香港大学张彤、香港教育大学李丽观Adv. Sci.：高分辨率生活污水宏基因组解析香港人群抗生素抗性组的分布格局与传播特征

本研究针对全球抗微生物药物耐药性（AMR）日益严峻的挑战，旨在通过高分辨率污水监测评估人群抗生素抗性组（耐药组）的动态变化。研究结合短读长与长读长宏基因组测序，对香港95个社区点位、覆盖约480万居民，在夏冬两季采集190份样本，获得2.2 Tb短读长和2.8 Tb长读长数据。结果发现，社区污水耐药组呈现季节性模式，且其组成比污水处理厂进水更接近人类粪便耐药组，更适合作为流行病学监测点。长读长测序显著提升了对抗生素抗性基因（ARG）宿主及可移动遗传元件的解析能力，识别出大肠杆菌为关键ARG储库。研究进一步基于序列系统发育和遗传背景，将ARG传播划分为四类模式，包括宿主范围广但序列高度异质的模式、近期频繁水平基因转移的模式、质粒介导的跨区域重组传播模式及低移动性的垂直传播模式。结论认为，社区上游采样可提高监测空间分辨率，该工作为建立城市尺度、高分辨率的污水耐药性监测体系提供了基线框架，支持未来公共卫生预警和针对性AMR干预。