Nat Commun | 中山大学温增麒课题组与合作者揭示核小体状态“编码”DNA复制时序和3D基因组信息

本研究由中山大学温增麒课题组与深圳湾实验室龙海珍课题组合作，发表在Nature Communications上，探讨了核小体状态如何编码DNA复制时序和三维基因组信息。研究利用wrapping-seq技术分析了小鼠胚胎干细胞全基因组核小体上DNA的缠绕状态，并鉴定出核小体缠绕结构域（NRDs），揭示了核小体状态与DNA复制时序和三维基因组结构之间的关系。研究发现，核小体的动态变化与细胞生命活动密切相关，特别是在DNA复制和基因转录过程中。此外，研究还发现核小体缠绕指数（NRI）与基因表达和常染色质标记正相关，而与异染色质标记相关性较差。这些发现为理解基因组结构与功能的协同调控提供了新的视角。