Mol Cell | 活细胞“偷听”RNA：北京大学汪阳明团队开发新的方法，在不杀死细胞的情况下实时追踪转录组变化

背景：传统RNA测序方法依赖细胞裂解或固定，无法对同一活细胞群体进行纵向动态监测，限制了转录组及RNA结合蛋白（RBP）相互作用的研究。研究目的：北京大学汪阳明团队在Molecular Cell上发表研究，开发一种名为POND-seq（蛋白质纳米笼赋能非破坏性测序）的新方法，旨在通过工程化蛋白质纳米笼从活细胞中非破坏性地回收RBP结合的RNA，实现转录组和RBP-RNA相互作用的实时纵向追踪。结论：POND-seq通过将RBP与EPN24纳米笼融合，促进RNA包装和分泌，能稳健鉴定多种细胞质RBP的RNA靶标，并实现应激条件下动态变化的纵向监测；结合PABPC1可监测全转录组反应，无需细胞解离即可从混合细胞中绘制细胞类型特异性图谱；通过对77种FMR1变体的可扩展分析，揭示了疾病相关突变效应。该平台为活细胞中细胞质转录组和RBP相关RNA的非破坏性、高通量分析提供了多功能工具。