Genome Biol | 袁国丞团队开发基于图神经网络的空间轨迹分析新算法ONTraC

近年来，空间转录组技术的快速发展为研究复杂生物学过程提供了全新视角。然而，现有分析方法难以捕捉基因表达等特征在空间纬度上的连续变化。袁国丞教授团队开发了基于图神经网络的算法框架ONTraC，首创微环境轨迹分析范式，以组织微环境为基本单元，整合空间拓扑与细胞类型成分，系统性构建反映微环境连续变化的轨迹模型。该方法突破了单细胞或离散域分析的局限性，为解析组织空间功能架构提供了全新工具。研究团队通过模拟与真实数据的双重验证系统评估了算法性能，结果显示ONTraC在轨迹重建能力上显著优于现有方法。