SPECIES DIVERSITY AND PLASTID DNA HAPLOTYPE DISTRIBUTIONS OF PINUS SUBSECTION AUSTRALES (PINACEAE) IN GUERRERO AND OAXACA

Alfredo Ortiz-Martínez , David S. Gernandt
{"title":"SPECIES DIVERSITY AND PLASTID DNA HAPLOTYPE DISTRIBUTIONS OF PINUS SUBSECTION AUSTRALES (PINACEAE) IN GUERRERO AND OAXACA","authors":"Alfredo Ortiz-Martínez ,&nbsp;David S. Gernandt","doi":"10.1016/j.recqb.2016.06.002","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"<div><p><em>Pinus</em> subsection <em>Australes</em> is a group of North American hard pines comprising approximately 29 ecologically and economically important tree species distributed throughout North and Central America and the Caribbean Islands. Previous studies have shown that some species of this subsection share plastid DNA haplotypes, a pattern that is attributed to introgressive hybridization or the retention of ancestral polymorphisms. Here we describe the morphological and plastid haplotype diversity for this group of species in the states of Guerrero and Oaxaca, Mexico. Seven species of <em>Pinus</em> subsection <em>Australes</em> are recognized in the study area, one of which, <em>P. patula</em>, includes two varieties. Seven variable sites and nine haplotypes were found in an 840 b.p. fragment of the DNA coding region <em>ycf1</em>. Shared haplotypes were found for <em>P. patula</em> var. <em>patula</em>, <em>P. patula</em> var. <em>longipedunculata</em>, <em>P. herrerae</em>, and <em>P. tecunumanii</em>. Four of the nine haplotypes found were restricted to Oaxaca. Although plastid DNA genealogies are valuable for studying evolution in this group, greater sampling of individuals and the inclusion of more variable sites are needed to more accurately infer species relationships.</p></div><div><p><em>Pinus</em> subsección <em>Australes</em> es un grupo de pinos duros de América del Norte que comprende aproximadamente 29 especies de árboles importantes económicamente y ecológicamente distribuidos a lo largo de toda América del Norte y Central y las Islas Caribeñas. Estudios previos han mostrado que las especies de esta subsección a menudo comparten haplotipos de ADN de plastidio, un patrón que es atribuido a la hibridación introgresiva y la retención de polimorfismos ancestrales. Aquí describimos la diversidad de haplotipos de plastidio y la morfología para este grupo de especies en los estados de Guerrero y Oaxaca, México. Siete especies de <em>Pinus</em> subsección <em>Australes</em> son reconocidas en el área de estudio, una de las cuales, <em>P. patula</em> incluye dos variedades. Siete sitios variables y nueve haplotipos fueron encontrados amplificando un fragmento de 840 p. b. de ADN de la región codificante <em>ycf1</em>. Se encontraron haplotipos compartidos para <em>P. patula</em> var. <em>patula</em>, <em>P</em>. <em>patula</em> var. <em>longipedunculata</em>, <em>P. herrerae</em> y <em>P. tecunumanii</em>. Cuatro de los nueve haplotipos encontrados están restringidos a Oaxaca. Aunque las genealogías de genes son valiosas para estudiar la evolución de este grupo, se requieren mayor muestreo de individuos y más sitios variables para la inferencia de relaciones entre las especies.</p></div>","PeriodicalId":31507,"journal":{"name":"TIP Revista Especializada en Ciencias QuimicoBiologicas","volume":"19 2","pages":"Pages 92-101"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2016-08-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.recqb.2016.06.002","citationCount":"3","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"TIP Revista Especializada en Ciencias QuimicoBiologicas","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1405888X1630002X","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
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Abstract

Pinus subsection Australes is a group of North American hard pines comprising approximately 29 ecologically and economically important tree species distributed throughout North and Central America and the Caribbean Islands. Previous studies have shown that some species of this subsection share plastid DNA haplotypes, a pattern that is attributed to introgressive hybridization or the retention of ancestral polymorphisms. Here we describe the morphological and plastid haplotype diversity for this group of species in the states of Guerrero and Oaxaca, Mexico. Seven species of Pinus subsection Australes are recognized in the study area, one of which, P. patula, includes two varieties. Seven variable sites and nine haplotypes were found in an 840 b.p. fragment of the DNA coding region ycf1. Shared haplotypes were found for P. patula var. patula, P. patula var. longipedunculata, P. herrerae, and P. tecunumanii. Four of the nine haplotypes found were restricted to Oaxaca. Although plastid DNA genealogies are valuable for studying evolution in this group, greater sampling of individuals and the inclusion of more variable sites are needed to more accurately infer species relationships.

