрокардиограмм пациентов\u0000 In this article, the possibilities of using machine-learning methods based on decision trees for the analy-sis of cardiac signals are available. The most promising methods have been applied, such as the gradient boost-ing method, forest random and randomized trees. The basis of the research is a demonstration of the applicability of the selected methods for the automated analysis of patient electrocardiograms.","PeriodicalId":438052,"journal":{"name":"XVII Российская конференция “Распределенные информационно-вычислительные ресурсы: Цифровые двойники и большие данные”","volume":"95 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2019-12-25","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"134418680","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

引用次数: 0