Cell |\u00A0消除“场效应”的膀胱癌尿液液体活检

背景：非肌层浸润性膀胱癌（NMIBC）是一种高度异质性的疾病，目前缺乏能够准确预测患者对经尿道膀胱肿瘤切除术（TURBT）及后续卡介苗（BCG）免疫治疗反应的生物标志物。尿液肿瘤DNA（utDNA）分析有望用于微小残留病灶（MRD）检测，但正常尿路上皮中存在的“场效应”体细胞突变可能导致假阳性结果，降低检测特异性。研究目的：本研究旨在开发一种能够排除场效应突变干扰的尿液液体活检方法，以提高NMIBC患者MRD检测的特异性，并识别不同治疗模式（手术或BCG治疗）的分子预测标志物。结论：研究团队开发了RePhyNERX计算框架，通过排除癌旁正常组织中存在的突变来“精炼”肿瘤突变谱，结合尿液癌症深度测序个性化分析（uCAPP-seq）技术，显著提高了MRD检测的特异性。在一个前瞻性NMIBC患者队列中，该方法成功识别出三类分子反应群体：手术应答者、BCG应答者以及无应答者，并发现不同治疗方案的预测因素存在差异。研究证实，基于场效应校正的尿液液体活检在指导个体化治疗及揭示多模式治疗中各环节生物标志物方面具有潜力。