Nature Methods | 昌平实验室高毅勤等团队整合多种实验信息利用GRASP辅助蛋白质复合物结构预测

背景：蛋白质-蛋白质相互作用在生物过程中至关重要，但现有计算方法如AlphaFold3等在预测精度上仍存在局限，而各种实验方法提供的零散信息需要有效整合工具。研究目的：昌平实验室团队开发了GRASP模型，旨在高效整合交联质谱、共价标记、化学位移扰动等多种实验数据，提升蛋白质复合物结构预测的准确性和灵活性。结论：GRASP在模拟和真实实验约束下均优于现有工具，尤其在抗原抗体复合物预测中表现突出，甚至超越AlphaFold3，并展示了在近细胞条件下建模蛋白质相互作用组的潜力，为复杂生物系统研究提供了可靠工具。