Nature子刊:腾讯AI实验室实现蛋白设计与湿实验验证闭环
iNatrue
2026-05-26 08:56
文章摘要
背景:AI蛋白设计领域存在计算设计与湿实验验证脱节的问题,模型设计的高评分序列在实验室中往往表达困难、活性低、稳定性差。研究目的:腾讯AI Lab团队提出了本体论强化迭代(ORI)的蛋白设计框架,旨在通过结构化本体提示模型生成可控、可解释的蛋白序列,并利用湿实验反馈强化学习(RLWF)构建“生成-验证-更新”的闭环系统,以弥合计算与实验之间的鸿沟。结论:通过溶菌酶、几丁质酶和双功能酶的验证,ORI初始模型设计的蛋白表达量和活性与天然蛋白相近。经RLWF优化后,溶菌酶表达量提升近一倍,酶活性提升100倍;几丁质酶获得多个在70℃以上仍保持活性的突变体。双功能酶设计成功生成65条可表达序列,其中TX-ME活性优于天然双功能酶。研究还发现无细胞表达系统具有高表达重复性和标准化评估优势,适合作为ORI闭环实验的平台。该研究成功实现了蛋白计算设计与湿实验验证的闭环整合。
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