Manuel Páez-Meza , Jorge Ramos-Montiel , Nicolás De La Espriella-Vélez
{"title":"COMPORTAMIENTO VOLUMÉTRICO DE LA DL-VALINA EN SOLUCIONES ACUOSAS DE NITRATO DE SODIO A DIFERENTES TEMPERATURAS","authors":"Manuel Páez-Meza , Jorge Ramos-Montiel , Nicolás De La Espriella-Vélez","doi":"10.1016/j.recqb.2016.11.001","DOIUrl":"10.1016/j.recqb.2016.11.001","url":null,"abstract":"<div><p>Se determinaron las densidades de la DL-valina (Ácido 2-amino-3-metilbutanoico) en soluciones acuosas de nitrato de sodio en el intervalo de temperaturas desde 283.15<!--> <!-->K hasta 318.15<!--> <!-->K usando un densímetro de tubo vibratorio Anton Paar DMA 5000. Se calcularon: los volúmenes molares aparentes, los volúmenes molares aparentes a dilución infinita, la segunda derivada de los volúmenes molares parciales a dilución infinita con respecto a la temperatura, así como los volúmenes molares parciales de transferencia y los números de hidratación. Los resultados obtenidos se discutieron en términos de las interacciones predominantes en solución, encontrándose que la DL-valina tiene un efecto disruptor de la estructura del solvente y que a dilución infinita predominan las interacciones soluto-solvente entre el grupo isopropil del aminoácido y los iones sodio y nitrato.</p></div><div><p>Densities of DL-valine (2-amino-3-methylbutanoic acid) in aqueous solutions of sodium nitrate were determined at temperatures ranging from 283.15 to 318.15<!--> <!-->K using an Anton Paar DMA 5000 vibrating tube densitometer. The apparent molar volume, infinite dilution apparent molar volume, second derivative of the infinite dilution partial molar volume with respect to temperature, partial molar volume of transfer at infinite dilution and the number of hydration were calculated. The results obtained were discussed in terms of the dominant interactions in solution, it was found that the DL-valine has a disruptor effect in the structure of the solvent and that at infinite dilution solute-solvent interactions are dominant between isopropyl group the amino acid and sodium and nitrate ions.</p></div>","PeriodicalId":31507,"journal":{"name":"TIP Revista Especializada en Ciencias QuimicoBiologicas","volume":"20 1","pages":"Pages 5-15"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2017-01-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.recqb.2016.11.001","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"74228292","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"OA","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
{"title":"CONSIDERACIONES GENERALES EN EL ESTABLECIMIENTO DEL SEXO EN MAMÍFEROS","authors":"Verónica Díaz-Hernández , Horacio Merchant-Larios","doi":"10.1016/j.recqb.2016.11.003","DOIUrl":"10.1016/j.recqb.2016.11.003","url":null,"abstract":"<div><p>El establecimiento del sexo en mamíferos ocurre al momento de la fertilización, sin embargo, se requiere de la determinación y diferenciación sexual de la gónada para que se establezca el fenotipo sexual del individuo. A partir del descubrimiento del gen <em>Sry</em> como el factor determinante del testículo se ha avanzado en conocer los mecanismos que conducen al desarrollo testicular y al establecimiento del fenotipo masculino. Y aunque el fenotipo femenino se adquiere aun en ausencia de la gónada, se requiere de la diferenciación y maduración ovárica para la adquisición de los caracteres sexuales secundarios. Este trabajo tiene como objetivo describir los mecanismos involucrados en la determinación sexual de la gónada e integrarlos con los aspectos histológicos que contribuyen con la diferenciación sexual gonadal. Una vez establecido el sexo gonadal se abordan aspectos moleculares involucrados en la masculinización del individuo. Finalmente se hace una breve revisión sobre los procesos patológicos resultantes de la alteración del establecimiento del sexo en humanos.</p></div><div><p>Establishment of sex in mammals occurs at the moment of fertilization, however, the determination and sexual differentiation of the gonad is required in order to establish the sexual phenotype of the individual. Since the discovery of the <em>Sry</em> gene as the testis-determining factor, progress has been made in understanding the mechanisms that lead to testicular development and establishment of the male phenotype. Although the female phenotype is acquired even in the absence of the gonad, differentiation and ovarian maturation are required for the establishment of secondary sexual characteristics. This work aims to describe the mechanisms involved in sexual determination of the gonad and integrate them with the histological aspects that contribute to gonadal sex differentiation. Once the gonadal sex is established, molecular aspects involved in the masculinization of the individual are addressed. Finally, a brief review of the pathological processes resulting from the alteration of the establishment of sex in humans is undertaken.