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Imaging and Molecular Annotation of Xenographs and Tumours (IMAXT): High throughput data and analysis infrastructure. Xenographs 和肿瘤的成像和分子注释（IMAXT）：高通量数据和分析基础设施。
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CAHIERS ELISABETHAINS Pub Date : 2023-04-14 eCollection Date: 2023-01-01 DOI: 10.1017/S2633903X23000090
Eduardo A González-Solares, Ali Dariush, Carlos González-Fernández, Aybüke Küpcü Yoldaş, Alireza Molaeinezhad, Mohammad Al Sa'd, Leigh Smith, Tristan Whitmarsh, Neil Millar, Nicholas Chornay, Ilaria Falciatori, Atefeh Fatemi, Daniel Goodwin, Laura Kuett, Claire M Mulvey, Marta Páez Ribes, Fatime Qosaj, Andrew Roth, Ignacio Vázquez-García, Spencer S Watson, Jonas Windhager, Samuel Aparicio, Bernd Bodenmiller, Ed Boyden, Carlos Caldas, Owen Harris, Sohrab P Shah, Simon Tavaré, Dario Bressan, Gregory J Hannon, Nicholas A Walton
{"title":"Imaging and Molecular Annotation of Xenographs and Tumours (IMAXT): High throughput data and analysis infrastructure.","authors":"Eduardo A González-Solares, Ali Dariush, Carlos González-Fernández, Aybüke Küpcü Yoldaş, Alireza Molaeinezhad, Mohammad Al Sa'd, Leigh Smith, Tristan Whitmarsh, Neil Millar, Nicholas Chornay, Ilaria Falciatori, Atefeh Fatemi, Daniel Goodwin, Laura Kuett, Claire M Mulvey, Marta Páez Ribes, Fatime Qosaj, Andrew Roth, Ignacio Vázquez-García, Spencer S Watson, Jonas Windhager, Samuel Aparicio, Bernd Bodenmiller, Ed Boyden, Carlos Caldas, Owen Harris, Sohrab P Shah, Simon Tavaré, Dario Bressan, Gregory J Hannon, Nicholas A Walton","doi":"10.1017/S2633903X23000090","DOIUrl":"10.1017/S2633903X23000090","url":null,"abstract":"<p><p>With the aim of producing a 3D representation of tumors, imaging and molecular annotation of xenografts and tumors (IMAXT) uses a large variety of modalities in order to acquire tumor samples and produce a map of every cell in the tumor and its host environment. With the large volume and variety of data produced in the project, we developed automatic data workflows and analysis pipelines. We introduce a research methodology where scientists connect to a cloud environment to perform analysis close to where data are located, instead of bringing data to their local computers. Here, we present the data and analysis infrastructure, discuss the unique computational challenges and describe the analysis chains developed and deployed to generate molecularly annotated tumor models. Registration is achieved by use of a novel technique involving spherical fiducial marks that are visible in all imaging modalities used within IMAXT. The automatic pipelines are highly optimized and allow to obtain processed datasets several times quicker than current solutions narrowing the gap between data acquisition and scientific exploitation.</p>","PeriodicalId":42648,"journal":{"name":"CAHIERS ELISABETHAINS","volume":"22 1","pages":"e11"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-04-14","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10936408/pdf/","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"87332142","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":2,"RegionCategory":"文学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"OA","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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L’équipement funéraire des dames de l’Égypte ancienne. Réflexions méthodologiques sur quelques exemples issus des nécropoles de Gourob 古埃及妇女的葬礼设备。对古罗布墓地中一些例子的方法论思考
2区 文学
CAHIERS ELISABETHAINS Pub Date : 2023-01-01 DOI: 10.25518/1370-2262.1805
Claudia Venier
{"title":"L’équipement funéraire des dames de l’Égypte ancienne. Réflexions méthodologiques sur quelques exemples issus des nécropoles de Gourob","authors":"Claudia Venier","doi":"10.25518/1370-2262.1805","DOIUrl":"https://doi.org/10.25518/1370-2262.1805","url":null,"abstract":"En fonction des sources mobilisées, la documentation offre une vision contrastée de la femme dans l’Égypte ancienne. Après une remise en contexte, cette recherche se concentre sur ce que l’archéologie des assemblages funéraires peut apporter à notre connaissance de la société de cour du Nouvel Empire et en particulier de ses dames, à travers l’examen des nécropoles de Gourob. Le site de (Médinet el-)Gourob est associé, à partir du règne de Thoutmosis III (ca. 1479-1425 avant notre ère), à un domaine et une résidence des femmes de la famille royale et de la cour, souvent désignés par l’égyptologie contemporaine sous l’appellation de « palais-harem ». Les objets de Gourob, en particulier ceux mis au jour durant la campagne entreprise par la British School of Archaeology in Egypt en 1920 (G. Brunton et R. Engelbach), sont utilisés comme cas d’étude pour évaluer les possibilités de caractérisation sociologique des femmes inhumées dans les nécropoles qui entourent ce complexe palatial.","PeriodicalId":42648,"journal":{"name":"CAHIERS ELISABETHAINS","volume":"104 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-01-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135505555","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":2,"RegionCategory":"文学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Masculinité, pudor et uerecundia : analyse des transgressions de genre masculines dans la littérature latine du 1er s. av. n. è. au 3e s. de n. è. 阳刚之气、谦虚与uerecundia:公元前一世纪至公元三世纪拉丁文学中男性性别越界的分析。
