Cell丨10万年古基因组揭秘洞穴狮与现代狮的“远古情缘”

本文通过分析跨越10万年、涵盖欧亚至北美的12个洞穴狮全基因组数据，揭示了已灭绝的洞穴狮与现代狮的演化关系。背景方面，受限于古DNA技术，此前对洞穴狮与现代狮的遗传差异、适应性进化及可能的基因交流认识不足。研究目的方面，团队对10个全新样本进行测序，结合已发表数据构建了系统发育框架，旨在澄清两者的谱系关系、分化时间及基因流动。结论方面，研究取得三大发现：1）核基因组确证两者为独立谱系；2）冰期气候驱动了洞穴狮内部的谱系融合，但北美个体保留有古老成分；3）现代狮与洞穴狮的分化时间推前至约171万年前，传统估计因历史基因流而偏低。此外，研究检测到末次盛冰期中东亚洞穴狮基因组中混有3.2-4.4%现代狮祖先成分，证明两者曾发生杂交，且该基因流与冰期扩张密切相关。研究解析了洞穴狮适应寒冷的33个高影响蛋白突变，为大型猫科动物保护提供了古遗传学参考。