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Examining intra-host genetic variation of RSV by short read high-throughput sequencing. 通过短读数高通量测序研究 RSV 的宿主内遗传变异。
Revista CS en Ciencias Sociales Pub Date : 2024-09-03 DOI: 10.1101/2023.05.17.541198
David Henke, Felipe-Andrés Piedra, Vasanthi Avadhanula, Harsha Doddapaneni, Donna M Muzny, Vipin K Menon, Kristi L Hoffman, Matthew C Ross, Sara J Javornik Cregeen, Ginger Metcalf, Richard A Gibbs, Joseph F Petrosino, Pedro A Piedra
{"title":"Examining intra-host genetic variation of RSV by short read high-throughput sequencing.","authors":"David Henke, Felipe-Andrés Piedra, Vasanthi Avadhanula, Harsha Doddapaneni, Donna M Muzny, Vipin K Menon, Kristi L Hoffman, Matthew C Ross, Sara J Javornik Cregeen, Ginger Metcalf, Richard A Gibbs, Joseph F Petrosino, Pedro A Piedra","doi":"10.1101/2023.05.17.541198","DOIUrl":"10.1101/2023.05.17.541198","url":null,"abstract":"<p><p>Every viral infection entails an evolving population of viral genomes. High-throughput sequencing technologies can be used to characterize such populations, but to date there are few published examples of such work. In addition, mixed sequencing data are sometimes used to infer properties of infecting genomes without discriminating between genome-derived reads and reads from the much more abundant, in the case of a typical active viral infection, transcripts. Here we apply capture probe-based short read high-throughput sequencing to nasal wash samples taken from a previously described group of adult hematopoietic cell transplant (HCT) recipients naturally infected with respiratory syncytial virus (RSV). We separately analyzed reads from genomes and transcripts for the levels and distribution of genetic variation by calculating per position Shannon entropies. Our analysis reveals a low level of genetic variation within the RSV infections analyzed here, but with interesting differences between genomes and transcripts in 1) average per sample Shannon entropies; 2) the genomic distribution of variation 'hotspots'; and 3) the genomic distribution of hotspots encoding alternative amino acids. In all, our results suggest the importance of separately analyzing reads from genomes and transcripts when interpreting high-throughput sequencing data for insight into intra-host viral genome replication, expression, and evolution.</p>","PeriodicalId":43223,"journal":{"name":"Revista CS en Ciencias Sociales","volume":"1 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2024-09-03","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC11398394/pdf/","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"89694399","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"OA","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Entre la invisibilidad y la libertad: construir paz desde organizaciones LGBT en el norte del Cauca 在隐形与自由之间:从北考卡的LGBT组织建立和平
Revista CS en Ciencias Sociales Pub Date : 2023-11-08 DOI: 10.18046/recs.i41.02
Alejandra Erazo-Gómez, Hobeth Martínez-Carrillo, Luz Aleyda Palta-Calambas
{"title":"Entre la invisibilidad y la libertad: construir paz desde organizaciones LGBT en el norte del Cauca","authors":"Alejandra Erazo-Gómez, Hobeth Martínez-Carrillo, Luz Aleyda Palta-Calambas","doi":"10.18046/recs.i41.02","DOIUrl":"https://doi.org/10.18046/recs.i41.02","url":null,"abstract":"El artículo argumenta la íntima relación del movimiento LGBT en Colombia con la paz. Desde lo nacional, la primera agenda de género y LGBT por la paz surgió a partir de la participación de dicho movimiento en el proceso de paz del Caguán. Después de 16 años, organizaciones LGBT consolidadas incidieron para asegurar que el enfoque de género en el acuerdo de La Habana incluyera efectivamente a esta población. En lo local se focalizará en la experiencia del norte del Cauca —donde desde 2018 se han consolidado más organizaciones LGBT rurales. El análisis argumenta que esto ha sido posible tanto por la coyuntura de transición de la guerra a la paz, como por el fortalecimiento autónomo e institucional de activismos locales. La investigación se realizó a partir de una metodología cualitativa que incluyó trabajo de campo con organizaciones de alcance nacional, regional y local, y revisión de fuentes secundarias.","PeriodicalId":43223,"journal":{"name":"Revista CS en Ciencias Sociales","volume":"73 4","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-11-08","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135342587","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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La percepción del clasismo y el racismo colorista en la publicidad mexicana 墨西哥广告中的阶级主义和色彩种族主义观念
Revista CS en Ciencias Sociales Pub Date : 2023-10-31 DOI: 10.18046/recs.i41.01
Juris Tipa