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CAHIERS ELISABETHAINS Pub Date : 2023-01-01 DOI: 10.25518/1370-2262.1749
Héloïse Malisse
{"title":"Masculinité, pudor et uerecundia : analyse des transgressions de genre masculines dans la littérature latine du 1er s. av. n. è. au 3e s. de n. è.","authors":"Héloïse Malisse","doi":"10.25518/1370-2262.1749","DOIUrl":"https://doi.org/10.25518/1370-2262.1749","url":null,"abstract":"L’analyse des occurrences des termes pudor, uerecundia et de leurs dérivés dans les épisodes d’attitudes transgressives commises par des hommes dans la littérature latine permet, en négatif, de percevoir quelles étaient les valeurs propres à la masculinité dans les schémas de pensées dominants. Les hommes impudici semblent en effet être la véritable antithèse du uir Romanus, que ce soit en termes d’habillement, de démarche, d’asservissement aux plaisirs, de comportements sexuels et d’absence de toute uirtus et de constantia.","PeriodicalId":42648,"journal":{"name":"CAHIERS ELISABETHAINS","volume":"27 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-01-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135506003","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":2,"RegionCategory":"文学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Des larmes pour les hommes. Aspects genrés de l’expression du deuil dans les épitaphes attiques archaïques 男人的眼泪。在古代阁楼墓志铭中哀悼表达的性别方面
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CAHIERS ELISABETHAINS Pub Date : 2023-01-01 DOI: 10.25518/1370-2262.1761
Brice De Potter
{"title":"Des larmes pour les hommes. Aspects genrés de l’expression du deuil dans les épitaphes attiques archaïques","authors":"Brice De Potter","doi":"10.25518/1370-2262.1761","DOIUrl":"https://doi.org/10.25518/1370-2262.1761","url":null,"abstract":"Centré sur les liens entre expression des émotions et construction des identités de genre, cet article s’intéresse aux manifestations du sentiment de deuil dans les épitaphes attiques archaïques. Cette documentation épigraphique conduit à deux observations. D’une part, elle suggère qu’il n’est pas transgressif, pour un homme, y compris étranger à la famille du défunt, d’exprimer publiquement son chagrin dans le cas des garçons décédés prématurément. De l’autre, elle révèle que ces démonstrations du sentiment de deuil sont absentes des épitaphes rédigées pour des femmes. L’influence des formules homériques sur les auteurs d’épigramme funéraire pourrait expliquer cette différence de traitement des défunts en fonction des sexes.","PeriodicalId":42648,"journal":{"name":"CAHIERS ELISABETHAINS","volume":"29 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-01-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135505569","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":2,"RegionCategory":"文学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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L’approche pluridisciplinaire dans l’étude de la production et de la consommation du vitrage romain : enjeux, limites et solutions 罗马玻璃生产和消费研究的多学科方法:挑战、限制和解决方案
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CAHIERS ELISABETHAINS Pub Date : 2023-01-01 DOI: 10.25518/1370-2262.1713
Géraldine Frère
{"title":"L’approche pluridisciplinaire dans l’étude de la production et de la consommation du vitrage romain : enjeux, limites et solutions","authors":"Géraldine Frère","doi":"10.25518/1370-2262.1713","DOIUrl":"https://doi.org/10.25518/1370-2262.1713","url":null,"abstract":"Actuellement, la pluridisciplinarité est un gage de qualité des recherches doctorales en Antiquité. Celle-ci est facilitée notamment par les réseaux établis grâce aux colloques. Malgré cette toile tissée entre les disciplines, des limites de ces approches découlent de nombreux obstacles et contraintes. Par la présentation de la recherche doctorale menée seront mis en avant les enjeux d’une telle méthodologique, les obstacles rencontrés et les différentes solutions possibles.","PeriodicalId":42648,"journal":{"name":"CAHIERS ELISABETHAINS","volume":"1 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-01-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135505269","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":2,"RegionCategory":"文学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Éléments pour une intégration de la dimension de genre dans l’archéologie classique : contrer les androcentrismes et les anachronismes 古典考古学中性别维度整合的要素:对抗男性中心主义和时代错误
