Nat Biotechnol | 北京大学魏文胜团队系统揭秘人类基因组中“沉默突变”的功能性“低语”

本研究由北京大学魏文胜团队在Nature Biotechnology上发表，系统性探讨了人类基因组中同义突变的功能性效应。传统上，同义突变被认为对蛋白质功能无影响，但本研究通过构建覆盖3,644个人类蛋白编码基因的突变文库，并在人类结肠癌细胞系中进行高通量筛选，发现0.43%的同义突变显著影响细胞增殖。研究还开发了机器学习模型DS Finder，揭示了这些功能性同义突变通过破坏RNA剪接位点、改变mRNA二级结构或干扰翻译起始等机制影响基因表达。此外，研究识别出临床数据库中潜在致病意义的同义突变，如G6PC3 c.G399A，拓展了对“沉默突变”生物学功能的认知，并为人类基因功能变异研究提供了新的方法和工具。