{"title":"La percepción del clasismo y el racismo colorista en la publicidad mexicana","authors":"Juris Tipa","doi":"10.18046/recs.i41.01","DOIUrl":"https://doi.org/10.18046/recs.i41.01","url":null,"abstract":"Aunque existen varias investigaciones que estudian el discurso y las representaciones racistas en los medios de comunicación en México, la producción del conocimiento sobre la percepción de estos contenidos mediáticos por parte de las audiencias es escasa. Utilizando entrevistas cualitativas, en el presente artículo se analiza cómo las audiencias interpretan y valoran los contenidos mediáticos mexicanos, particularmente la publicidad que se encuentra permeada por representaciones racistas y clasistas coloristas. Esto con el fin de indagar sobre la existencia de una posible reflexión crítica, o ausencia de ella, en relación con el subyacente racismo y clasismo colorista en los medios de comunicación nacionales. Se concluye que, por lo general, existe una decodificación crítica del discurso publicitario asociado con dichas representaciones, no obstante, esta varía y contiene distintos matices entre personas de diferentes edades y contextos socioeconómicos.","PeriodicalId":43223,"journal":{"name":"Revista CS en Ciencias Sociales","volume":"160 2","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-10-31","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135869787","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Aproximaciones emergentes sobre la generación de conocimiento científico 科学知识生成的新方法
Revista CS en Ciencias Sociales Pub Date : 2023-09-13 DOI: 10.18046/recs.i40.6426
Adolfo A. Abadía, María Alejandra Tejada-Gómez
{"title":"Aproximaciones emergentes sobre la generación de conocimiento científico","authors":"Adolfo A. Abadía, María Alejandra Tejada-Gómez","doi":"10.18046/recs.i40.6426","DOIUrl":"https://doi.org/10.18046/recs.i40.6426","url":null,"abstract":"","PeriodicalId":43223,"journal":{"name":"Revista CS en Ciencias Sociales","volume":"15 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-09-13","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135786490","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Constitucionalismo dialógico y justicia constitucional. Una vuelta larga para volver a las virtudes deliberativas de la Acción Pública de Inconstitucionalidad 对话宪政与宪法正义。这是一个漫长的旅程，要回到公共行动违宪的审议美德
Revista CS en Ciencias Sociales Pub Date : 2023-09-06 DOI: 10.18046/recs.i40.5672
María Luisa Rodríguez-Peñaranda
{"title":"Constitucionalismo dialógico y justicia constitucional. Una vuelta larga para volver a las virtudes deliberativas de la Acción Pública de Inconstitucionalidad","authors":"María Luisa Rodríguez-Peñaranda","doi":"10.18046/recs.i40.5672","DOIUrl":"https://doi.org/10.18046/recs.i40.5672","url":null,"abstract":"Mediante el Constitucionalismo Dialógico (CD) algunos teóricos creen haber encontrado una válvula de escape a la discusión global sobre la legitimidad del control judicial a la ley. Con la metodología situada contextual, este artículo analizará los desafíos que plantea el CD en Latinoamérica, en especial en Colombia, analizando: i) por qué es una teoría atractiva; ii) sus diferencias con la democracia deliberativa (DD); iii) los argumentos de Roberto Gargarella al defender la DD, el CD y una conversación entre iguales, lo que nos invita a interrogarnos sobre si se trata de nuevos empaques a viejas discusiones. También, se abordará el CD en sus dos versiones: institucional canadiense y conversacional para, proponer una nuestramericana. Por último, iv) se reflexionará sobre las ventajas de la Acción Pública de Inconstitucionalidad (AP) como mecanismo de impugnación legal, participativo y deliberativo, no bien apreciado en sus potencialidades dialógicas, en virtud de un sesgo de preferencia.","PeriodicalId":43223,"journal":{"name":"Revista CS en Ciencias Sociales","volume":"109 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-09-06","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135204717","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Performances solidarias. Apoyo público al Paro Nacional Agrario del 2013 en Colombia 表演互助。公众支持哥伦比亚2013年全国农业罢工·全球之声
Revista CS en Ciencias Sociales Pub Date : 2023-08-25 DOI: 10.18046/recs.i40.5745
Juan Camilo Portela-García
{"title":"Performances solidarias. Apoyo público al Paro Nacional Agrario del 2013 en Colombia","authors":"Juan Camilo Portela-García","doi":"10.18046/recs.i40.5745","DOIUrl":"https://doi.org/10.18046/recs.i40.5745","url":null,"abstract":"Este artículo tiene como objetivo presentar cómo se posicionó una interpretación favorable al Paro Nacional Agrario en la esfera pública. Para esto, se propuso la categoría de performance solidaria para dar cuenta del apoyo de actores, cuyas posiciones morales los llevaron a comprometerse activamente en el curso del conflicto, aunque no pertenecieran al grupo ofendido. Se construyó un archivo documental que dio cuenta de dichas performances para lo cual se hizo la revisión documental de varias fuentes y entrevistas a participantes de la protesta. Se propone que el apoyo fue posible gracias una coalición simbólica que derivó en una interpretación común: el campesinado en paro era una víctima que compartía lazos ancestrales e históricos con los demás sectores de la sociedad colombiana. La clasificación de la protesta como acción insurgente cedió ante su codificación como acción democrática, gracias al compromiso manifestado en las performances solidarias.","PeriodicalId":43223,"journal":{"name":"Revista CS en Ciencias Sociales","volume":"4 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-08-25","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"134930763","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Ciencias sociales y humanas: retos y desafíos. Entrevista a Bexi Perdomo y Tomás Darío Marín Velásquez 社会与人文科学:挑战与挑战。采访Bexi Perdomo和tomas dario marin velasquez
