浙江大学,最新Nature Machine Intelligence:用于蛋白-肽对接的高效精确扩散生成模型!
BioMed科技
2025-08-06 13:30
文章摘要
背景:在新一代药物开发中,肽类分子因其高特异性和低毒性成为重要治疗载体,但蛋白-肽相互作用(PPI)的结构解析和计算预测面临巨大挑战。传统方法在处理肽段的柔性结构和巨大构象空间时表现不佳,而AlphaFold2-Multimer依赖多序列比对且计算耗时。研究目的:浙江大学团队提出了一种全新的扩散生成模型RAPiDock,旨在高效、准确地建模蛋白与肽之间的结构结合。结论:RAPiDock在多项指标上优于对比方法,尤其在top-25预测准确率上达到93.7%,且比AlphaFold2-Multimer快约270倍,能够处理翻译后修饰、低序列相似性数据等挑战性任务,未来可广泛应用于结构生物学研究和肽类药物设计。
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