Adv Sci：吴俊教授团队绘制首个梨三维基因组图谱揭示亚洲与西洋梨叶片大小的遗传差异

该研究由南京农业大学吴俊教授团队完成，发表于Advanced Science。梨是重要果树，以往基因组研究多关注线性序列差异，而该研究首次绘制了梨的高分辨率三维基因组图谱，分析了亚洲梨（‘砀山酥梨’、杜梨）与西洋梨（‘早红考密斯’）在染色质空间构象上的分化。研究目的旨在探究染色质三维结构如何影响梨叶片形态和大小的遗传差异。通过整合Hi-C、ATAC-seq、长读长重测序及群体遗传数据，发现约22%的基因组区域存在A/B区室差异，约27%出现TAD结构分化。结构变异与TAD边界偏移密切相关，且边界附近基因表达显著差异，尤其在栽培与野生梨间。进一步鉴定到234个选择驯化相关基因和3,605个分化基因，其中转录因子PyYABBY位于差异TAD边界，过表达实验证实其可促进叶片发育，揭示了亚洲与西洋梨叶片大小差异的遗传基础。结论表明，该研究将梨基因组学从线性序列解析拓展至空间构象调控，为理解梨农艺性状形成机制和分子育种提供了新理论框架。