ACS Chem. Biol. | 纳米孔测序揭示应激状态下人细胞rRNA 修饰的变化

本文旨在利用纳米孔直接RNA测序技术，分析人细胞在氧化应激、炎症应激和铁死亡过程中rRNA修饰的动态变化。研究背景在于牛津纳米孔技术（ONT）平台的直接RNA测序技术快速发展，但该算法在人类rRNA中的应用性能尚未报道。研究目的是评估Dorado v5.2.0修饰感知模型监测人类rRNA修饰变化的重复性与灵敏度，并探究不同应激条件下rRNA修饰的时序性变化。研究结论表明，纳米孔直接RNA测序能够可重复、半定量地分析rRNA修饰图谱。研究发现，不同应激诱导特异性的rRNA修饰重塑，其中28S Ψ4296和28S Ψ4353在所有应激条件下均持续下降，被定义为“通用应激标志物”。此外，还鉴定出氧化应激特异性标志物（如18S Ψ573、18S m⁶A1832）与炎症应激特异性标志物（如18S Gm1328）。研究证实，rRNA修饰动态变化可能通过调控核糖体功能和蛋白质翻译帮助细胞适应应激，为评估细胞健康状态提供了新的分子标志物，并为探索rRNA修饰与应激适应性翻译的关联奠定了研究框架。