{"title":"Glubokoe obuchenie v modelirovanii belok-ligandnogo vzaimodejstviya: novye puti v razrabotke lekarstvennyh preparatov","authors":"А. Д. Барыкин, Т. В. Чепурных, З. М. Осипова","doi":"10.24075/vrgmu.2024.002","DOIUrl":"https://doi.org/10.24075/vrgmu.2024.002","url":null,"abstract":"Tekhnologii glubokogo obucheniya stali drajverom revolyucionnyh izmenenij v nauchnyh issledovaniyah raznyh oblastej. Naibolee yarkim primerom ih primeneniya v oblasti strukturnoj biologii i biomediciny yavlyaetsya programmnaya razrabotka nejroset' AlphaFold-2, reshivshaya poluvekovuyu problemu predskazaniya 3D-struktury belkov po pervichnoj aminokislotnoj posledovatel'nosti. Ispol'zovanie metodov glubokogo obucheniya dlya predskazaniya belok-ligandnyh vzaimodejstvij smozhet znachitel'no uprostit' predskazanie, uskorit' razrabotku novyh effektivnyh lekarstvennyh preparatov i pomenyat' koncepciyu drag-dizajna.","PeriodicalId":510206,"journal":{"name":"Вестник Российского государственного медицинского университета","volume":"15 2","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2024-02-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"139876765","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Н. А. Супонева, И. С. Бакулин, А. Г. Пойдашева, Д. О. Синицын, А. Х. Забирова, Д. Ю. Лагода, М. А. Пирадов
{"title":"CHastotno-zavisimyj effekt transkranial'noj stimulyacii teta-vspyshkami prefrontal'noj kory na kognitivnye funkcii","authors":"Н. А. Супонева, И. С. Бакулин, А. Г. Пойдашева, Д. О. Синицын, А. Х. Забирова, Д. Ю. Лагода, М. А. Пирадов","doi":"10.24075/vrgmu.2023.045","DOIUrl":"https://doi.org/10.24075/vrgmu.2023.045","url":null,"abstract":"Stimulyaciya teta-vspyshkami (TBS) nahodit shirokoe primenenie blagodarya indukcii dolgovremennyh effektov pri korotkoj dlitel'nosti protokola. Dlya umen'sheniya variabel'nosti effekta issleduyut podhody k ee personalizacii, naprimer, po chastotam teta-gamma sopryazheniya (TGS). Cel'yu issledovaniya bylo razrabotat' protokol personalizirovannoj po TGS navigacionnoj stimulyacii intermittiruyushchimi teta-vspyshkami (iTBS-ind) i sravnit' ego so standartnym (iTBS-5/50) i imitaciej stimulyacii (iTBS-sham). V issledovanie vklyucheny 16 zdorovyh dobrovol'cev (M — 7; 29,6 let), kotorym v sluchajnom poryadke provodili po odnoj sessii kazhdogo protokola iTBS levoj dorsolateral'noj prefrontal'noj kory. Effekt ocenivali s pomoshch'yu testov n-back c odnovremennym pred\"yavleniem verbal'nyh i prostranstvennyh stimulov (n = 2,3), Digit span, Corsi blocks, Tower of London; testirovanie provodili do, srazu i cherez 60 min posle stimulyacii. Ser'eznyh nezhelatel'nyh yavlenij ne zaregistrirovali. Statisticheski znachimyj effekt poluchen pri ocenke cherez 60 min dlya iTBS-5/50 na test n-back s prostranstvennymi stimulami (n = 3) (pcorr = 0,018), dlya vsekh protokolov — na test Tower of London (pcorr = 0,039 dlya iTBS-5/50, pcorr = 0,045 dlya iTBS-ind i pcorr = 0,003 dlya iTBS-sham). Effekt iTBS-5/50 byl statisticheski znachimo vyshe po sravneniyu s iTBS-sham v otnoshenii prostranstvennogo testa n-back (n = 3) (pcorr = 0,039), no nizhe po sravneniyu s iTBS-ind i iTBSsham v otnoshenii testa Corsi blocks (pcorr = 0,038 i 0,048 sootvetstvenno). Takim obrazom, ne udalos' podtverdit' effektivnost' i preimushchestva personalizirovannogo protokola po sravneniyu so standartnym i imitaciej stimulyacii. V svyazi s poluchennym effektom standartnogo protokola mozhet byt' perspektivnym dal'nejshee ego izuchenie.","PeriodicalId":510206,"journal":{"name":"Вестник Российского государственного медицинского университета","volume":"27 46","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-12-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"139193908","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Т. А. Кульшань, И. О. Бугаева, Е. Ф. Соболева, М. С. Аллянова, Д. А. Попов, И. Г. Швиденко
