Adv Biotechnol | 宋玉龙团队揭示LRS RNA-seq技术在量化A-to-I RNA编辑水平方面具有更高的准确性

本文介绍了宋玉龙教授团队在Advanced Biotechnology上发表的研究，比较了二代测序（NGS）与三代测序（LRS）在量化A-to-I RNA编辑水平上的准确性。背景上，A-to-I RNA编辑是哺乳动物中最广泛的RNA编辑方式，由ADAR蛋白催化腺苷脱氨基转化为肌苷，对RNA代谢、神经系统功能及疾病发生（如肌萎缩侧硬化、癌症等）至关重要。研究目的为评估NGS与LRS两种技术对A-to-I编辑水平定量的差异及其原因。结论表明，与LRS相比，NGS严重低估了A-to-I RNA编辑水平，且在多种人类癌细胞系中普遍存在。主要原因在于测序读长差异：较短的NGS读长易导致错误比对，如将唯一比对误判为多重比对，从而低估编辑水平。LRS RNA-seq凭借更长读长，能更精确地捕获编辑变化，为相关研究提供可靠数据支持。该发现强调了LRS在提高量化精度中的重要性，并为理解RNA编辑机制及其生物学意义奠定了基础。