Revista CS en Ciencias Sociales Pub Date : 2023-08-22 DOI: 10.18046/recs.i40.5777
Juan Joel Linares-Simancas
{"title":"Ciencias sociales y humanas: retos y desafíos. Entrevista a Bexi Perdomo y Tomás Darío Marín Velásquez","authors":"Juan Joel Linares-Simancas","doi":"10.18046/recs.i40.5777","DOIUrl":"https://doi.org/10.18046/recs.i40.5777","url":null,"abstract":"<jats:p>n/a</jats:p>","PeriodicalId":43223,"journal":{"name":"Revista CS en Ciencias Sociales","volume":"95 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-08-22","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135716373","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Perfil del postulante a Pedagogía y atracción de estudiantes académicamente talentosos en un contexto de mayores incentivos a la demanda 在更大的需求激励背景下，申请人对教学和吸引学术人才的概况
Revista CS en Ciencias Sociales Pub Date : 2023-08-18 DOI: 10.18046/recs.i40.5584
Denisse Espinosa-Valenzuela, Carlos Rodríguez-Garcés, Geraldo Padilla-Fuentes
{"title":"Perfil del postulante a Pedagogía y atracción de estudiantes académicamente talentosos en un contexto de mayores incentivos a la demanda","authors":"Denisse Espinosa-Valenzuela, Carlos Rodríguez-Garcés, Geraldo Padilla-Fuentes","doi":"10.18046/recs.i40.5584","DOIUrl":"https://doi.org/10.18046/recs.i40.5584","url":null,"abstract":"Este artículo explora, mediante análisis estadísticos descriptivos e inferenciales, los perfiles de postulantes y matriculados en programas de pedagogía sobre la base de sus atributos socioeconómicos y de trayectoria escolar, con información reportada del proceso de admisión a las universidades chilenas del año 2020. Dentro de los principales hallazgos se observa, junto a su histórica presencia femenina, una predominancia de estudiantes que, exhibiendo un buen desempeño escolar durante la enseñanza media, no logran refrendar dicho comportamiento en las pruebas de admisión universitaria. En las conclusiones se destaca que los programas de pedagogía, pese a las nuevas disposiciones y políticas de incentivo, no han sido capaces de atraer a estudiantes académicamente más talentosos.","PeriodicalId":43223,"journal":{"name":"Revista CS en Ciencias Sociales","volume":"5 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-08-18","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"136064254","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Violencia armada y salud en América Latina: revisión de la literatura 拉丁美洲的武装暴力与健康:文献综述
Revista CS en Ciencias Sociales Pub Date : 2023-08-16 DOI: 10.18046/recs.i40.5497
Fernanda Mendes Lages Ribeiro, Cristiane Batista Andrade, Camila Athayde de Oliveira Dias, Brena Costa de Almeida
{"title":"Violencia armada y salud en América Latina: revisión de la literatura","authors":"Fernanda Mendes Lages Ribeiro, Cristiane Batista Andrade, Camila Athayde de Oliveira Dias, Brena Costa de Almeida","doi":"10.18046/recs.i40.5497","DOIUrl":"https://doi.org/10.18046/recs.i40.5497","url":null,"abstract":"El artículo analizó la presencia de la Violencia Armada (VA) en América Latina (AL), en espacios vulnerables y sus impactos en la salud de la población. Como metodología se adoptó una revisión integrativa de la literatura con análisis de 33 artículos. La AV en AL está asociada al proceso de colonización, las desigualdades sociales, la violencia estructural, los conflictos bélicos entre el crimen organizado y el Estado y los homicidios. Impone dificultades en la actuación de los profesionales de la salud, interrupción de los vínculos asistenciales y terapéuticos, sentimientos de miedo y frustración, angustia psicológica, estrés y depresión. Se concluye que el peso histórico de la colonización latinoamericana cosifica las vulnerabilidades en ciertos territorios afectados por la VA; esto debe ser visto como un problema de salud pública que requiere el desarrollo de políticas públicas para enfrentarlo.","PeriodicalId":43223,"journal":{"name":"Revista CS en Ciencias Sociales","volume":"200 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-08-16","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135022780","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Después del multiculturalismo: logros y desafíos de la población afrodescendiente en América Latina y el Caribe 多元文化主义之后:拉丁美洲和加勒比非洲裔人口的成就和挑战
Revista CS en Ciencias Sociales Pub Date : 2023-08-15 DOI: 10.18046/recs.i40.6361
Juan Diego Mejía-Estrada
{"title":"Después del multiculturalismo: logros y desafíos de la población afrodescendiente en América Latina y el Caribe","authors":"Juan Diego Mejía-Estrada","doi":"10.18046/recs.i40.6361","DOIUrl":"https://doi.org/10.18046/recs.i40.6361","url":null,"abstract":"<jats:p>n/a</jats:p>","PeriodicalId":43223,"journal":{"name":"Revista CS en Ciencias Sociales","volume":"4 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-08-15","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135164669","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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