Scientific Data | 浙江大学生命科学学院程磊-肖璟团队发文构建全球湿地微生物宏基因组数据库

湿地作为水陆交互形成的独特生态界面，在全球生物地球化学循环与气候调节中发挥重要作用，但现有湿地微生物数据集高度碎片化，缺乏统一分析流程和高分辨率环境元数据关联，限制了样点间的可比性和一般性研究。为弥补这一空白，浙江大学生命科学学院程磊-肖璟团队基于课题组积累的全国湿地微生物群落数据，整合多源信息，在统一标准化流程下进行数据质控、组装、注释及代谢潜能解析，构建了全球湿地宏基因组数据库GWM。该数据库整合了全球957个采样点的1962个样本微生物数据，包括课题组实地采集的129个样本和来自公共数据库的1833个样本，详细记录了环境背景、采样流程和分类学图谱，并收录了251个样本的5704个宏基因组组装基因组的序列、物种与基因注释，解析了其549个KEGG modules的代谢潜力。GWM还构建了在线平台，支持多维筛选、可视化及数据下载。研究的结论是，GWM数据库通过标准化流程和丰富的信息整合，为湿地微生物群落与环境约束的关联研究提供了重要资源。