Nat Biotech | 樊荣、陈斯迪团队开发Perturb-DBiT：首次实现空间CRISPR筛选下的全景式RNA解析

本文背景: 传统功能基因组学研究主要关注mRNA表达变化，但大量关键调控发生在非编码RNA和转录后调控层面。研究目的: 耶鲁大学樊荣与陈斯迪团队开发Perturb-DBiT技术，旨在首次在完整组织环境中同时解析CRISPR遗传扰动及其对应的全景式总RNA响应，实现遗传扰动与分子表型的直接关联。结论: 该技术通过高通量测序直接识别sgRNA，兼容大规模CRISPR文库，能同步捕获mRNA、microRNA、lncRNA、tRNA、snoRNA等多种RNA分子，在肺癌转移定植模型中发现了非编码RNA调控变化、microRNA-mRNA互作网络重塑及氨基酸特异性tRNA表达重编程等现象，揭示了传统单细胞CRISPR筛选难以发现的空间表型，如肿瘤定植、克隆间协同作用等，建立了空间功能基因组学新框架，为癌症、免疫学等研究提供了新平台。