{"title":"Sravnitel'nyj bioinformaticheskij analiz sostava genov antimikrobnoj ustojchivosti v genomah predstavitelej roda Corynebacterium","authors":"Т. А. Кульшань, И. О. Бугаева, Е. Ф. Соболева, М. С. Аллянова, Д. А. Попов, И. Г. Швиденко","doi":"10.24075/vrgmu.2023.047","DOIUrl":"https://doi.org/10.24075/vrgmu.2023.047","url":null,"abstract":"V nastoyashchee vremya mnozhestvennaya antimikrobnaya rezistentnost' bakterial'nyh infekcionnyh agentov predstavlyaet ser'eznuyu ugrozu dlya mirovogo zdravoohraneniya. Osoboe znachenie v razvitii infekcij, v tom chisle gospital'nyh, igrayut sleduyushchie vidy korinebakterij: C. amycolatum, C. urealyticum, C. striatum, C. jeikeium, C. aurimucosum, C. genitalium, kotorye ustojchivy k bol'shomu arsenalu antimikrobnyh preparatov. Cel'yu issledovaniya bylo provedenie bioinformaticheskogo analiza spektra genov ustojchivosti k antimikrobnym preparatam v opublikovannyh genomah nekotoryh predstavitelej roda Corynebacterium. Issledovany dannye o nukleotidnyh posledovatel'nostyah polnyh genomov 22 shtammov korinebakterij, predstavlennyh v svobodnom dostupe v NCBI GenBank. Bioinformaticheskij analiz polnogenomnyh posledovatel'nostej s cel'yu poiska genov antimikrobnoj ustojchivosti v ukazannyh genomah osushchestvlyali s pomoshch'yu onlajn-resursa PATRIC. Ustanovleno, chto predstavlennye genomy v razlichnyh kombinaciyah soderzhali 25 genov ustojchivosti k antimikrobnym preparatam. U nekotoryh shtammov korinebakterij vyyavleny aminokislotnye zameny v GyrA (pozicii 87, 88 i 91), s kotorymi mozhet byt' svyazana realizaciya ustojchivosti k hinolonam/ftorhinolonam.","PeriodicalId":510206,"journal":{"name":"Вестник Российского государственного медицинского университета","volume":"19 7","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-12-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"139189649","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Г. В. Порядин, Д. А. Еремин, Н. М. Хелминская, В. И. Кравец, И. В. Житарева, А. В. Посадская, Н. М. Краснов, П. А. Шень, М. А. Гурешидзе
{"title":"Effektivnost' ustraneniya kostnyh defektov chelyustej","authors":"Г. В. Порядин, Д. А. Еремин, Н. М. Хелминская, В. И. Кравец, И. В. Житарева, А. В. Посадская, Н. М. Краснов, П. А. Шень, М. А. Гурешидзе","doi":"10.24075/vrgmu.2023.044","DOIUrl":"https://doi.org/10.24075/vrgmu.2023.044","url":null,"abstract":"Metody regenerativnoj mediciny v Rossii i za rubezhom aktivno razvivayutsya v svyazi s aktual'nost'yu etogo napravleniya, osobenno v voprosah kostnoj plastiki chelyustej. Dlya normalizacii i stimulyacii osteogeneza tradicionno primenyayut auto-, allo- i ksenoplastichenskie materialy, a takzhe sinteticheskie preparaty na osnove kal'cij-fosfatnoj keramiki, no rezul'taty lecheniya ne vsegda odnoznachny. Cel'yu issledovaniya bylo obosnovat' primenenie biokompleksa plazmy krovi, bogatoj faktorami rosta PRGF, i ksenoplasticheskogo materiala dlya povysheniya effektivnosti osteogeneza kostnyh defektov chelyustej. V issledovanii uchastvovalo 136 pacientov (105 zhenshchin i 31 muzhchina, v vozraste 21–67 let), v zavisimosti ot metoda zameshcheniya kostnogo defekta razdelennyh na chetyre gruppy. V 1-j gruppe osteoplasticheskie materialy ne primenyali, vo 2-j plastiku provodili fibrinovym gelem PRGF, v 3-j — materialom Osteobiol Gen-Os, v 4-j — materialom Osteobiol Gen-Os sovmestno s preparatom plazmy, bogatoj faktorami rosta PRGF. Dlya dinamicheskoj ocenki processa osteogeneza provodili komp'yuternuyu tomografiyu s cifrovoj densitometriej do operacii i cherez 3, 6, 12 mesyacev posle nee. CHerez god vosstanovlenie utrachennogo ob\"ema kostnoj tkani v 4-j gruppe zafiksirovano u 100% pacientov, v 3-j — u 70,27%, vo 2-j — u 43,47%, a v 1-j u — 37,5%, tochnyj kriterij Fishera vyyavil statisticheski znachimye razlichiya rezul'tatov kostnoj plastiki v 3-j i 4-j gruppah (p = 0,00002). Statisticheski znachimo razlichayutsya pokazateli plotnosti kostnoj tkani u pacientov 1-j i 2-j grupp cherez 12 mesyacev posle operacii (p = 0,044), u 3-j i 4-j grupp — cherez 3 (p = 0,004), 6 (p = 0,0001) i 12 (p = 0,0001). Poluchennye rezul'taty govoryat ob effektivnosti primeneniya predlozhennoj nami metodiki.","PeriodicalId":510206,"journal":{"name":"Вестник Российского государственного медицинского университета","volume":"86 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-11-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"139298685","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}