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Challenges and Issues on Extracting Named Entities from Oncology Clinical Notes 从肿瘤临床记录中提取命名实体的挑战和问题
Journal of health informatics Pub Date : 2023-07-20 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1097
Luiz Henrique Pereira Niero, João Vitor Andrioli de Souza, Luciana Martins Gomes da Silva, Yohan Bonescki Gumiel, N. H. Borges, G. Piotto, Gustavo Giavarini, Lucas E. S. Oliveira
{"title":"Challenges and Issues on Extracting Named Entities from Oncology Clinical Notes","authors":"Luiz Henrique Pereira Niero, João Vitor Andrioli de Souza, Luciana Martins Gomes da Silva, Yohan Bonescki Gumiel, N. H. Borges, G. Piotto, Gustavo Giavarini, Lucas E. S. Oliveira","doi":"10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1097","DOIUrl":"https://doi.org/10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1097","url":null,"abstract":"This article aims to describe the annotation process of a multi-institutional corpus of clinical texts in the oncology specialty and to train models for the Recognition of Named Entities. We use the annotated corpus to train models with different amounts of data and compare the model result with the amount of data used in training. The training of the models was done from the fine-tuning of the Bidirectional Encoder Representations from Transformers adapted to the medical-biological domain of the Portuguese language (BioBERTpt). To compare model behavior with increasing training data, models were trained with incremental amounts of data. As a result, we found that models trained with smaller but fully revised datasets performed better than models trained with larger datasets with little revision.","PeriodicalId":91119,"journal":{"name":"Journal of health informatics","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-07-20","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"48920017","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Editorial 社论
Journal of health informatics Pub Date : 2023-07-20 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1072
Julian E. Gaspar
{"title":"Editorial","authors":"Julian E. Gaspar","doi":"10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1072","DOIUrl":"https://doi.org/10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1072","url":null,"abstract":"","PeriodicalId":91119,"journal":{"name":"Journal of health informatics","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-07-20","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"45927294","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Sistema para auxílio na aplicação e análise da Ausculta Pulmonar 肺听诊的应用和分析辅助系统
Journal of health informatics Pub Date : 2023-07-20 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1105
G. Leon, É. Amaral, Julio Saraçol Domingues Júnior
{"title":"Sistema para auxílio na aplicação e análise da Ausculta Pulmonar","authors":"G. Leon, É. Amaral, Julio Saraçol Domingues Júnior","doi":"10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1105","DOIUrl":"https://doi.org/10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1105","url":null,"abstract":"A fisioterapia respiratória é um dos principais tratamentos para as doenças pulmonares. A ausculta pulmonar é extremamente importante, pois trata-se do principal método de exame físico do tórax que permite uma melhor análise do funcionamento pulmonar para detecção de doenças respiratórias. Trata-se do desenvolvimento de um sistema capaz de auxiliar na aplicação da técnica de ausculta pulmonar, por meio de um dispositivo capaz de capturar dados sonoros durante a etapa da aplicação da técnica. Este sistema conta com integração de hardware e software. Além disso, o sistema permitiu que estudantes e profissionais de saúde realizassem uma capacitação para o auxílio na identificação acústica de sons pulmonares. Ademais, foram realizados experimentos com fisioterapeutas, avaliando todas as funções desenvolvidas na solução. Os resultados obtidos demonstraram um alto potencial de aplicabilidade para a problemática proposta.","PeriodicalId":91119,"journal":{"name":"Journal of health informatics","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-07-20","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"46590380","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Application of transcranial brain stimulation in dementia. 经颅脑刺激在痴呆中的应用。
IF 1.5
Journal of health informatics Pub Date : 2023-07-12 eCollection Date: 2023-10-01 DOI: 10.4103/tcmj.tcmj_91_23
Yuncin Luo, Feng-Yi Yang, Raymond Y Lo
