Nature Communications|使用 Orbitrap Astral 质谱仪进行快速、深入的磷酸化蛋白质组分析

本文背景聚焦于蛋白质磷酸化作为细胞功能关键调节机制的重要性，传统质谱技术虽在磷酸化肽段检测和量化方面有所进展，但仍面临位点定位、动态范围、可重复性和通量等挑战。研究目的是评估新型非对称轨道无损分析仪（Astral）结合DIA采集方法，在实现快速、深入的人类和小鼠磷酸化蛋白质组分析中的性能。通过DDA和DIA实验对比，Astral在30分钟内鉴定出12,327个磷酸肽和9,537个独特磷酸化位点，深度相当于传统120分钟方法；DIA分析显示高速度（2m/z窗口下1.5s循环时间）、高重复性（三次检测中60%稳定鉴定）和低FDR（1-5%）。结论证实Astral平台显著提升磷酸化位点鉴定深度和效率，在小鼠多组织分析中检测到81,120个独特位点（包括高比例pY位点），并揭示组织特异性磷酸化模式，如肝脏和大脑中的独特位点，为生物学机制研究提供新见解。