</p></div>","PeriodicalId":31507,"journal":{"name":"TIP Revista Especializada en Ciencias QuimicoBiologicas","volume":"20 1","pages":"Pages 27-39"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2017-01-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.recqb.2016.11.003","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"77078768","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"OA","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Hernando José Bolívar-Anillo , Martha Lucinda Contreras-Zentella , Luis Guillermo Teherán-Sierra
{"title":"Burkholderia tropica UNA BACTERIA CON GRAN POTENCIAL PARA SU USO EN LA AGRICULTURA","authors":"Hernando José Bolívar-Anillo , Martha Lucinda Contreras-Zentella , Luis Guillermo Teherán-Sierra","doi":"10.1016/j.recqb.2016.06.003","DOIUrl":"10.1016/j.recqb.2016.06.003","url":null,"abstract":"<div><p>El género <em>Burkholderia</em> con más de 90 especies reportadas hasta la fecha, se encuentra dividido en dos grupos mayores filogenéticamente distantes. El primer grupo se encuentra constituido por especies patógenas donde destacan los patógenos oportunistas referidos como el complejo <em>Burkholderia cepacia</em> (Bcc); el otro grupo está conformado por especies no patógenas con habilidades para la promoción del crecimiento vegetal y la rizoremediación.</p><p><em>Burkholderia tropica</em> es una bacteria con capacidad de fijar nitrógeno; aislada de la rizósfera, rizoplano, tallo y la raíz de plantas de maíz y caña de azúcar. Además de su capacidad diazotrofa, <em>B. tropica</em> presenta características que permiten catalogarla como una bacteria promotora del crecimiento vegetal, por su capacidad de producir sideróforos, solubilizar fosfatos, producir exo-heteropolisacáridos, además de utilizarse como biocontrol para algunos fitoparásitos, lo que la convierte en una bacteria prometedora para su aplicación en el sector agrícola.</p></div><div><p>The genus <em>Burkholderia</em> whit over 90 species reported to date, is divided into two major groups phylogenetically distant. The first group is made up of pathogenic species which highlights referred opportunistic pathogens such as <em>Burkholderia cepacia</em> (Bcc) complex; The other group consists of nonpathogenic species with skills to promote plant growth and rhizoremediation.</p><p><em>Burkholderia tropica</em> is a bacterium capable of fixing nitrogen; isolated from the rhizosphere, rhizoplane, stem and roots of corn plants and sugarcane. Besides its ability diazotrofa, <em>B. tropica</em> presents characteristics that classify it as a plant promoter bacteria, such growth as is the ability to produce siderophores, solubilizing phosphates, producing exo-heteropolysaccharides, and can be used as biocontrol for some plant parasites, which It makes it a promising bacteria to be used in the agricultural sector.</p></div>","PeriodicalId":31507,"journal":{"name":"TIP Revista Especializada en Ciencias QuimicoBiologicas","volume":"19 2","pages":"Pages 102-108"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2016-08-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.recqb.2016.06.003","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"88749881","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"OA","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
{"title":"PAPEL DEL FACTOR DE BLOQUEO INDUCIDO POR PROGESTERONA (PIBF) EN EMBARAZO Y CÁNCER","authors":"Araceli Gutiérrez-Rodríguez, Ignacio Camacho-Arroyo","doi":"10.1016/j.recqb.2016.06.004","DOIUrl":"10.1016/j.recqb.2016.06.004","url":null,"abstract":"<div><p>El factor de bloqueo inducido por progesterona (PIBF) es una proteína inmunomoduladora por medio de la cual la progesterona ejerce varios de sus efectos inmunológicos en diferentes células de alta proliferación, que incluyen desde células embrionarias hasta células tumorales. El PIBF ocasiona un incremento en la síntesis de anticuerpos asimétricos y de citocinas tipo Th2 como las interleucinas (IL) 4, 6 y 10, así