Genome Biol丨cRegulon：通过对组合调控建模识别细胞类型的调控单元

本文介绍了斯坦福大学和中国科学院合作开发的一种新方法cRegulon，用于从单细胞多组学数据中识别细胞类型的调控单元。背景方面，单细胞技术的进步提供了细胞类型级别的表达和表观数据，但现有方法无法识别具有通用性和可重复使用特性的调控模块。研究目的是开发能够发现这些基础调控单元的方法，用以刻画基因调控网络及其对应细胞类型的性质。结论显示，cRegulon能精确捕获不同细胞类型的标志性转录因子，识别功能一致性更高的TF模块，并成功应用于人类胎儿图谱和胚胎干细胞分化过程，揭示了调控细胞状态转换的TF模块。