Cell Host & Microbe | 全球小鼠微生物组分类-代谢的关联研究

本研究通过构建一个涵盖全球51个实验室饲养设施和12个野生小鼠种群的微生物组资源库，系统调查了小鼠肠道微生物群落中分类学组成与代谢功能之间的关联。背景：宿主与微生物群的互惠共生关系依赖于代谢物交换，但实验室小鼠模型中微生物多样性较低，其分类学变异是否以及如何通过功能补偿维持代谢稳态尚不清楚。研究目的：旨在阐明不同饲养设施和野生环境中，小鼠微生物群在分类学组成高度异质的情况下，其代谢输出的一致性和补偿机制。结论：研究发现，尽管实验室与野生小鼠的微生物群分类学组成存在显著差异，且菌株水平的遗传变异多局限于特定饲养设施，但它们的整体代谢潜力和实际代谢物组成却趋于一致，揭示了强大的代谢补偿机制。这种功能稳定性主要由分类学组成驱动，而非饲养环境，并且代谢物生产是多种微生物广泛协作的结果。该资源库为微生物组研究的标准化和合作提供了重要工具。