como una disminución en la actividad citotóxica de las células NK y en la producción de citocinas tipo Th1, como el factor de necrosis tumoral alfa (TNFα) e IL-12. Lo anterior provoca una reducción en la relación Th1/Th2 que es característica del embarazo sano, lo que tiene como consecuencia un aumento en la inmunidad humoral y una disminución en la inmunidad celular. Estos mecanismos inmunomoduladores tienen como resultado una evasión del sistema inmune de la madre por parte del feto para que el embarazo llegue a término. De manera interesante, diversos estudios sugieren que estos mismos mecanismos son utilizados por las células cancerosas para facilitar la progresión de tumores que presentan sobre-expresión del PIBF.</p></div><div><p>The progesterone-induced blocking factor (PIBF) is a protein that mediates the immunomodulatory effects of progesterone in cells with high proliferation rate, including embryonic and tumor cells. PIBF increases the synthesis of asymmetric antibodies and Th2 cytokines such as interleukins (IL) 4, 6 and 10, but decreases NK cells cytotoxic activity and Th1 cytokines such as tumor necrosis factor alpha (TNFα) and IL-12. The former causes a reduction in the rate Th1/Th2 that is distinctive of a healthy pregnancy, which it provokes an increment in humoral immunity as well as a decrease in cellular immunity. These immunomodulatory mechanisms enable the fetus to evade the mother immune system allowing pregnancy proceeds to term. Interestingly, several studies suggest that these same mechanisms are used by cancer cells to facilitate progression of tumors that exhibit overexpression of PIBF.</p></div>","PeriodicalId":31507,"journal":{"name":"TIP Revista Especializada en Ciencias QuimicoBiologicas","volume":"19 2","pages":"Pages 109-115"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2016-08-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.recqb.2016.06.004","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"87901674","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"OA","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
{"title":"CYTOTOXIC AND GENOTOXIC ACTIVITY OF PHENOLIC FRACTIONS FROM Ulomoides dermestoides FAIRMAIRE, 1893 (COLEOPTERA, TENEBRIONIDAE), IN HACAT CELLS","authors":"Dary Luz Mendoza-Meza, Pierine España-Puccini","doi":"10.1016/j.recqb.2016.06.001","DOIUrl":"10.1016/j.recqb.2016.06.001","url":null,"abstract":"<div><p><em>Ulomoides dermestoides</em> (Fairmaire, 1893) is a beetle used in alternative medicine treatments in some South American countries. The objective of this study was to evaluate the cytotoxic and genotoxic effects of phenolic fractions (PF) from <em>U. dermestoides</em>. The PF were separated from crude extracts in acetone (PFAc) and ethanol (PFEtOH). The total phenolic content (TPC) was determined by Folin-Ciocalteu test. Volatile and semi-volatile compounds presents in crude extracts were identified by GC-MS; moreover, phenolic fractions were analyzed by HPLC-MS. The cellular viability, after exposition to phenolic fractions, was determined by Trypan blue exclusion test and MTT reduction assay on immortalized human keratinocyte cell line (HaCat); the degree of DNA damage was detected by alkaline comet-DNA assay. The TPC in PFAc and PFEtOH were: 11.34±0.88 mgGAE/g and 6.52±1.28 mgGAE/g, respectively (mean.dif: 4.951; p value = 0.0000). In both samples, HPLC-MS showed a pseudo-molecular ion [M-H]<sup>−</sup> at m/z 153, tentatively identified as protocatechuic acid. The results of cytotoxic assays suggest that the viability of HaCat cells depends on the concentration and exposure time of each treatment. Furthermore, the comet assay revealed moderate genotoxic effect after 48<!--> <!-->hours of exposure to PFAc (40 to 160<!--> <!-->μg.mL<sup>−1</sup>); cytotoxic/genotoxic activity of this fraction could be related to the higher phenol contents.