New Phytol | 四倍体小麦模式品种 Kronos 的高质量基因组蓝图及综合功能基因组学资源

本文为四倍体小麦模式品种Kronos构建了高质量染色体级别参考基因组（10.35 Gb），并整合了综合功能基因组学资源。研究背景是小麦作为全球重要粮食作物，其育种和基础研究亟需高质量基因组资源，而此前Kronos缺乏参考基因组限制了大量突变体库和转录组数据的利用。研究目的是利用PacBio HiFi和Hi-C技术组装Kronos基因组，并结合手动注释抗病基因（NLRs）、小RNA（sRNAs）位点及重分析EMS突变数据，提供一套完整的基因组资源。结论表明，新基因组大幅提升了突变检测分辨率，特别是启动子区域检测数量增加2.4倍；鉴定了1089个可靠NLR基因，揭示了Kronos特有的NLR多样性和结构变异；注释了157个miRNA基因座和10,965个phasiRNA产生位点，建立了sRNA参考框架。这些资源将加速小麦功能基因组学研究，为抗病育种和精准遗传分析提供坚实基础。