AgronomiePub Date : 2003-07-01DOI: 10.1051/AGRO:2003023
O. Schumpp, H. Gherbi, J. Escoute, H. Payre, J. Drevon
{"title":"In situ hybridization of a radioactive RNA probe on resin-embedded legume root-nodule sections: a tool for observing gene expression in the rhizosphere?","authors":"O. Schumpp, H. Gherbi, J. Escoute, H. Payre, J. Drevon","doi":"10.1051/AGRO:2003023","DOIUrl":"https://doi.org/10.1051/AGRO:2003023","url":null,"abstract":"Hybridation in situ d'une sonde ARN radioactive sur des coupes de nodosites de legumineuses incluses dans une resine methacrylique: un outil pour observer l'expression inique dans la rhizosphere? Dans ce travail, nous avons realise une hybridation in situ d'une sonde ARN d'anhydrase carbonique marquee au 35 S, sur des coupes de nodosites prealablement incluses dans une resine methacrylique. Grâce a la faible epaisseur des coupes et la bonne conservation des tissus durant la coupe, la localisation specifique de l'expression du gene d'anhydrase carbonique dans le cortex interne des nodosites a pu etre decrite tres precisement. Il est argumente que cette localisation est en accord avec l'hypothese d'osmoregulation de la fixation symbiotique d'azote.[...]","PeriodicalId":7644,"journal":{"name":"Agronomie","volume":"3 3 1","pages":"489-493"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2003-07-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"81856802","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
AgronomiePub Date : 2003-07-01DOI: 10.1051/AGRO:2003020
V. Casarin, C. Plassard, G. Souche, J. Arvieu
{"title":"Quantification of oxalate ions and protons released by ectomycorrhizal fungi in rhizosphere soil","authors":"V. Casarin, C. Plassard, G. Souche, J. Arvieu","doi":"10.1051/AGRO:2003020","DOIUrl":"https://doi.org/10.1051/AGRO:2003020","url":null,"abstract":"Quantification des ions oxalate et des protons liberes par les champignons ectomycorhiziens dans le sol rhizospherique. Cet article porte sur l'etude des excretions de protons et d'oxalate en nutrition nitrique par deux champignons ectomycorhiziens, Hebeloma cylindrosporum et Rhizopogon roseolus, en culture isolee ou en association avec Pinus pinaster. Un dispositif original de culture sur couche mince de sol a permis d'observer la croissance des racines mycorhizees et de mesurer le pH et l'oxalate a differents niveaux: racines, mycorhizes, hyphes externes et sol rhizospherique. Les resultats montrent des differences de comportement entre especes fongiques en culture pure, differences strictement conservees dans l'association avec la plante. R. roseolus acidifie fortement la rhizosphere et l'excretion de protons s'accompagne d'une excretion d'oxalate, favorisee par la presence de CaCO 3 dans le sol. Une correlation etroite existe entre le pH et la teneur en oxalate du sol rhizospherique, indiquant que les ions oxalate et protons sont excretes simultanement. H. cylindrosporum ne presente pas ces proprietes et a tendance a alcaliniser le sol rhizospherique. Ces actions chimiques exercees par R. roseolus pourraient contribuer a la mobilisation de P du sol.","PeriodicalId":7644,"journal":{"name":"Agronomie","volume":"14 1","pages":"461-469"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2003-07-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"86755590","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
AgronomiePub Date : 2003-07-01DOI: 10.1051/AGRO:2003021
E. Joner, C. Leyval
{"title":"Phytoremediation of organic pollutants using mycorrhizal plants: a new aspect of rhizosphere interactions","authors":"E. Joner, C. Leyval","doi":"10.1051/AGRO:2003021","DOIUrl":"https://doi.org/10.1051/AGRO:2003021","url":null,"abstract":"Phytoremediation as a means of cleaning up polluted soils has gained popularity during the last decade due to its convenience and low costs of installation and maintenance. When the target pollutant is biodegradable, this technology exploits the stimulating effect that roots have on microbial processes and physical/chemical modifications in the rhizosphere. Among the microorganisms that affect rhizosphere processes, symbiotic