</p></div><div><p><em>Ulomoides dermestoides</em> (Fairmaire, 1893), es un escarabajo usado en medicina alternativa en algunos países de Sudamérica. El objetivo de este estudio fue evaluar el efecto citotóxico y genotóxico de fracciones fenólicas (FF) de extractos de <em>U. dermestoides</em>. Las FF se separaron desde extractos acetónicos (FFAc) y etanólicos (FFEtOH). El contenido de fenoles totales (CFT) se determinó mediante ensayo de Folin-Ciocalteu. Compuestos volátiles y semi-volátiles, presentes en los extractos crudos, se identificaron mediante CG-EM; por otra parte, las FF se analizaron por HPLC-EM. La viabilidad celular, después de exposición a las FF se determinó mediante la prueba de exclusión con azul de tripano y el ensayo de reducción con MTT, usando la línea celular de queratinocitos humanos inmortalizados (HaCat); el grado de daño en el ADN se detectó mediante el ensayo de ADN-cometa alcalino. CFT en FFAc y FFEtOH fueron: 11,34±0,88 mgAGE/g y 6,52±1,28 mgAGE/g, respectivamente (dif.media: 4,951; <em>p value</em> = 0.0000). En ambas muestras, HPLC-EM mostró un ion pseudo-molecular [M−H]<sup>−</sup> a 153m/z, identificado tentativamente como ácido protocateuico. Los resultados de los ensayos de citotoxicidad sugieren que la viabilidad de células HaCat depende de la concentración y el tiempo de exposición a cada tratamiento. Además, el ensayo cometa reveló efecto genotóxico moderado después de 48<!--> <!-->h de exposición a FFAc (40 a 160<!--> <!-->μg.mL<sup>−1</sup>). La actividad cit","PeriodicalId":31507,"journal":{"name":"TIP Revista Especializada en Ciencias QuimicoBiologicas","volume":"19 2","pages":"Pages 83-91"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2016-08-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.recqb.2016.06.001","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"83891703","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"OA","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Deyannira Otero-Moreno, María Teresa Peña-Rangel, Juan Rafael Riesgo-Escovar
{"title":"CRECIMIENTO Y METABOLISMO: LA REGULACIÓN Y LA VÍA DE LA INSULINA DESDE LA MOSCA DE LA FRUTA, Drosophila melanogaster","authors":"Deyannira Otero-Moreno, María Teresa Peña-Rangel, Juan Rafael Riesgo-Escovar","doi":"10.1016/j.recqb.2016.06.005","DOIUrl":"10.1016/j.recqb.2016.06.005","url":null,"abstract":"<div><p><em>Drosophila melanogaster</em>, la mosca de la fruta, es un organismo genético modelo que en años recientes se ha usado exitosamente para estudiar el control del metabolismo y el crecimiento. A pesar de poseer algunas diferencias con las vías de señalización homólogas a las de los vertebrados, las semejanzas son profundas y claras. En <em>D. melanogaster</em>, la vía de la insulina, homóloga a la de los vertebrados, regula tanto el metabolismo como el crecimiento del organismo a través de un receptor membranal único. A su vez, esta vía –que conjunta lo que en vertebrados es la vía de la insulina y la de los péptidos parecidos a la insulina- está regulada por la ingesta de nutrientes (carbohidratos y proteínas) y por el control hormonal (hormona del crecimiento, ecdisona, <em>upd2</em>, hormona adipocinética, <em>Ilp8</em>). En consecuencia, normalmente se obtiene un crecimiento adaptable a las condiciones nutricionales que influye, como en los vertebrados, en el promedio de vida y en la capacidad reproductiva con un tamaño típico y una diferenciación armónica, a tono con el <em>bauplan</em> del organismo. Por el contrario las mutaciones y desviaciones dan por resultado partes desproporcionadas, menor capacidad reproductiva, y disminución tanto del tamaño como de la proliferación, y hasta la muerte.</p></div><div><p>The fruit fly <em>Drosophila melanogaster</em> is a model genetic organism that has recently been used with great success in the study of metabolism and growth controls. In spite of several differences with vertebrates, commonalities are many and extensive. In flies, the insulin pathway, homologous to the vertebrate pathway, regulates metabolism, growth, and proliferation through a single, common membrane receptor. This pathway, jointly taking over the functions exerted by vertebrate insulin and insulin-like peptides, is regulated by nutrient levels (dietary carbohydrates and proteins), and by hormonal control (juvenile hormone, ecdysone, <em>upd2</em>, adipokinetic hormone, <em>Ilp8</em>). This means that normally growth, size, and harmony of body parts are adapted to the nutritional status, influencing life expectancy and reproduction, and resulting in the wild type in reaching typical adult sizes and proportions, as expected from the <em>bauplan</em>. Mutations and deviations normally end up in disproportionate growth of body parts, overall reduced size and reproduction, and, ultimately, death.</p></div>","PeriodicalId":31507,"journal":{"name":"TIP Revista Especializada en Ciencias QuimicoBiologicas","volume":"19 2","pages":"Pages 116-126"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2016-08-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.recqb.2016.06.005","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"127302955","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"OA","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
