The Innovation | GSAman：让基因结构注释校准更便捷，助力打造高质量参考基因组

本文针对许多物种参考基因组中基因结构注释质量参差不齐、制约基因功能解析和分子育种的问题，介绍了研发的开箱即用基因结构注释人工校准软件GSAman。研究背景是当前自动注释算法虽能实现高完整度注释，但在满足功能基因研究所需的单碱基级高精度方面仍有不足。研究目的是开发一款易于部署和使用的本地化校准工具，帮助科研人员尤其是实验生物学家参与注释优化，从而构建高质量基因结构注释数据集。结论表明，GSAman基于IGV开源代码开发，支持通过鼠标拖拽、编辑撤回等交互方式进行转录本、外显子等结构的增删改查，并整合了与TBtools-II配套插件。以籼稻MH63的全基因组注释校准为验证，校正后BUSCO完整性评估值从86.93%提升至99.63%，每条染色体上超过20%的基因结构得到优化。未来结合大语言模型等智能辅助技术，有望进一步提高校准效率，并为训练更高精度的基因注释模型奠定数据基础。