fungi forming mycorrhizas induce a series of changes in plant physiology, nutrient availability and microbial composition that may determine the outcome of a phytoremediation attempt. Beyond the rhizosphere, mycorrhizal hyphae act as the roots of the roots, and may thus extend the rhizosphere into the bulk soil by creating a new interface of soil-plant interactions; the hyphosphere. We here discuss some of the recent results on phytoremediation of organic pollutants with emphasis on processes in the mycorrhizosphere, and highlight future research priorities.","PeriodicalId":7644,"journal":{"name":"Agronomie","volume":"112 1","pages":"495-502"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2003-07-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"82116844","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
AgronomiePub Date : 2003-07-01DOI: 10.1051/AGRO:2003026
S. Yair, Davidov Yaacov, K. Susan, E. Jurkevitch
{"title":"Small Eats Big: Ecology and Diversity of Bdellovibrio and Like Organisms, and their Dynamics in Predator-Prey Interactions","authors":"S. Yair, Davidov Yaacov, K. Susan, E. Jurkevitch","doi":"10.1051/AGRO:2003026","DOIUrl":"https://doi.org/10.1051/AGRO:2003026","url":null,"abstract":"The ecological role of predation is well established in the animal world. Not so in the bacterial realm where the number of known bacterial predators is small and their phylogenetic affiliations largely unknown. The best-characterized bacterial predators belong to the Bdellovibrio-Bacteriovorax group (Bdellovibrio and like organisms, the BLOs). As predation at this trophic level may be of ecological significance, there is a need to better understand the diversity and the phylogeny of bacterial predators as well as the kinetics of their interactions with their prey. Such studies could also help to develop new approaches for the control of plant and animal Gram negative pathogenic bacteria. Here, we present a short review on the ecology, diversity and the taxonomy of predatory bacteria, with an emphasis on BLOs as well as on the dynamics of the interaction between a selected strain of Bdellovibrio bacteriovorus and its Erwinia carotovora subsp. carotovora prey under high and low predator:prey ratios.","PeriodicalId":7644,"journal":{"name":"Agronomie","volume":"124 1","pages":"433-439"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2003-07-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"87792648","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
AgronomiePub Date : 2003-07-01DOI: 10.1051/AGRO:2003013
Jan, Jansa, Ahmad, Mozafar, Emmanuel, Frossard
{"title":"Long-distance transport of P and Zn through the hyphae of an arbuscular mycorrhizal fungus in symbiosis with maize","authors":"Jan, Jansa, Ahmad, Mozafar, Emmanuel, Frossard","doi":"10.1051/AGRO:2003013","DOIUrl":"https://doi.org/10.1051/AGRO:2003013","url":null,"abstract":"Transport de phosphore et de zinc par les hyphes d'un champignon endomycorrhizien en symbiose avec le mais. Nous avons etudie l'influence d'un champignon mycorrhizien a arbuscule (AMF), Glomus intraradices, sur le prelevement du phosphore (P) et du zinc (Zn) par le mais a l'aide de deux dispositifs experimentaux (les containers cuvette et starpot). Chacun des dispositifs etait divise en trois compartiments: un compartiment colonise a la fois par les racines et la mycorrhize et deux compartiments explores uniquement par les hyphes mycorrhiziens. Les plantes mycorrhizees ont preleve significativement plus de P et de Zn que les plantes non mycorrhizees. La mycorrhize a transporte des quantites significatives de 33 P et de 65 Zn vers la plante lorsque la taille du compartiment intermediaire etait inferieure a 15 cm. Le prelevement de 33 P et de 65 Zn etait significativement correle a la longueur de mycelium exprimee par gramme du substrat et mesuree dans le dispositif en cuvette. Les prelevements de 33 P et de 65 Zn etaient fortement correles entre eux dans les dispositifs cuvette et starpot. Enfin nous montrons que la longueur du mycelium mesure a differents endroits dans le compartiment intermediaire varie avec la taille de ce compartiment et done avec l'accessibilite des elements nutritifs par le champignon.","PeriodicalId":7644,"journal":{"name":"Agronomie","volume":"17 1","pages":"481-488"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2003-07-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"85278949","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
