Nat Commun | 转座子R-loop作为增强子样元件激活转录

该研究基于卵母细胞天然无DNA复制的独特体系，通过建立高特异性R-loop图谱技术RTACC-seq，系统分析了R-loop在转录开启、活跃和沉默三个阶段的全基因组分布。研究发现，R-loop并非简单的转录副产物，转座元件特别是LTR区域的R-loop具有增强子样功能，能促进邻近基因表达。通过卵母细胞特异性敲除RNase H1，发现R-loop清除受阻会导致染色质可及性升高、异染色质标志下降、活性增强子标志升高，并伴随DNA损伤加剧，最终引发卵巢早衰。结论表明，RNase H1介导的R-loop稳态调控是关闭转座子邻近基因转录活性、建立卵母细胞转录沉默的关键机制，为早发性卵巢功能不全提供了新的表观遗传致病方向。