Nature | 颠覆认知！转录因子“编织”结合 DNA 的新模型：重叠低亲和力位点决定基因组占据

背景：转录因子通过与DNA序列特异性结合调控基因表达，传统高通量技术难以可靠检测低亲和力结合位点，而这些位点对精确的基因调控至关重要。研究目的：为克服技术局限，研究团队开发了PADIT-seq技术，系统检测六种转录因子对所有可能十碱基对DNA序列的结合偏好，探究低亲和力结合位点在转录因子基因组占据中的作用。结论：研究发现高亲和力结合位点周围的核苷酸形成重叠的低亲和力位点，共同决定转录因子的细胞内基因组占据；提出“重叠结合模型”，即转录因子结合由多个重叠位点的总和决定，该模型解释了同源转录因子竞争机制，并阐明非编码变异通过同时改变多个重叠位点累加影响基因表达与疾病表型。