AgronomiePub Date : 2003-07-01DOI: 10.1051/AGRO:2003024
T. Tranbarger, Y. Al-Ghazi, B. Muller, B. T. Serve, Patrick Doumas, B. Touraine
{"title":"A macro-array-based screening approach to identify transcriptional factors involved in the nitrogen-related root plasticity response of Arabidopsis thaliana","authors":"T. Tranbarger, Y. Al-Ghazi, B. Muller, B. T. Serve, Patrick Doumas, B. Touraine","doi":"10.1051/AGRO:2003024","DOIUrl":"https://doi.org/10.1051/AGRO:2003024","url":null,"abstract":"Utilisation de macro-arrays pour identifier des facteurs de transcription impliques dans la reponse de plasticite racinaire a l'azote chez Arabidopsis thaliana. Des plantes d'Arabidopsis thaliana sont cultivees dans des boites de Petri verticales, sur un milieu gelose ou l'azote est apporte sous forme de KNO 3 0,1, 0,5 ou 10 mM, ou de KNO 3 0,5 mM additionne de glutamine ou d'asparagine 5 mM. Le traitement KNO 3 10 mM correspond aux plus faibles nombre et longueur de racines laterales. Leur developpement est inhibe a Un stade posterieur a l'initiation des primordia et anterieur a leur emergence. Des membranes Nylon (macro-arrays) contenant 126 EST de facteurs de transcription potentiels sont construites afin d'identifier des genes regulateurs impliques dans cette reponse d'architecture racinaire. L'analyse des profils d'expression dans les racines et les parties aeriennes de plantes cultivees sur les differentes sources d'azote indiquent que les genes repondant aux traitements sont peu nombreux, et que la plus forte variation est obtenue lorsque l'on compare les traitements KNO 3 10 mM et KNO 3 0,5 mM.","PeriodicalId":7644,"journal":{"name":"Agronomie","volume":"36 1","pages":"519-528"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2003-07-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"90855178","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
AgronomiePub Date : 2003-07-01DOI: 10.1007/978-90-481-2666-8_37
E. Gamalero, G. Lingua, G. Berta, P. Lemanceau
{"title":"Methods for studying root colonization by introduced beneficial bacteria","authors":"E. Gamalero, G. Lingua, G. Berta, P. Lemanceau","doi":"10.1007/978-90-481-2666-8_37","DOIUrl":"https://doi.org/10.1007/978-90-481-2666-8_37","url":null,"abstract":"","PeriodicalId":7644,"journal":{"name":"Agronomie","volume":"30 1","pages":"407-418"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2003-07-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"89778726","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
AgronomiePub Date : 2003-07-01DOI: 10.1051/AGRO:2003022
F. Paynel, J. Cliquet
{"title":"N transfer from white clover to perennial ryegrass, via exudation of nitrogenous compounds","authors":"F. Paynel, J. Cliquet","doi":"10.1051/AGRO:2003022","DOIUrl":"https://doi.org/10.1051/AGRO:2003022","url":null,"abstract":"Transfert d'azote du trefle blanc vers le ray-grass anglais, via l'exsudation de composes azotes. Le 15 N a ete utilise pour quantifier et determiner le sens du transfert de l'azote entre le trefle blanc (Trifolium repens L.) et le ray-grass anglais (Lolium perenne L.). Un systeme de micro-lysimetre a permis de determiner la nature des composes exsudes. Pendant une privation en azote, le transfert est mono-directionnel, du trefle vers le ray-grass, et est du principalement a une exsudation importante d'ammonium par le trefle. L'exsudation de composes azotes par une legumineuse, puis l'absorption par la graminee compagne constitue une voie importante du transfert interspecifique de l'azote entre jeunes plantes. L'ammonium est le compose majoritairement exsude. Des acides amines sont exsudes en quantites moindres, la serine et la glycine etant les plus abondants dans les exsudats. En micro-lysimetre, les quantites d'ammonium, de serine et de glycine dans les exsudats ne sont pas modifiees par la presence de bacteries, ce qui met en evidence l'origine vegetale de ces composes.","PeriodicalId":7644,"journal":{"name":"Agronomie","volume":"11 1","pages":"503-510"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2003-07-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"88602508","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
