Cancer Cell\u00A0|\u00A0肿瘤中的微生物研究有多可靠？——新算法厘清肿瘤中的微生物信号

背景：近年来，肿瘤微环境中的微生物研究成为热点，但方法学挑战显著，尤其是从人类基因组数据中准确识别低生物量下的真实微生物信号存在困难，常因污染、宿主序列干扰等问题导致结论不一。研究目的：为提升检测可靠性，美国罗格斯大学团队开发了PRISM计算框架，旨在通过整合宿主序列去除、竞争性比对和机器学习评分，实现高灵敏度、高特异性的微生物识别。结论：PRISM在TCGA和CPTAC数据中验证有效，能精准识别头颈、胃肠等特定肿瘤中的稳定微生物信号，并揭示胰腺癌内微生物与宿主分子改变及吸烟史的关联，为癌症微生物组研究提供了可靠工具，同时强调需审慎考虑技术偏倚。