{"title":"SPECIES DIVERSITY AND PLASTID DNA HAPLOTYPE DISTRIBUTIONS OF PINUS SUBSECTION AUSTRALES (PINACEAE) IN GUERRERO AND OAXACA","authors":"Alfredo Ortiz-Martínez , David S. Gernandt","doi":"10.1016/j.recqb.2016.06.002","DOIUrl":"10.1016/j.recqb.2016.06.002","url":null,"abstract":"<div><p><em>Pinus</em> subsection <em>Australes</em> is a group of North American hard pines comprising approximately 29 ecologically and economically important tree species distributed throughout North and Central America and the Caribbean Islands. Previous studies have shown that some species of this subsection share plastid DNA haplotypes, a pattern that is attributed to introgressive hybridization or the retention of ancestral polymorphisms. Here we describe the morphological and plastid haplotype diversity for this group of species in the states of Guerrero and Oaxaca, Mexico. Seven species of <em>Pinus</em> subsection <em>Australes</em> are recognized in the study area, one of which, <em>P. patula</em>, includes two varieties. Seven variable sites and nine haplotypes were found in an 840 b.p. fragment of the DNA coding region <em>ycf1</em>. Shared haplotypes were found for <em>P. patula</em> var. <em>patula</em>, <em>P. patula</em> var. <em>longipedunculata</em>, <em>P. herrerae</em>, and <em>P. tecunumanii</em>. Four of the nine haplotypes found were restricted to Oaxaca. Although plastid DNA genealogies are valuable for studying evolution in this group, greater sampling of individuals and the inclusion of more variable sites are needed to more accurately infer species relationships.</p></div><div><p><em>Pinus</em> subsección <em>Australes</em> es un grupo de pinos duros de América del Norte que comprende aproximadamente 29 especies de árboles importantes económicamente y ecológicamente distribuidos a lo largo de toda América del Norte y Central y las Islas Caribeñas. Estudios previos han mostrado que las especies de esta subsección a menudo comparten haplotipos de ADN de plastidio, un patrón que es atribuido a la hibridación introgresiva y la retención de polimorfismos ancestrales. Aquí describimos la diversidad de haplotipos de plastidio y la morfología para este grupo de especies en los estados de Guerrero y Oaxaca, México. Siete especies de <em>Pinus</em> subsección <em>Australes</em> son reconocidas en el área de estudio, una de las cuales, <em>P. patula</em> incluye dos variedades. Siete sitios variables y nueve haplotipos fueron encontrados amplificando un fragmento de 840 p. b. de ADN de la región codificante <em>ycf1</em>. Se encontraron haplotipos compartidos para <em>P. patula</em> var. <em>patula</em>, <em>P</em>. <em>patula</em> var. <em>longipedunculata</em>, <em>P. herrerae</em> y <em>P. tecunumanii</em>. Cuatro de los nueve haplotipos encontrados están restringidos a Oaxaca. Aunque las genealogías de genes son valiosas para estudiar la evolución de este grupo, se requieren mayor muestreo de individuos y más sitios variables para la inferencia de relaciones entre las especies.</p></div>","PeriodicalId":31507,"journal":{"name":"TIP Revista Especializada en Ciencias QuimicoBiologicas","volume":"19 2","pages":"Pages 92-101"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2016-08-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.recqb.2016.06.002","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"78631755","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"OA","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
{"title":"ON THE NATURE OF EVOLUTION: AN EXPLICATIVE MODEL","authors":"Arcadio Monroy-Ata, Juan Carlos Peña-Becerril","doi":"10.1016/j.recqb.2016.06.006","DOIUrl":"10.1016/j.recqb.2016.06.006","url":null,"abstract":"<div><p>For years, links between entropy and information of a system have been proposed, but their changes in time and in their probabilistic structural states have not been proved in a robust model as a unique process. This document demonstrates that increasement in entropy and information of a system are the two paths for changes in its configuration status. Biological evolution also has a trend toward information accumulation and complexity. In this approach, the aim of this article is to answer the question: What is