J. Proteome Res .|自上向下蛋白质组学的sp3纯化凝胶样品分离

本文介绍了一种名为PEPPI-SP3的新型工作流程，结合了基于凝胶的蛋白质分离（PEPPI-MS）和固相增强样品制备（SP3）技术，用于自上向下蛋白质组学（TDP）分析。该方法通过SDS-PAGE分离蛋白质后，从聚丙烯酰胺凝胶中高效提取蛋白质，并利用羧酸修饰的磁珠纯化提取的蛋白质，有效去除污染物如考马斯亮蓝（CBB）和SDS。实验结果表明，PEPPI-SP3在低分子量蛋白质（<20 kDa）的回收率和定量准确性上显著优于传统的甲醇-氯仿沉淀（MCW）和阴离子交换纯化（FASP）方法。此外，PEPPI-SP3操作简便，适用于高通量样品处理，为蛋白质形态的深入研究提供了有力工具。