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BioMed科技
2026-05-27 21:43
文章摘要
背景:RNA通过与RNA结合蛋白(RBP)及其他RNA分子形成复杂的相互作用网络,在基因表达调控中发挥核心作用。然而,由于实验噪声高、数据异质性强及技术平台差异大,系统解析这些动态相互作用面临挑战。研究目的:针对RNA互作识别中的高背景噪音和数据整合不足问题,中山大学与City Of Hope研究团队联合开发了新的计算机算法及整合平台。结论:该研究开发了rbsSeeker和rriScan算法,基于统一的统计框架高精度识别RBP结合位点与RNA-RNA互作。通过分析超过2675套数据集,构建了ENCORI平台,整合了多种数据并提供可视化功能。实验验证了如CPSF6作为新m6A相关蛋白及孤儿snoRNA SNORA49的功能等生物学发现。该平台为RNA调控网络研究提供了新资源。
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