中科院先进院马迎飞《Microbiome》:宏基因组分析揭示三种模式动物小鼠、猪、食蟹猴肠道噬菌体多样性
BioMed科技
2025-06-25 19:00
文章摘要
本研究由中国科学院深圳先进技术研究院马迎飞团队完成,发表在《Microbiome》期刊上。背景方面,研究指出小鼠、猪、食蟹猴是肠道微生物研究中常用的模式动物,但目前缺乏对其肠道噬菌体多样性的系统性研究。研究目的是通过宏基因组分析,揭示这三种模式动物肠道噬菌体的多样性及其与人类肠道微生物的关联。研究团队利用生物信息学方法,从大量宏基因组数据中挖掘出高质量病毒序列,构建了hcMGV、hcPGV、hcCMGV数据库,并发现大部分病毒序列与已知数据库相似度较低,扩展了噬菌体多样性。结论方面,研究发现食蟹猴肠道噬菌体与人类肠道微生物关联更为密切,同时揭示了crAss样噬菌体和巨型噬菌体的多样性,为未来研究提供了高质量的参考数据。
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