Genome Biol丨STHD:解析亚细胞精度高维空间转录组的机器学习算法

BioArtMED 2025-09-26 14:30
文章摘要
背景:近年来空间转录组技术快速发展,能够以亚细胞精度测量组织切片中基因的空间表达,但高稀疏性、高维度和高通量的数据特性给分析带来挑战。研究目的:杜克大学张翼实验室开发STHD算法,旨在直接在高分辨率原始数据上进行细胞类型概率预测,避免传统方法的分辨率损失。结论:STHD在模拟和真实数据中表现优异,能精准识别细胞类型边界和微环境结构,为肿瘤免疫研究提供新工具。
Genome Biol丨STHD:解析亚细胞精度高维空间转录组的机器学习算法
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Cell Decoder: decoding cell identity with multi-scale explainable deep learning.
DOI: 10.1186/s13059-025-03832-y Pub Date : 2025-10-20
IF 10.1 1区 生物学 Q1 Genome Biology
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