Nat Biotechnol丨何川/张理升等合作开发新的RNA修饰测序方法LIME-seq，为癌症早筛提供新思路

本文介绍了芝加哥大学何川教授团队联合多个团队开发的一种新的RNA修饰测序方法LIME-seq（Low-Input Multiple Methylation Sequencing），该方法能够检测极低起始量的RNA样本中的多种RNA修饰，如m1A、m1G、m3C、m22G等。研究发现，血浆中的循环游离RNA（cfRNA）不仅来源于人类基因组，还有20–40%来源于肠道共生菌。通过LIME-seq技术，研究团队在结直肠癌患者血浆中发现了微生物来源的cfRNA甲基化水平显著升高，并构建了一个支持向量机（SVM）分类模型，能够精准区分癌症患者与非癌个体，预测准确性达到AUC 0.98。这一技术为癌症早筛提供了新思路，并展示了在非肠道癌症中的潜在应用前景。