PNAS | 破解基因组“暗物质”起源：浙江大学蒋超/何向伟发现生命共享一种“通用笔误”机制，造就变异并关联疾病

串联重复序列是基因组中高度可变的元件，但其进化起源机制尚不清楚。本研究由浙江大学的蒋超和何向伟团队完成，旨在探究微同源介导的串联重复（MTD）在生命各界的普遍性及进化意义。通过全基因组深度测序和统一的分析框架，研究证明了MTD在细菌、古菌、真菌和病毒中从头产生。对2,245个参考基因组和百万级微生物基因组数据的分析表明，MTD是串联重复的主要来源。大多数MTD在中性或近中性动力学下进化，纯化选择优先从编码区清除MTD。机制研究发现保守瓣状核酸内切酶Rad27的缺失增加了MTD的形成，揭示了岡崎片段成熟过程的作用。在人类中，微同源特征在多态性和疾病相关的串联重复中普遍存在，尤其在癌症相关的致病性变异中富集。这些发现确立了MTD作为一种保守的基因组变异机制，对理解人类疾病具有重要启示。