the driven force of biological evolution? For this, an analogy between the evolution of a living system and the transmission of a message in time was made, both in the middle of environmental noise and stochasticity. A mathematical model, initially developed by Norbert Wiener, was employed to show the dynamics of the amount of information in a message, using a time series and the Brownian motion as statistical frame. Léon Brillouin's mathematical definition of information and Claude Shannon's entropy equation were employed, both are similar, in order to know changes in the two physical properties. The proposed model includes time and configurational probabilities of the system and it is suggested that entropy can be considered as missing information, according to Arieh Ben–Naim. In addition, a graphic shows that information accumulation can be the driven force of both processes: evolution (gain in information and complexity), and increase in entropy (missing information and restrictions loss). Finally, a living system can be defined as a dynamic set of information coded in a reservoir of genetic, epigenetic and ontogenic programs, in the middle of environmental noise and stochasticity, which points toward an increase in fitness and functionality.</p></div><div><p>Durante años se han propuesto vínculos entre entropía e información de un sistema, pero sus cambios en tiempo y en sus estados estructurales probabilísticos no han sido probados en un modelo robusto como un proceso único. Este documento demuestra que incrementos en entropía e información de un sistema son las dos sendas para cambios en su estado configuracional. También, la evolución biológica tiene una tendencia hacia una acumulación de información y complejidad. Con este enfoque, aquí se planteó como objetivo contestar la pregunta: ¿Cuál es la fuerza motriz de la evolución biológica? Para esto, se hizo una analogía entre la evolución de un sistema vivo y la transmisión de un mensaje en el tiempo, ambos en medio de ruido y estocasticidad ambiental. Se empleó un modelo matemático, desarrollado inicialmente por Norbert Wiener, para mostrar la dinámica de la cantidad de información de un mensaje, usando una serie de tiempo y el movimiento Browniano como estructura estadística. Se utilizó la definición matemática de información de Léon Brillouin y la ecuación de la entropía de Claude Shannon, ambas son similares, para conocer los cambios en las dos propiedades físicas. El mo","PeriodicalId":31507,"journal":{"name":"TIP Revista Especializada en Ciencias QuimicoBiologicas","volume":"19 2","pages":"Pages 127-132"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2016-08-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.recqb.2016.06.006","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"96466983","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"OA","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Martha I. Camacho, Dimitris Georgellis, Adrián F. Álvarez
{"title":"EL CIRCUITO REGULATORIO BARA/UVRY-CSRA EN ESCHERICHIA COLI Y SUS HOMÓLOGOS EN LAS γ-PROTEOBACTERIAS","authors":"Martha I. Camacho, Dimitris Georgellis, Adrián F. Álvarez","doi":"10.1016/j.recqb.2016.02.002","DOIUrl":"10.1016/j.recqb.2016.02.002","url":null,"abstract":"<div><p>El sistema de dos-componentes BarA/UvrY de <em>Escherichia coli</em> activa directamente la expresión de los RNAs pequeños no-codificantes CsrB y CsrC. Estos RNAs pequeños funcionan como antagonistas de la actividad de la proteína CsrA, la cual regula positiva y negativamente la traducción de múltiples mensajeros blanco. El circuito BarA/UvrY-CsrA está conservado en las γ-proteobacterias y aunque el mecanismo de acción se mantiene, existen importantes diferencias funcionales que representan los requerimientos especiales de cada especie bacteriana. En esta revisión compararemos las estrategias que diferentes bacterias emplean para llevar a cabo la regulación del mencionado circuito en función a su estilo de vida.</p></div><div><p>The BarA/UvrY two-component system of <em>Escherichia coli</em> directly activates the expression of the small non-coding RNAs CsrB and CsrC. These small RNAs function as antagonist of the CsrA activity, which regulates the translation of numerous target mRNAs. The BarA/UvrY-CsrA circuitry is conserved in the γ-proteobacteria and although the mechanism of action is preserved, there are important functional differences that represent the particular requirements of each bacterial species. In this review we compare the strategies that different bacterial species employ in order to carry out the regulation of the above circuitry in function of their life style.