Pinus subsección Australes es un grupo de pinos duros de América del Norte que comprende aproximadamente 29 especies de árboles importantes económicamente y ecológicamente distribuidos a lo largo de toda América del Norte y Central y las Islas Caribeñas. Estudios previos han mostrado que las especies de esta subsección a menudo comparten haplotipos de ADN de plastidio, un patrón que es atribuido a la hibridación introgresiva y la retención de polimorfismos ancestrales. Aquí describimos la diversidad de haplotipos de plastidio y la morfología para este grupo de especies en los estados de Guerrero y Oaxaca, México. Siete especies de Pinus subsección Australes son reconocidas en el área de estudio, una de las cuales, P. patula incluye dos variedades. Siete sitios variables y nueve haplotipos fueron encontrados amplificando un fragmento de 840 p. b. de ADN de la región codificante ycf1. Se encontraron haplotipos compartidos para P. patula var. patula, P. patula var. longipedunculata, P. herrerae y P. tecunumanii. Cuatro de los nueve haplotipos encontrados están restringidos a Oaxaca. Aunque las genealogías de genes son valiosas para estudiar la evolución de este grupo, se requieren mayor muestreo de individuos y más sitios variables para la inferencia de relaciones entre las especies.

格雷罗州和瓦哈卡州南方松(松科)的物种多样性和质体DNA单倍型分布
澳大利亚松(Pinus)是一组北美硬松,包括大约29种生态和经济上重要的树种,分布在北美和中美洲以及加勒比群岛。先前的研究表明,这部分的一些物种共享质体DNA单倍型,这种模式归因于渐进杂交或祖先多态性的保留。本文描述了墨西哥格雷罗州和瓦哈卡州这组物种的形态和质体单倍型多样性。研究区共有7种南方松(Pinus subaustrales),其中带斑松(P. patula)包括2个变种。在840b.p.的DNA编码区ycf1片段中发现了7个可变位点和9个单倍型。发现了斑马鱼变种、长柄斑马鱼变种、疱疹斑马鱼变种和tecunumanii斑马鱼共有的单倍型。发现的9个单倍型中有4个仅限于瓦哈卡州。尽管质体DNA谱系对研究这一群体的进化很有价值,但要更准确地推断物种关系,还需要更多的个体样本和更多的可变位点。澳大利亚松subsección属于北方黑松组,大约有29个品种,árboles重要品种económicamente和ecológicamente分布品种,主要品种为北方黑松和中部黑松Caribeñas。研究人员通过研究不同的物种,发现了不同的物种,发现了不同的物种,发现了不同的物种,发现了不同的物种,发现了不同的物种,发现了不同的物种,发现了不同的物种。Aquí描述了la diversidad de haplotipos de plastidio的la morfología para este grupo de especies en los estados de Guerrero y Oaxaca,墨西哥。澳洲松(subsección Australes son reconocidas)五种(área de estudio),美洲松(una de las culales),苍松(P. patula)包括多种树木。结果表明,单倍性基因突变对基因扩增和片段化的影响为840p . de ADN de la región codificante ycf1。四对抗性单倍性:带带假单倍性:带带假单倍性:长柄假单倍性:带带假单倍性:带带假单倍性:带带假单倍性:带带假单倍性:带带假单倍性:带带假单倍性:带带假单倍性瓦哈卡州的Cuatro de los nueve haplotipos encontros están restringidos a Oaxaca。unque las genealogías de genes son valiosas para estudiar la evolución de este groupporo, se需要通过más情境变量para la interencia de relacones entre species来确定个体。
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