AgronomiePub Date : 2003-07-01DOI: 10.1051/AGRO:2003018
G. Floch, P. Rey, F. Déniel, N. Benhamou, K. Picard, Y. Tirilly
{"title":"Enhancement of development and induction of resistance in tomato plants by the antagonist, Pythium oligandrum","authors":"G. Floch, P. Rey, F. Déniel, N. Benhamou, K. Picard, Y. Tirilly","doi":"10.1051/AGRO:2003018","DOIUrl":"https://doi.org/10.1051/AGRO:2003018","url":null,"abstract":"Augmentation du developpement et induction de resistance chez des plants de tomate par l'agent antagoniste, Pythium oligandrum. Pour que Pythium oligandrum exerce un controle biologique optimal, il doit coloniser et persister dans la rhizosphere des plantes durant toute la saison culturale. La presente etude montre qu'apres inoculation du systeme racinaire par Pythium oligandrum, celui-ci colonise 20 a 40 % des racines de plants de tomate cultives dans un systeme hydroponique. La presence constante du champignon dans la rhizosphere tout au long de la saison culturale est correlee avec une augmentation de rendement en tomates. La combinaison de plusieurs facteurs explique certainement l'augmentation induite par P. oligandrum. Parmi ceux-ci, on peut citer le mycoparasitisme. Bien que P. oligandrum puisse mycoparasiter d'autres especes de Pythium pathogenes, la colonisation racinaire par l'antagoniste n'est pas associee avec une reduction significative des populations de Pythium spp. Dans le cas present, l'induction de resistance chez la plante semble prevaloir. En effet, la colonisation des racines par P. oligandrum induit une resistance systemique. D'une facon remarquable, les plantes inoculees par P. oligandrum declenchent et amplifient la synthese de proteines PR seulement quand les feuilles sont attaquees par l'agent pathogene, Botrytis cinerea.","PeriodicalId":7644,"journal":{"name":"Agronomie","volume":"47 1","pages":"455-460"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2003-07-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"82586669","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
AgronomiePub Date : 2003-07-01DOI: 10.1051/AGRO:2003017
C. D. Battista-Leboeuf, E. Benizri, G. Corbel, S. Piutti, A. Guckert
{"title":"Distribution of Pseudomonas sp. populations in relation to maize root location and growth stage","authors":"C. D. Battista-Leboeuf, E. Benizri, G. Corbel, S. Piutti, A. Guckert","doi":"10.1051/AGRO:2003017","DOIUrl":"https://doi.org/10.1051/AGRO:2003017","url":null,"abstract":"Distribution des populations de Pseudomonas en relation avec la zone racinaire et le stade de developpement du mais. Nous avons determine le nombre total de bacteries cultivables sur milieu TSA ainsi que la densite des Pseudomonas sur milieu selectif S1, ceci dans differents compartiments racinaires de mais et en sol nu, a deux dates de recolte. Il en ressort que les populations de Pseudomonas ont une densite plus elevee dans la rhizosphere de mais que dans le sol nu. De plus, ces densites augmentent fortement entre 15 et 30 jours, au niveau de la zone d'elongation et des poils absorbants. Les differentes souches isolees nous ont permis de constituer un souchier de 212 souches caracterisees par la technique ARDRA (amplification de la region 16S de l'ADNr et restriction enzymatique par l'enzyme HinfI). Les souches analysees se repartissent en 5 groupes ARDRA. La structure des populations de Pseudomonas sp. a ete modifiee selon les zones racinaires etudiees et au cours du temps.","PeriodicalId":7644,"journal":{"name":"Agronomie","volume":"25 1","pages":"441-446"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2003-07-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"87774300","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}