Nat Commun丨李保国/郝兵兵/Ido Amit/秦国臣合作开发EasySCP单细胞蛋白质组学技术，实现肝脏蛋白空间分布规律的高精度解析

单细胞转录组测序技术揭示了细胞异质性，但细胞功能最终由蛋白质执行。现有单细胞蛋白质组学技术存在流程复杂、通量低等问题。本研究旨在开发一种易操作、高通量的单细胞蛋白质组学技术平台，并验证其在复杂生物学问题中的应用。研究团队开发了EasySCP技术，采用预装裂解酶缓冲液的384孔板和流式分选，约2小时完成样本处理，在HEK293细胞中鉴定约5000种蛋白质。利用该技术对650颗小鼠肝细胞进行单细胞蛋白质组学分析，每个细胞平均检测约3500种蛋白质，共鉴定5267种，其中3277种具显著空间分布特性，覆盖脂肪酸代谢、药物解毒等核心通路。团队整合多组学数据构建了肝脏空间状态预测体系HSS，评分与物理空间距离相关系数达0.824。结论：EasySCP降低了单细胞蛋白质组学操作门槛，在单细胞分辨率下系统解析了肝脏蛋白空间分布规律，为从细胞身份鉴定迈向功能解析提供了重要技术支撑。