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Otimizações em um Workflow Científico de Alto Desempenho 高性能科学工作流中的优化
Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro Pub Date : 2023-06-21 DOI: 10.5753/eradrj.2023.231720
Lucas Cruz, Micaella Coelho, Luiz M. R. Gadelha, C. Osthoff, Kary A. C. S. Ocaña
{"title":"Otimizações em um Workflow Científico de Alto Desempenho","authors":"Lucas Cruz, Micaella Coelho, Luiz M. R. Gadelha, C. Osthoff, Kary A. C. S. Ocaña","doi":"10.5753/eradrj.2023.231720","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/eradrj.2023.231720","url":null,"abstract":"O artigo traz discussões sobre a eleição de modificações no formato de execução do workflow ParslRNA-Seq, que levam a melhora do desempenho e escalabilidade computacional, baseado em redução de gastos com operações de E/S com o uso de SSD em relação ao sistema de arquivos paralelos Lustre no supercomputador Santos Dumont.","PeriodicalId":52776,"journal":{"name":"Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro","volume":"06 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-21","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"85919407","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Avaliação da aplicação RAxML no Ambiente do Supercomputador SDumont RAxML在SDumont超级计算机环境中的应用评估
Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro Pub Date : 2023-06-21 DOI: 10.5753/eradrj.2023.231711
Guilherme Freire, Kary A. C. S. Ocaña, Micaella Coelho, C. Osthoff
{"title":"Avaliação da aplicação RAxML no Ambiente do Supercomputador SDumont","authors":"Guilherme Freire, Kary A. C. S. Ocaña, Micaella Coelho, C. Osthoff","doi":"10.5753/eradrj.2023.231711","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/eradrj.2023.231711","url":null,"abstract":"Este trabalho apresenta um estudo de desempenho desenvolvido para o software RAxML. O estudo avalia o tempo de execução do RAxML segundo os recursos computacionais alocados e os parâmetros de entrada da aplicação no ambiente do Supercomputador Santos Dumont (SDumont).","PeriodicalId":52776,"journal":{"name":"Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro","volume":"7 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-21","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"77709376","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Reduzindo Custos de Implantação e Execução de Clusters Spark em Nuvens Públicas 降低在公共云上部署和执行Spark集群的成本
Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro Pub Date : 2023-06-21 DOI: 10.5753/eradrj.2023.231713
A. L. Nunes, L. Drummond, C. Boeres
{"title":"Reduzindo Custos de Implantação e Execução de Clusters Spark em Nuvens Públicas","authors":"A. L. Nunes, L. Drummond, C. Boeres","doi":"10.5753/eradrj.2023.231713","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/eradrj.2023.231713","url":null,"abstract":"Provedores de nuvens públicas oferecem uma grande variedade de serviços e recursos computacionais. A utilização de serviços mais especializados e automaticamente gerenciados pelos provedores, tal como o modelo de Plataforma como Serviço (PaaS), é uma das causas para o aumento de custos monetários cobrados aos usuários. Neste trabalho apresentamos uma ferramenta de implantação e execução de clusters Spark que utiliza o modelo de Infraestrutura como Serviço (IaaS). Os resultados obtidos a partir de diversos casos de uso apontam que a ferramenta proposta, comparada ao PaaS, é capaz de reduzir razoavelmente os custos de execução de aplicações Spark na nuvem.","PeriodicalId":52776,"journal":{"name":"Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro","volume":"56 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-21","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"84829048","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Navier-Stokes: visualização em tempo real Navier-Stokes:实时可视化
Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro Pub Date : 2023-06-21 DOI: 10.5753/eradrj.2023.231719
Raphael Mesquita, Pedro Von Zuben, Juliana V. Valério, S. Rossetto
