Cell Genomics丨陈迪俊团队和邓润智团队开发一种基于可解释基因程序的单细胞与空间组学数据整合与注释通用分析框架

本文介绍了一项由南京大学陈迪俊团队和邓润智团队在《Cell Genomics》上发表的研究。研究背景在于当前生物医学研究中单细胞多组学数据（高精度但失去空间位置）与空间组学数据（保留位置但分辨率不足）之间存在难以整合的“数据鸿沟”，传统整合方法如同“黑盒”，难以解释生物学逻辑。研究目的是开发一种名为SSpMosaic的新型通用分析框架，该框架基于可解释的“基因程序”（即协同作用的基因模块），旨在稳健地整合与注释单细胞和空间组学数据。研究结论表明，SSpMosaic在跨物种、跨模态数据整合中性能优越，具备良好的可解释性、稳健性和扩展性，能够解析复杂的组织微环境，为相关研究提供了统一且强大的计算工具。