Estimativa de Tempo de Alinhamentos Biológicos na Nuvem

Gabriel C. Mills, S. M. Cavalcante, C. Boeres, V. Rebello
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Abstract

A eficiência e o baixo custo da Computação em Nuvem dependem do gerenciamento de recursos computacionais. Um aspecto vital dessa tarefa é a estimativa do tempo de execução a fim de definir bons escalonamentos. Este artigo analisa a previsibilidade desse tempo de um serviço em Nuvem para o alinhamento de sequências de DNA projetado com o fim de utilizar recursos eficientemente e viabilizar a análise pelos cientistas dos milhares de alinhamentos que podem compor um único experimento. Entretanto, a qualidade da alocação de recursos é baseada na hipótese de que todos os alinhamentos do experimento demandam o mesmo tempo. Este trabalho visa à análise de fatores e os respectivos graus com que impactam o tempo de execução de cada alinhamento.
云中生物排列的时间估计
云计算的效率和低成本取决于计算资源的管理。这个任务的一个重要方面是估计执行时间,以便定义良好的调度。本文分析了DNA序列比对云服务的可预测性,该服务旨在有效利用资源,并使科学家能够分析数千个可以组成一个实验的比对。然而,资源分配的质量是基于实验的所有对齐需要相同时间的假设。这项工作的目的是分析影响每个对齐运行时间的因素及其程度。
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