{"title":"Navier-Stokes: visualização em tempo real","authors":"Raphael Mesquita, Pedro Von Zuben, Juliana V. Valério, S. Rossetto","doi":"10.5753/eradrj.2023.231719","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/eradrj.2023.231719","url":null,"abstract":"Simulações de fluidos em tempo real requerem cálculos rápidos e precisos do modelo físico descrito pelas equações de Navier-Stokes. Neste trabalho implementamos as equações de Navier-Stokes utilizando técnicas de programação paralela em GPUs, avaliamos o desempenho alcançado e apresentamos uma forma de visualizar estas simulações.","PeriodicalId":52776,"journal":{"name":"Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro","volume":"124 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-21","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"75960599","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Avaliação de desempenho de implementação paralela do método CSEM 3D no supercomputador Santos Dumont 在桑托斯杜蒙超级计算机上并行实现CSEM 3D方法的性能评估
Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro Pub Date : 2023-06-21 DOI: 10.5753/eradrj.2023.231722
Mateus F. Lima de Souza, Rômulo T. Lima, Roberto P. Souto, Antônio Tadeu A. Gomes, Tiziano Labruzzo, Andrea Zerilli
{"title":"Avaliação de desempenho de implementação paralela do método CSEM 3D no supercomputador Santos Dumont","authors":"Mateus F. Lima de Souza, Rômulo T. Lima, Roberto P. Souto, Antônio Tadeu A. Gomes, Tiziano Labruzzo, Andrea Zerilli","doi":"10.5753/eradrj.2023.231722","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/eradrj.2023.231722","url":null,"abstract":"Este trabalho apresenta um resultado de execução paralela no supercomputador Santos Dumont para uma implementação do método CSEM 3D. Conceitos e métodos de implementação de processamento paralelo foram empregados para enfatizar o uso de recursos computacionais em cada nó. Assim, pode-se verificar que existe uma limitação na melhoria de desempenho ao aumentar o número de núcleos computacionais utilizados na arquitetura de CPU multicore disponível.","PeriodicalId":52776,"journal":{"name":"Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro","volume":"70 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-21","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"73362009","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Perfil de desempenho e oportunidades de otimização da implementação do método CSEM 3D CSEM 3D方法实现的性能概况和优化机会
Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro Pub Date : 2023-06-21 DOI: 10.5753/eradrj.2023.231723
Rômulo T. Lima, Mateus F. Lima de Souza, Roberto P. Souto, Antônio Tadeu A. Gomes, Tiziano Labruzzo, Andrea Zerilli
{"title":"Perfil de desempenho e oportunidades de otimização da implementação do método CSEM 3D","authors":"Rômulo T. Lima, Mateus F. Lima de Souza, Roberto P. Souto, Antônio Tadeu A. Gomes, Tiziano Labruzzo, Andrea Zerilli","doi":"10.5753/eradrj.2023.231723","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/eradrj.2023.231723","url":null,"abstract":"Perfis de desempenho paralelos foram obtidos para uma implementação do método CSEM 3D, que é uma técnica geofísica usada para localizar reservas de petróleo no fundo do mar. Uma rotina da biblioteca PETSC domina o tempo total de execução, fazendo com que sua execução paralela eficiente resulte em um bom ganho no tempo geral da aplicação.","PeriodicalId":52776,"journal":{"name":"Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro","volume":"25 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-21","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"87134688","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Detecção de Depressão nas Mídias Sociais usando Transformers com Aprendizado Federado 使用联合学习变形金刚在社交媒体上检测抑郁
Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro Pub Date : 2023-06-21 DOI: 10.5753/eradrj.2023.231537
A. B. Vasconcelos, R. Brum, A. Paes, L. Drummond
{"title":"Detecção de Depressão nas Mídias Sociais usando Transformers com Aprendizado Federado","authors":"A. B. Vasconcelos, R. Brum, A. Paes, L. Drummond","doi":"10.5753/eradrj.2023.231537","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/eradrj.2023.231537","url":null,"abstract":"Diversas iniciativas investigam a detecção automática de depressão através de publicações em redes sociais utilizando de modelos de aprendizado de máquina. A forma mais adequada de obter conjuntos de dados seria pelo consentimento dos usuários em compartilhar seus dados. Porém, compartilhar estas publicações para outros grupos de pesquisa nem sempre é recomendado dada a sensibilidade dos dados. Uma solução para este problema, é se valer de técnicas de Aprendizado Federado para trocar modelos no lugar de dados. Neste trabalho, investigamos como combinar Transformers, a arquitetura estado da arte para word embedding, treinados para abordar a detecção automática de depressão nas mídias sociais.","PeriodicalId":52776,"journal":{"name":"Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro","volume":"15 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-21","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"91198761","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Análise de desempenho de um sistema de modelagem atmosférica em nuvens computacionais 计算云大气模拟系统的性能分析
Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro Pub Date : 2023-06-21 DOI: 10.5753/eradrj.2023.231712
M. S. D. Melo, L. Drummond, Roberto P. Souto
{"title":"Análise de desempenho de um sistema de modelagem atmosférica em nuvens computacionais","authors":"M. S. D. Melo, L. Drummond, Roberto P. Souto","doi":"10.5753/eradrj.2023.231712","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/eradrj.2023.231712","url":null,"abstract":"A utilização de nuvens computacionais em computação de alto desempenho tem levantado questões sobre a vantagem desse tipo de sistema em relação a sistemas tradicionais (on premise). Porém, comparar esses dois sistemas não é trivial, devido a diversos fatores como a quantidade de soluções que os provedores de nuvens oferecem e também do comportamento da aplicação. Este estudo visou analisar o modelo numérico de previsão de tempo e clima BRAMS nos dois sistemas. Observou-se que para um estudo de caso pequeno, a aplicação possui desempenho semelhantemente nos sistemas. Também foi analisado o custo da execução da aplicação em diferentes mercados ofertados pela AWS, que para o problema utilizado, é aconselhado o uso do mercado spot.","PeriodicalId":52776,"journal":{"name":"Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro","volume":"71 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-21","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"91056232","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Estimativa de Tempo de Alinhamentos Biológicos na Nuvem 云中生物排列的时间估计
Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro Pub Date : 2023-06-21 DOI: 10.5753/eradrj.2023.231704
Gabriel C. Mills, S. M. Cavalcante, C. Boeres, V. Rebello
{"title":"Estimativa de Tempo de Alinhamentos Biológicos na Nuvem","authors":"Gabriel C. Mills, S. M. Cavalcante, C. Boeres, V. Rebello","doi":"10.5753/eradrj.2023.231704","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/eradrj.2023.231704","url":null,"abstract":"A eficiência e o baixo custo da Computação em Nuvem dependem do gerenciamento de recursos computacionais. Um aspecto vital dessa tarefa é a estimativa do tempo de execução a fim de definir bons escalonamentos. Este artigo analisa a previsibilidade desse tempo de um serviço em Nuvem para o alinhamento de sequências de DNA projetado com o fim de utilizar recursos eficientemente e viabilizar a análise pelos cientistas dos milhares de alinhamentos que podem compor um único experimento. Entretanto, a qualidade da alocação de recursos é baseada na hipótese de que todos os alinhamentos do experimento demandam o mesmo tempo. Este trabalho visa à análise de fatores e os respectivos graus com que impactam o tempo de execução de cada alinhamento.","PeriodicalId":52776,"journal":{"name":"Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro","volume":"39 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-21","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"82216963","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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EM BUSCA DO ELEMENTO ESSENCIAL NA ESTRUTURA DA NORMA JURÍDICA PARA A CARACTERIZAÇÃO DO SEU CONCEITO 在法律规范结构中寻找对其概念进行表征的基本要素
Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro Pub Date : 2023-01-01 DOI: 10.30749/2177-8337.v27n57p40-70
Alexandre Cesar dos Santos
{"title":"EM BUSCA DO ELEMENTO ESSENCIAL NA ESTRUTURA DA NORMA JURÍDICA PARA A CARACTERIZAÇÃO DO SEU CONCEITO","authors":"Alexandre Cesar dos Santos","doi":"10.30749/2177-8337.v27n57p40-70","DOIUrl":"https://doi.org/10.30749/2177-8337.v27n57p40-70","url":null,"abstract":"","PeriodicalId":52776,"journal":{"name":"Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro","volume":"1 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-01-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"69588621","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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