{"title":"Application of transcranial brain stimulation in dementia.","authors":"Yuncin Luo, Feng-Yi Yang, Raymond Y Lo","doi":"10.4103/tcmj.tcmj_91_23","DOIUrl":"10.4103/tcmj.tcmj_91_23","url":null,"abstract":"<p><p>The number of patients with dementia grows rapidly as the global population ages, which posits tremendous health-care burden to the society. Only cholinesterase inhibitors and a N-methyl-D-aspartate receptor antagonist have been approved for treating patients with Alzheimer's disease (AD), and their clinical effects remained limited. Medical devices serve as an alternative therapeutic approach to modulating neural activities and enhancing cognitive function. Four major brain stimulation technologies including deep brain stimulation (DBS), transcranial magnetic stimulation (TMS), transcranial direct current stimulation (tDCS), and transcranial ultrasound stimulation (TUS) have been applied to AD in a clinical trial setting. DBS allows electrical stimulation at the specified nucleus but remains resource-demanding, and after all, an invasive surgery; whereas TMS and tDCS are widely available and affordable but less ideal with respect to localization. The unique physical property of TUS, on the other hand, allows both thermal and mechanical energy to be transduced and focused for neuromodulation. In the context of dementia, using focused ultrasound to induce blood-brain barrier opening for delivering drugs and metabolizing amyloid protein has drawn great attention in recent years. Furthermore, low-intensity pulsed ultrasound has demonstrated its neuroprotective effects in both <i>in vitro</i> and <i>in vivo</i> studies, leading to ongoing clinical trials for AD. The potential and limitation of transcranial brain stimulation for treating patients with dementia would be discussed in this review.</p>","PeriodicalId":91119,"journal":{"name":"Journal of health informatics","volume":"1 1","pages":"300-305"},"PeriodicalIF":1.5,"publicationDate":"2023-07-12","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10683520/pdf/","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"88451203","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"OA","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Leishmaniose Cutânea no Estado do Pará, Brasil: Análise Baseada em Lógica Fuzzy 巴西para州皮肤利什曼病:基于模糊逻辑的分析
Journal of health informatics Pub Date : 2023-06-19 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.i1.2023.986
Bruna Costa de Souza, Gabriela Sato Santa Brígida, Cláudia do Socorro Carvalho Miranda, Danilo De Souza Novaes, R. C. Figueiredo, Simone Beverly Nascimento da Costa, Silvana Rossy de Brito, Emerson Cordeiro Morais, Leonardo Luis De Oliveira Miranda, Nelson Veiga Gonçalves
{"title":"Leishmaniose Cutânea no Estado do Pará, Brasil: Análise Baseada em Lógica Fuzzy","authors":"Bruna Costa de Souza, Gabriela Sato Santa Brígida, Cláudia do Socorro Carvalho Miranda, Danilo De Souza Novaes, R. C. Figueiredo, Simone Beverly Nascimento da Costa, Silvana Rossy de Brito, Emerson Cordeiro Morais, Leonardo Luis De Oliveira Miranda, Nelson Veiga Gonçalves","doi":"10.59681/2175-4411.v15.i1.2023.986","DOIUrl":"https://doi.org/10.59681/2175-4411.v15.i1.2023.986","url":null,"abstract":"Objetivo: Analisar a ocorrência da leishmaniose cutânea e sua associação com variáveis epidemiológicas, socioeconômicas e de políticas públicas em saúde, utilizando um sistema fuzzy, nas regiões de integração do estado do Pará, no período de 2015 a 2019. Métodos: Neste estudo experimental foram utilizados dados oficiais epidemiológicos, socioeconômicos e de políticas públicas em saúde, cuja associação foi analisada por um sistema fuzzy, utilizando um algoritmo de inferência mamdani, desenvolvido com python 3.7. Para validação dos resultados foi realizada uma análise da associação entre a ocorrência dos casos da doença e o desmatamento. Resultados: A região do Xingu apresentou o maior risco para a doença com grandes diferenças nas pertinências de suas variáveis, bem como o maior percentual de incremento do desmatamento. Conclusão: O sistema foi satisfatório para identificar regiões com maior risco para a doença e necessidade de intensificação de ações de vigilância em saúde.","PeriodicalId":91119,"journal":{"name":"Journal of health informatics","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-19","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"42460922","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Otimizando a detecção de reação adversa a medicamentos com a informatização do Trigger Tool 利用触发器工具的计算机化优化药物不良反应检测
