PNAS丨王亮团队开发幽门螺杆菌致病风险智能评估模型

本文由华南理工大学/南方医科大学附属广东省人民医院王亮教授团队联合国内外多家单位发表在PNAS上。研究背景：胃癌是全球主要癌症死因，幽门螺杆菌感染是主要致病因素，但多数感染者不发展成胃癌，传统毒力基因只能解释部分风险差异。研究目的：构建基于全基因组智能分析的幽门螺杆菌风险评分模型（HpRS），对肠型胃癌发生多阶段Correa级联中菌株的致病风险进行精准分层。结论：模型对528株覆盖Correa级联四个阶段的幽门螺杆菌全基因组进行分析，通过细菌全基因组关联分析和机器学习开发，在重复交叉验证中AUC达0.902，在内部及外部验证中表现良好，核心预测SNP广泛分布于DNA修复、翻译等核心细胞功能基因，打破了传统毒力基因分型对地理背景的依赖，有望将幽门螺杆菌感染管理转变为基于菌株致癌潜力的精准医学模式。