2区 文学
CAHIERS ELISABETHAINS Pub Date : 2023-01-01 DOI: 10.25518/1370-2262.1775
Isabelle Algrain
{"title":"Éléments pour une intégration de la dimension de genre dans l’archéologie classique : contrer les androcentrismes et les anachronismes","authors":"Isabelle Algrain","doi":"10.25518/1370-2262.1775","DOIUrl":"https://doi.org/10.25518/1370-2262.1775","url":null,"abstract":"L’introduction du genre dans les différentes disciplines des études classiques s’est faite à des rythmes différents. Si l’histoire des femmes et du genre a très rapidement pris son essor à partir des années 1960, l’archéologie s’est révélée plus lente à intégrer cette notion issue des sciences sociales et des women’s studies. Pour ce faire, les chercheuses – puisque ce sont en majorité des femmes – qui ont abordé la thématique du genre et des rapports sociaux de sexe dans les sociétés antiques ont dû faire face à plusieurs obstacles épistémologiques au nombre desquels figurent l’androcentrisme et l’anachronisme. Dans cet article, nous aborderons brièvement l’histoire de l’intégration du genre dans les études classiques, en particulier en archéologie, avant d’approfondir le fonctionnement de ces deux mécanismes que sont l’androcentrisme et l’anachronisme.","PeriodicalId":42648,"journal":{"name":"CAHIERS ELISABETHAINS","volume":"104 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-01-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135505547","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":2,"RegionCategory":"文学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Understanding a Changing Approach to Gender in Studies on Roman Baths 理解罗马浴场研究中性别研究方法的变化
2区 文学
CAHIERS ELISABETHAINS Pub Date : 2023-01-01 DOI: 10.25518/1370-2262.1797
Sadi Maréchal
{"title":"Understanding a Changing Approach to Gender in Studies on Roman Baths","authors":"Sadi Maréchal","doi":"10.25518/1370-2262.1797","DOIUrl":"https://doi.org/10.25518/1370-2262.1797","url":null,"abstract":"Cet article examine comment des questions de recherche concernant le genre ont été incluses dans des études sur les bains grecs et romains. Et en outre, comment l’implication de ces questions a-t-elle influencé la perception des bains antiques ? Les premières études « antiquaires » prêtaient peu d’attention aux baigneurs, hommes ou femmes, se focalisant d’abord sur l’architecture, la technologie et la décoration de ces édifices. C’est seulement à partir de la seconde moitié du 20e siècle, poussés par des changements épistémologiques dans le domaine des sciences humaines, que les spécialistes ont commencé à inclure les femmes dans leurs discours. Trois questions ont souvent été réitérées depuis : les femmes allaient-elles aux bains publics ? Les femmes se baignaient-elles avec les hommes ? Et que portaient-elles dans les bains ? Dans la dernière décennie du siècle dernier et la première du nouveau, les études sur les bains antiques commencent progressivement à inclure des questions sur d’autres groupes de genre. Cependant, ces nouveaux discours ne sont que lentement intégrés dans les reconstructions virtuelles, qui semblent toujours très influencées par les traditionnels dessins architecturaux.","PeriodicalId":42648,"journal":{"name":"CAHIERS ELISABETHAINS","volume":"20 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-01-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135506026","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":2,"RegionCategory":"文学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Entre global et local : l’expression des appartenances des Thraces à Rome (1er-3e s. CE.) 在全球和地方之间:色雷斯人对罗马的归属感的表达(公元1 -3世纪)
2区 文学
CAHIERS ELISABETHAINS Pub Date : 2023-01-01 DOI: 10.25518/1370-2262.1727
Tiffany Bellon
{"title":"Entre global et local : l’expression des appartenances des Thraces à Rome (1er-3e s. CE.)","authors":"Tiffany Bellon","doi":"10.25518/1370-2262.1727","DOIUrl":"https://doi.org/10.25518/1370-2262.1727","url":null,"abstract":"Le concept de glocalisation est envisagé à travers l’expression des appartenances des Thraces établis à Rome au cours des trois premiers siècles de notre ère, telles qu’elles apparaissent dans les sources épigraphiques. Ce canal de communication caractéristique de la société romaine offre aux individus un « répertoire global » qui leur permet d’exprimer, de manière singulière tout en étant compris de tous, leurs appartenances à l’égard de la patrie d’origine et/ou de la société d’accueil. Trois types d’appartenances seront analysés : l’appartenance sociale, culturelle (mise en lumière par l’onomastique