西湖大学，最新Nature Methods，单细胞分辨率原位谱系追踪！

本文介绍了西湖大学李莉和王寿文团队在《Nature Methods》上发表的研究，开发了Spatio-DARLIN技术。背景方面，现有谱系示踪技术无法同时获取原位空间信息和高通量克隆解析，存在捕获效率低和条形码干扰等问题。研究目的是整合DARLIN小鼠模型与高通量空间转录组平台，解决这些缺陷。结论表明，该技术能在完整组织中以单细胞分辨率同步捕获转录组与谱系条形码，具有低条形码同源性和高可重复性。研究揭示了小肠中干细胞克隆的时空动态（如中性漂移和单克隆隐窝形成）以及大脑皮层和海马的克隆空间排布特征，还发现下丘脑神经元祖细胞在胚胎E10早期就存在空间命运预模式。该技术通用性强，适用于多器官和多平台，填补了原位空间谱系工具的空白，但存在条形码检出效率差异和二维切片采样偏差等局限。