</p></div>","PeriodicalId":31507,"journal":{"name":"TIP Revista Especializada en Ciencias QuimicoBiologicas","volume":"19 1","pages":"Pages 15-23"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2016-01-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.recqb.2016.02.002","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"81122805","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"OA","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Francisco Sánchez-Beristain , Pedro García-Barrera , Laura Calvillo-Canadell
{"title":"Mares calcíticos y aragoníticos: efectos en organismos formadores de arrecifes a través del tiempo","authors":"Francisco Sánchez-Beristain , Pedro García-Barrera , Laura Calvillo-Canadell","doi":"10.1016/j.recqb.2016.02.005","DOIUrl":"10.1016/j.recqb.2016.02.005","url":null,"abstract":"<div><p>La química de los océanos ha cambiado a lo largo del tiempo geológico. En concreto, se reconocen cambios en la salinidad de los mismos, y en particular, las variaciones seculares alternantes entre la calcita baja en magnesio (LMC), y la aragonita o calcita alta en magnesio (HMC), como el polimorfo predominante del carbonato de calcio. Un mar calcítico, en el cual se precipita preferentemente la LMC, está asociado a altas tasas de expansión oceánica, así como también a altos niveles de CO<sub>2</sub> en la atmósfera y al subsecuente efecto invernadero de escala global. Químicamente, un mar calcítico está relacionado con una proporción Mg/Ca < 2. Lo contrario, en un mar aragonítico se precipitan tanto la calcita alta en magnesio como la aragonita. La proporción Mg/Ca suele ser > 2. A este tipo de “mares” se asocian bajas tasas de expansión oceánica con bajos niveles de CO<sub>2</sub> atmosférico y están relacionados a un “efecto nevera” (icehouse effect).</p><p>La química de los océanos tiene repercusiones en los organismos que los habitan particularmente en los constructores de arrecifes, como las esponjas, corales y algas coralinas, entre otros. Los fósiles encontrados en intervalos calcíticos están caracterizados por una mineralogía de LMC, mientras que los que corresponden a intervalos aragoníticos, lo están con una mineralogía de aragonita o HMC. No obstante, es interesante notar que en un mismo linaje, pueden prevalecer ambas mineralogías, si dicho linaje abarca una intercalación de intervalos calcíticos-aragoníticos.</p></div><div><p>The chemistry of the oceans has changed over the passage of geological time. Specifically, changes are recognized in the salt composition thereof, and in particular secular variations alternating between low magnesium calcite (LMC) and aragonite / high magnesium calcite (HMC) as the predominant polymorph of calcium carbonate. A calcitic sea, where LMC is precipitated, is associated with high rates of oceanic expansion, as well as with high levels of CO<sub>2</sub> in the atmosphere and a global greenhouse effect. Chemically, it is related to an Mg / Ca <2. Meanwhile, in an ocean where Mg / Ca is usually> 2, aragonite or HMC are preferably precipitated. This type of “seas” are related to low oceanic expansion rates and also to lower atmospheric CO<sub>2</sub> levels in comparison with calcitic seas. Furthermore, aragonitic seas are usually related to “icehouse effect” episodes.</p><p>The changes in the chemistry of the oceans affects the organisms that inhabit them, and in particular, in reef-building organisms such as such as sponges, corals and coralline algae, among others. Fossils found in a calcitic interval are characterised by a LMC mineralogy, whereas those found in an aragonitic interval, have a mineralogy consisting either of aragonite/HMC. Nonetheless, it is interesting to pinpoint that both mineralogies can appear in a same clade, if this clade is encompassed in a succession of cal","PeriodicalId":31507,"journal":{"name":"TIP Revista Especializada en Ciencias QuimicoBiologicas","volume":"19 1","pages":"Pages 45-53"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2016-01-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.recqb.2016.02.005","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"78810587","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"OA","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}