Journal of health informatics Pub Date : 2023-06-19 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.i1.2023.984
Cássio José de Oliveira Rodrigues, H. Costa, Edineide da Costa Pereira Fulco, Rand Randall Martins
{"title":"Otimizando a detecção de reação adversa a medicamentos com a informatização do Trigger Tool","authors":"Cássio José de Oliveira Rodrigues, H. Costa, Edineide da Costa Pereira Fulco, Rand Randall Martins","doi":"10.59681/2175-4411.v15.i1.2023.984","DOIUrl":"https://doi.org/10.59681/2175-4411.v15.i1.2023.984","url":null,"abstract":"Objetivo: Avaliar os impactos que a informatização dos gatilhos utilizados no processo de investigação ativa de reação adversa a medicamentos (RAM) promoveu a um serviço de farmacovigilância. Metodologia: Estudo observacional e retrospectivo com dados de dispensação de medicamentos classificados como “gatilhos” em prontuário eletrônico, cujo sistema informatizado de informação em saúde (SIS) gerou relatórios contendo dados do paciente e do medicamento para ele dispensado, eliminando a etapa manual de investigação. Resultado: Houve um aumento de 48,5% na média mensal de detecção e notificação de RAM na instituição quando comparado aos períodos anteriores a informatização, assim como houve redução do tempo empregado para a execução do processo de trabalho. Conclusão: Os resultados evidenciam a relevância que os SIS podem conferir aos serviços de farmacovigilância, permitindo melhorar a acurácia da metodologia ativa de detecção de RAM, reduzir o tempo para execução do processo de trabalho e otimizar a logística de trabalho.","PeriodicalId":91119,"journal":{"name":"Journal of health informatics","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-19","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"48424376","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Digital inclusion analysis for Brazil’s unified health system 巴西统一卫生系统的数字包容性分析
Journal of health informatics Pub Date : 2023-06-19 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.i1.2023.967
Shirley Karolina Da Silva Ferreira, I. G. Sene Junior
{"title":"Digital inclusion analysis for Brazil’s unified health system","authors":"Shirley Karolina Da Silva Ferreira, I. G. Sene Junior","doi":"10.59681/2175-4411.v15.i1.2023.967","DOIUrl":"https://doi.org/10.59681/2175-4411.v15.i1.2023.967","url":null,"abstract":"Objective: Analyzes the coverage of the digital inclusion programs in health units. Method: The public data of the Cidades Digitais and Wi-fi Brasil programs were analyzed, extracting the number and type of health units supported by the programs, for each Brazilian region and state. Results: The North and Northeast regions have the largest number of health units attended by the programs. The collected data shows that 4.4% of the Wi-fi Brasil’s total access points are in health units and mainly in Indigenous Health Centers (28%), whilst Cidades Digitais corresponds to 4.3%, supporting the Basic Health Units (33%). Conclusion: To recognize the community’s level of access to the internet it is important to propitiate the digital inclusion in health units and then contribute to the National Health Data Network, following the Digital Health Strategy 2020-2028 guidelines.","PeriodicalId":91119,"journal":{"name":"Journal of health informatics","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-19","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"44298560","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Estudo de usabilidade de aplicativo móvel para diagnóstico da endometriose 子宫内膜异位症诊断手机应用可用性研究
Journal of health informatics Pub Date : 2023-06-19 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.i1.2023.977
Ingrid Iana Fernandes Medeiros, Fabiana Gomes Batista, Alef Emannuel Trigueiro Dias, Juliana Dantas Camargo, Itamir de Morais Barroca Filho, Ricardo Ney Oliveira Cobucci