et les pratiques religieuses) et territoriale. Ainsi, l’expression des appartenances, multiformes et plurielles, témoigne de l’articulation et de la négociation entre ces différentes échelles que sont le « global » et le « local », soulignant la complexité, mais surtout la richesse des échanges interculturels en présence.","PeriodicalId":42648,"journal":{"name":"CAHIERS ELISABETHAINS","volume":"29 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-01-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135506012","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":2,"RegionCategory":"文学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Le métier d’antiquiste, du champ normatif à l’ère « post-disciplinaire » : méthodes, concepts, perspectives. Introduction 古物学家的职业，从规范领域到“后学科”时代:方法、概念、视角。引言
2区 文学
CAHIERS ELISABETHAINS Pub Date : 2023-01-01 DOI: 10.25518/1370-2262.1785
Florence Liard
{"title":"Le métier d’antiquiste, du champ normatif à l’ère « post-disciplinaire » : méthodes, concepts, perspectives. Introduction","authors":"Florence Liard","doi":"10.25518/1370-2262.1785","DOIUrl":"https://doi.org/10.25518/1370-2262.1785","url":null,"abstract":"Dans le domaine de la recherche en histoire, l’antiquiste fait face à une documentation particulièrement lacunaire et hétérogène du fait de l’éloignement chronologique de la période traitée. Si ce corpus est régulièrement étoffé par les découvertes archéologiques, numismatiques, papyrologiques et épigraphiques, et par l’avancement méthodologique pour l’étude des matériaux anciens, ce n’est pas toujours le cas des sources textuelles pour lesquelles le caractère incomplet, partiellement détruit ou altéré est parfois irrémédiable. À cela s’ajoute le déplacement, dans le domaine plus large des sciences humaines, de l’intérêt scientifique depuis une « société-système » (dont les rouages peuvent être reconstruits par l’étude des sources, de leurs auteurs et de leurs acteurs), vers une société de l’individu (centrée sur la reconstruction de la pluralité des rôles et des actions au sein de la société, indépendamment de l’image qui est donnée de ces individus dans les sources). Cet état des lieux mène inéluctablement l’antiquiste à élargir le champ de ses expertises, et à se plier à un renouvellement constant de ses perspectives de recherche et de ses réflexions théoriques. Dans un environnement de recherche dominé par l’emprunt de plus en plus fréquent d’outils d’analyse et de concepts d’interprétation n’appartenant pas au champ classique de l’historien, les repères méthodologiques que constituaient naguère les concepts de « sources »1 et de « disciplines »2 apparaissent de plus en p","PeriodicalId":42648,"journal":{"name":"CAHIERS ELISABETHAINS","volume":"24 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-01-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135506599","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":2,"RegionCategory":"文学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Discours des personnages de l'Octavie du Pseudo-Sénèque : Logométrie et trajet tragique 伪塞内加八年级人物的演讲:符号学和悲剧旅程
2区 文学
CAHIERS ELISABETHAINS Pub Date : 2023-01-01 DOI: 10.25518/1370-2262.1787
Marc Vandersmissen
{"title":"Discours des personnages de l'Octavie du Pseudo-Sénèque : Logométrie et trajet tragique","authors":"Marc Vandersmissen","doi":"10.25518/1370-2262.1787","DOIUrl":"https://doi.org/10.25518/1370-2262.1787","url":null,"abstract":"Pendant longtemps, c’est la dimension historique de l’Octavie du Pseudo-Sénèque qui a intéressé les chercheurs. Ceux-ci se sont surtout concentrés sur les questions d’authenticité et de références historiques à la période néronienne. Lorsque la pièce était abordée comme une œuvre de théâtre, c’était souvent en comparaison négative avec les tragédies à sujet mythologique. Aujourd’hui, avec les outils de la logométrie, nous mettons en évidence les processus de construction des discours des personnages au service du trajet tragique des deux héros de la pièce, Octavie et Néron. Il apparaît que le couple fonctionne discursivement et tragiquement en parallèle grâce à leurs échanges avec les autres personnages. C’est parce qu’Octavie en tant que femme et Néron en tant qu’homme souffrent d’un dolor issu de leur lignée maternelle qu’ils sont contraints de se transformer sur scène en héros tragiques. En cela, l’Octavie s’inscrit dans le genre tragique tout comme les tragédies de Sénèque.","PeriodicalId":42648,"journal":{"name":"CAHIERS ELISABETHAINS","volume":"7 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-01-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135505571","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":2,"RegionCategory":"文学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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