Cancer Cell | 复旦大学虞先濬/施思合作绘制胰腺癌细胞类型分辨的预后图谱

传统整体水平转录组测序无法将细胞类型特异性基因表达与患者生存相关联。该研究整合152例胰腺癌患者的单核RNA测序与长期生存数据，构建了细胞类型分辨的预后图谱，鉴定出7,248个预后相关基因，其中619个在不同细胞类型中呈现双向效应。开发了ctPANDA交互平台供研究者探索。研究发现PLOD2在8种细胞类型中均与不良预后相关，并开发了PROTAC降解剂PROTAC-G3，在多种模型中有效抑制肿瘤进展。研究将预后分析从整体水平推进到细胞类型分辨率，建立了将基因表达与临床结局联系起来的框架，为精准靶向治疗提供了新策略。