{"title":"Estudo de usabilidade de aplicativo móvel para diagnóstico da endometriose","authors":"Ingrid Iana Fernandes Medeiros, Fabiana Gomes Batista, Alef Emannuel Trigueiro Dias, Juliana Dantas Camargo, Itamir de Morais Barroca Filho, Ricardo Ney Oliveira Cobucci","doi":"10.59681/2175-4411.v15.i1.2023.977","DOIUrl":"https://doi.org/10.59681/2175-4411.v15.i1.2023.977","url":null,"abstract":"Objetivos: Avaliar a usabilidade entre médicos de um aplicativo móvel, Endometriosis Intelligent Application (ENIA), criado para facilitar o diagnóstico da endometriose. Métodos: O estudo envolveu 15 médicos especialistas e 21 residentes em Ginecologia e Obstetrícia de uma maternidade localizada no Estado do Rio Grande do Norte, Brasil, no período de julho a novembro de 2020, contando como instrumento de avaliação o mHealth App Usability Questionnaire (MAUQ). Resultados: Acerca da confiabilidade geral, a escala apresentou boa consistência interna determinada por um alfa de Cronbach de 0,871. Sobre a facilidade de uso e satisfação, organização das informações no sistema e utilidade, os valores de alfa foram 0,80, 0,65 e 0,87, respectivamente.  Verifica-se concordância máxima acima de 70% na maioria das questões da subescala de utilidade. Conclusão: Satisfação e utilidade foram relatadas pela maioria dos médicos que avaliaram o ENIA, indicando que o aplicativo, após validação, poderá ser usado na prática destes profissionais.","PeriodicalId":91119,"journal":{"name":"Journal of health informatics","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-19","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"48093695","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Usability evaluation of a mHealth application for overweight and obesity mHealth应用程序对超重和肥胖的可用性评估
Journal of health informatics Pub Date : 2023-06-19 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.i1.2023.966
Giselle Christina Felix da Silva Palma, Márcia Ito, Jean Jose Silva, Alexandra Monteiro
{"title":"Usability evaluation of a mHealth application for overweight and obesity","authors":"Giselle Christina Felix da Silva Palma, Márcia Ito, Jean Jose Silva, Alexandra Monteiro","doi":"10.59681/2175-4411.v15.i1.2023.966","DOIUrl":"https://doi.org/10.59681/2175-4411.v15.i1.2023.966","url":null,"abstract":"The objective of the article is to evaluate the usability of a mobile application (Healthfy) that makes the prevention and control of overweight and obesity in adults. For the evaluation, a questionnaire adapted from the uMARS method was applied, which was validated by Cronbach's Alpha analysis. Healthfy was used by 26 employees for 21 days of exclusive Home Office. The Pareto method was used for the quantitative statistical analysis, and for the free field responses, the Bardin Content Analysis method. The uMARS validation achieved acceptable reliability (??=0.79). The application met the expectation and encouraged changes in health-related behaviors with a 73.03% agreement. The qualitative analysis of 53 testimonies showed a greater recurrence of records related to behavior to change habits (45%). Thus, it is possible to conclude that the application has characteristics that interfere in the behavior and motivation for healthy habits by workers in an exclusive home office, although there seem to be users limitations in planning and execution of activities.","PeriodicalId":91119,"journal":{"name":"Journal of health informatics","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-19","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"43148512","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Trend of Intentional Self-harm Methods and Recovery Rate Including Non-death in Hospital Discharge Registry Investigation in Korea 2005-2016 2005-2016年韩国出院登记调查中故意自残方法的趋势和包括非死亡在内的康复率
Journal of health informatics Pub Date : 2021-05-31 DOI: 10.21032/JHIS.2021.46.2.181
A-Reum Kim, Sun-Rak Jeong, Eunseok Kim, W. Lee
{"title":"Trend of Intentional Self-harm Methods and Recovery Rate Including Non-death in Hospital Discharge Registry Investigation in Korea 2005-2016","authors":"A-Reum Kim, Sun-Rak Jeong, Eunseok Kim, W. Lee","doi":"10.21032/JHIS.2021.46.2.181","DOIUrl":"https://doi.org/10.21032/JHIS.2021.46.2.181","url":null,"abstract":"Trend of Intentional Self-harm Methods and Recovery Rate Including Non-death in Hospital Discharge Registry Investigation in Korea 2005-2016 Ah-reum Kim, Sun-Rak Jeong, Eun-Seok Kim, Won Kee Lee Graduate Student, Graduate School of Public Health Kyungpook National University, Daegu; Professor, Department of Dental Hygiene, Daegu Health College, Daegu; Professor, Department of Clinical Pathology, Daegu Health College, Daegu; Professor, Department of Biostatistics, School of Medicine, Kyungpook National University, Daegu, Korea","PeriodicalId":91119,"journal":{"name":"Journal of health informatics","volume":"46 1","pages":"181-187"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2021-05-31","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"49066444","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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